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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G424670
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 107877043-107877628 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

347 bp · TkA02G424670|TK1151|cDNA

AGGTCCGGGTGATAATTGTCAAATTAGCAGACAGATTACATAACATGCGGACTCTTTCACATATGCCTTCACATAAGCAGTCCAGCATTGCAATGGAGACACTACAGGTGTTTGCTCCTCTTGCAAAACTCCTTGGAATGTACCAAATTAAGTCTGAGCTTGAGAACTTGTCCTTCATGTACACAAATCCTCAAGACTATGCTAAAGTGAAGAGACGAGTTGCAGAGCTTTGTAAAGAACAGGAGAAAGAAATTGAAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

303 bp · TkA02G424670|TK1151|CDS

ATGCGGACTCTTTCACATATGCCTTCACATAAGCAGTCCAGCATTGCAATGGAGACACTACAGGTGTTTGCTCCTCTTGCAAAACTCCTTGGAATGTACCAAATTAAGTCTGAGCTTGAGAACTTGTCCTTCATGTACACAAATCCTCAAGACTATGCTAAAGTGAAGAGACGAGTTGCAGAGCTTTGTAAAGAACAGGAGAAAGAAATTGAAGAGGCAAATAAAATATTGATTAAGAAGATTGAAGATGATCAGTTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

101 aa · TkA02G424670|TK1151|PROTEIN

MRTLSHMPSHKQSSIAMETLQVFAPLAKLLGMYQIKSELENLSFMYTNPQDYAKVKRRVAELCKEQEKEIEEANKILIKKIEDDQFLDLMTVNTEVRSVCK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G424670
TK1151 IDTkA02G424670
OH-1004 IDLXL04_037088
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 11.569
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G424670
位置Chr02:107877043-107877628 (+)
描述Similar to RSH1: Putative GTP diphosphokinase RSH1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: P0DKG8 可能参与植物对病原体和其他压力的快速ppGpp（鸟苷酸3'-二磷酸5'-二磷酸）介导的反应。 暂无已核实直接文献
At4g02260 可能参与植物对病原体和其他胁迫的快速ppGpp（鸟苷3'-二磷酸5'-二磷酸）介导的应答（通过相似性推测）。
Expression profiling of four RelA/SpoT-like proteins, homologues of bacterial stringent factors, in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1007/s00425-008-0758-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0340900 可能参与植物对病原体和其他压力的快速ppGpp（鸟苷酸3'-二磷酸5'-二磷酸）介导的反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037088 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0015949 nucleobase-containing small molecule interconversion 生物过程
GO:0015969 guanosine tetraphosphate metabolic process 生物过程
GO:0015970 guanosine tetraphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0042594 response to starvation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0008728 GTP diphosphokinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G02260
bsu:BSU27600
dosa:Os03g0340900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.449
排名 1 · TkA02G424670 · TK1151
细胞核0.448
排名 2 · TkA02G424670 · TK1151
线粒体0.108
排名 3 · TkA02G424670 · TK1151
细胞膜0.058
排名 4 · TkA02G424670 · TK1151
内质网0.043
排名 5 · TkA02G424670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13328HD_41-32 aa
PF01756ACOX15-65 aa
PF18477PIN_919-95 aa
PF23938DUF727338-78 aa
PF23496Microp_apicomplexa_343-73 aa
PF13879Hmw_CFAP9748-82 aa
PF10957Spore_Cse6058-89 aa
PF13328HD_463-82 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G424670PF13328HD_41320.000122.8
TkA02G424670PF01756ACOX15650.02215.1
TkA02G424670PF18477PIN_919950.08613.8
TkA02G424670PF23938DUF727338780.1413.1
TkA02G424670PF23496Microp_apicomplexa_343730.1213.0
TkA02G424670PF13879Hmw_CFAP9748820.01616.6
TkA02G424670PF10957Spore_Cse6058890.04414.6
TkA02G424670PF13328HD_463820.000122.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0DKG8拟南芥sp|P0DKG8|RSH1L_ARATH Putative GTP diphosphokinase RSH1, chloroplastic78.200%Swiss-Prot高置信
F4JHA2拟南芥sp|F4JHA2|RSH1C_ARATH Putative GTP diphosphokinase RSH1, chloroplastic78.200%Swiss-Prot高置信
Q9AYT5水稻sp|Q9AYT5|RSH1_ORYSJ Putative GTP diphosphokinase RSH1, chloroplastic72.300%Swiss-Prot高置信

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