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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G421120
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 106926441-106933240 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5660 bp · TkA02G421120|TK1151|cDNA

ACTAAACGTCTAAGACCTACGGAAGAGTCCAACAACACCAAAAGTCCAAAACTGTAATTTACTTTTGAATTCGTCCGTTTTCCAGAACATAATATTAGCTGAGAAAATAACTGGCTCAAGTGTCATTCTTTTGTACACATAGTACTATTGGGCAAACTGTGGACCCTCAATTTCCTTCACTCGCGCACCCCTCCACTCGGCGCCACTTGCCGTCTACTACAGGGTCCATTATCTCCTAAAGACCTAAACCCTCGTCGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3774 bp · TkA02G421120|TK1151|CDS

ATGACAAACCCAAATTCAAGATCAAAAGCCTTTCATCTCCTCATACTACTATTCCTGTGTTTTATCCACCTGTGTTTCTCCAATGACACTTCATCATTGATAACTCTTCGAAAATTACTGCTTCAAAGAAAAGACGTTACATCAACATGGTTTGATTCAAACACACATCCATGTAACTGGACTGGCATAAGATGTGAAGGTTCTTCCGTTCATCAAATATCTCTCTCCTGTACATTCTCTCCACTCACTCTCCCATTCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1257 aa · TkA02G421120|TK1151|PROTEIN

MTNPNSRSKAFHLLILLFLCFIHLCFSNDTSSLITLRKLLLQRKDVTSTWFDSNTHPCNWTGIRCEGSSVHQISLSCTFSPLTLPFPKTLQEFKSLKHLNVSGCGFNGRIYSDFWTLNDLETLDLSDNRLFGVLDNNTFSSLKKLKVLVLDSNRFSGSLPETIGQLGNLTELSVKSNSFSGRLPYEIGNLDKLQSLDLSLNLFSGDLPSSLGNLSKLLFLDASHNLFTGLLFSKIGNLKKLRTLDLSMNSFGGQIPGTIG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G421120
TK1151 IDTkA02G421120
OH-1004 IDLXL04_014496
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G421120
位置Chr02:106926441-106933240 (+)
描述Similar to MSP1: Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0917500 类受体激酶，在限制进入雄性和雌性孢子发生的细胞数量方面发挥重要作用。
The MSP1 gene is necessary to restrict the number of cells entering into male and female sporogenesis and to initiate anther wall formation in rice.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012401
Os02g0194400 类受体激酶，可能在雄性和雌性孢子发生中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os09g0293500 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
Os08g0342300 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55610
ath:AT4G20140
ath:AT5G07280
dosa:Os01g0917500
dosa:Os02g0194400
osa:4324355
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.857
排名 1 · TkA02G421120 · TK1151
内质网0.086
排名 2 · TkA02G421120 · TK1151
细胞质0.063
排名 3 · TkA02G421120 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA02G421120 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkA02G421120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_227-65 aa
PF24758LRR_At5g5637070-127 aa
PF12799LRR_481-104 aa
PF13855LRR_887-104 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2189-150 aa
PF23952LRR_EndoS89-128 aa
PF23598LRR_1490-176 aa
PF12799LRR_494-128 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G421120PF08263LRRNT_227655.1e-0833.8
TkA02G421120PF24758LRR_At5g56370701273.2e-0834.2
TkA02G421120PF12799LRR_4811047.3e-36122.1
TkA02G421120PF13855LRR_8871043.7e-48161.8
TkA02G421120PF25019LRR_R13L1-DRL21891507.3e-0729.9
TkA02G421120PF23952LRR_EndoS891280.0514.5
TkA02G421120PF23598LRR_14901761.3e-36126.8
TkA02G421120PF12799LRR_4941287.3e-36122.1
TkA02G421120PF00560LRR_1951171.9e-59185.4
TkA02G421120PF13516LRR_6951077.4e-0523.2
TkA02G421120PF25013LRR_Zer-11161993e-0731.4
TkA02G421120PF14580LRR_91161960.002718.0
TkA02G421120PF23211LRR_LRWD11161792.08.8
TkA02G421120PF13516LRR_61191297.4e-0523.2
TkA02G421120PF00560LRR_11201351.9e-59185.4
TkA02G421120PF13855LRR_81201783.7e-48161.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYN8拟南芥sp|Q9LYN8|EMS1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS164.000%Swiss-Prot低置信
Q8RZV7水稻sp|Q8RZV7|MSP1_ORYSJ Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP157.900%Swiss-Prot中等置信
Q7F8Q9水稻sp|Q7F8Q9|MSL1_ORYSJ Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSL157.700%Swiss-Prot低置信
Q69JN6水稻sp|Q69JN6|BRL1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL149.700%Swiss-Prot低置信
Q6ZCZ2水稻sp|Q6ZCZ2|BRL3_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL355.100%Swiss-Prot低置信

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