TkA02G416910 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G416910

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 105965996-105967444 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1383 bp · TkA02G416910|TK1151|cDNA

ATGGTTCAAATTCAGCCTCATTTCCTTTTAGTAACATTTCCGGCCCAAGGTCACATCAACCCAGCTCTCCAATTCGCTAAACGACTCCTCCGATTGGGTGTCAAAGTCACCTTCGCCACCTGCCTCTCCGCCTATAACCGCATGGCGAAAGCTGGCCGGATTCCAGACTGTTTGAACTTTGCTGTTTTTTCAGACGGCTTTGACGACGGGTACCGGTCCAAGATCGATGATGCTTCGTTCTACCTGACTCAATTGAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1383 bp · TkA02G416910|TK1151|CDS

ATGGTTCAAATTCAGCCTCATTTCCTTTTAGTAACATTTCCGGCCCAAGGTCACATCAACCCAGCTCTCCAATTCGCTAAACGACTCCTCCGATTGGGTGTCAAAGTCACCTTCGCCACCTGCCTCTCCGCCTATAACCGCATGGCGAAAGCTGGCCGGATTCCAGACTGTTTGAACTTTGCTGTTTTTTCAGACGGCTTTGACGACGGGTACCGGTCCAAGATCGATGATGCTTCGTTCTACCTGACTCAATTGAGAAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

460 aa · TkA02G416910|TK1151|PROTEIN

MVQIQPHFLLVTFPAQGHINPALQFAKRLLRLGVKVTFATCLSAYNRMAKAGRIPDCLNFAVFSDGFDDGYRSKIDDASFYLTQLRSRGKQSLKETILSCANDGNPITCLVYTILLPWAEEVARELNVPSAVLWIQPASVFRIYYYYFNGYDKLIGDDCKDPSWSIELPGLPLLKSRDLPSFCLPSNTYNFALPLFKEQLEILDSEDRPNILVNTFDELEEDALKEINGKLKMVADGKDPSDTSFGGDLFITSKEYTEWM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G416910`
TK1151 ID	TkA02G416910
OH-1004 ID	LXL04_014525
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	47.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 95.435 / OH-1004 59.054 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G416910

位置 Chr02:105965996-105967444 (-)

描述 Similar to UGT75C1: UDP-glycosyltransferase 75C1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g15550`	葡萄糖基化山奈酚的葡萄糖基转移酶。	Arabidopsis glucosyltransferases with activities toward both endogenous and xenobiotic substrates.2003 · DOI: 10.1007/s00425-002-0969-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014525 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009787 regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009835 fruit ripening 生物过程

GO:0009845 seed germination 生物过程

GO:0043473 pigmentation 生物过程

GO:0080148 negative regulation of response to water deprivation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0008194 UDP-glycosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:BAA36421

ag:BAA36423

ag:BAK55736

mdm:103443397

sly:101250450

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.702

排名 1 · TkA02G416910 · TK1151

细胞核0.211

排名 2 · TkA02G416910 · TK1151

内质网0.088

排名 3 · TkA02G416910 · TK1151

质体0.070

排名 4 · TkA02G416910 · TK1151

过氧化物酶体0.066

排名 5 · TkA02G416910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168Glyco_transf_N10-50 aa

PF03033Glyco_transf_2816-41 aa

PF00201UDPGT253-385 aa

PF06722EryCIII-like_C338-410 aa

PF04101Glyco_tran_28_C342-382 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G416910	`PF26168`	Glyco_transf_N	10	50	0.00079	20.1
TkA02G416910	`PF03033`	Glyco_transf_28	16	41	0.2	12.4
TkA02G416910	`PF00201`	UDPGT	253	385	1.1e-28	101.1
TkA02G416910	`PF06722`	EryCIII-like_C	338	410	0.00091	19.9
TkA02G416910	`PF04101`	Glyco_tran_28_C	342	382	0.18	12.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23406`	拟南芥	sp\|O23406\|U75D1_ARATH UDP-glycosyltransferase 75D1	51.600%	Swiss-Prot	高置信

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