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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G410600
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 104394989-104405762 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

799 bp · TkA02G410600|TK1151|cDNA

GTTAGATGCGACCTCCCGACCTCCGCTTTGTACAAAATTTTGCAGTCTCCTTCCATTATTCCATATCTCCAGTTCAACAAGTTCGTGTATTTTGGCAAAAGTTTACAAAAAGAGAGGGCAAATCTGTGAGCAAAAGAGATGACAGAGGCATCAATCAGGAACAAGCCAGGAATGGCGAGCGTCAAAGACATGCCACTCCTCCAAGATGGTCCTCCTCCTGGCGGATTTGCGCCGGTTCGGTACGCGCGGAGGATCCCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · TkA02G410600|TK1151|CDS

ATGAAAGGCCTAATTCTTCATCAAACACCAGTATTGGTGTTATCGAATGCAAGACCGAAGCTTCCTTTGTTGGCATCTTCAGATTCTTCGCCTTTCTATACTGATTTATCCACAAGAATCACATGTTCGTCCTCTTCATCATCATCATTACATAGCCGAGATTTATTGAAACCATACTTACCAGGCAACAAAGTTACAGCAAATGCATTAAATATTGGTGCTAGCTCTGAAGGATATGAAGAGAGAGACGGAAATGACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

361 aa · TkA02G410600|TK1151|PROTEIN

MKGLILHQTPVLVLSNARPKLPLLASSDSSPFYTDLSTRITCSSSSSSSLHSRDLLKPYLPGNKVTANALNIGASSEGYEERDGNDNQNLSTNDQTSESSSIKKLPEQIPYPVSIGLVLSACALVFSIIAFTKGAPSSLLAAIAKSGFTAAFTLIFVSEIGDKTFFIAALLAMQYEKGLVILGSMGALSLMTVLSVVIGRIFNSVPAQFQTTLPIGEYAAVTLLMFFGLKAIKDAWDLPSSNAKNGEKNGNELDEYAEAE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G410600
TK1151 IDTkA02G410600
OH-1004 IDLXL04_014591
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G410600
位置Chr02:104394989-104405762 (-)
描述Similar to PAM71-HL: Protein PAM71-homolog, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g13590 可能定位于叶绿体的Mn²⁺/H⁺和/或Ca²⁺/H⁺反向转运蛋白，调节Ca²⁺、Mn²⁺和pH稳态。 暂无已核实直接文献
At1g04630 线粒体膜呼吸链NADH脱氢酶（复合体 I）的辅助亚基，据信不参与催化。 暂无已核实直接文献
At2g33220 线粒体膜呼吸链NADH脱氢酶（复合体 I）的辅助亚基，据信不参与催化。 暂无已核实直接文献
At1g64150 Mn²⁺/H⁺交换器，将Mn²⁺从叶绿体基质运输到酸性类囊体腔。
The Evolutionarily Conserved Protein PHOTOSYNTHESIS AFFECTED MUTANT71 Is Required for Efficient Manganese Uptake at the Thylakoid Membrane in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1105/tpc.15.00812
A Putative Chloroplast-Localized Ca(2+)/H(+) Antiporter CCHA1 Is Involved in Calcium and pH Homeostasis and Required for PSII Function in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1016/j.molp.2016.05.015

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0544500 GDT1样蛋白2，叶绿体类。 暂无已核实直接文献
Os01g0221700 GDT1样蛋白1，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AAM2 GDT1样蛋白1，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014591 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0010270 photosystem II oxygen evolving complex assembly 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0032468 Golgi calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0032472 Golgi calcium ion transport 生物过程
GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0071421 manganese ion transmembrane transport 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64150
ath:AT4G13590
dosa:Os11g0544500
osa:9272318
syn:sll0615
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.985
排名 1 · TkA02G410600 · TK1151
线粒体0.019
排名 2 · TkA02G410600 · TK1151
细胞质0.015
排名 3 · TkA02G410600 · TK1151
细胞核0.014
排名 4 · TkA02G410600 · TK1151
过氧化物酶体0.014
排名 5 · TkA02G410600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01169GDT1148-236 aa
PF01169GDT1278-358 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G410600PF01169GDT11482364.2e-41139.8
TkA02G410600PF01169GDT12783584.2e-41139.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T0H9拟南芥sp|Q9T0H9|PA71H_ARATH Protein PAM71-homolog, chloroplastic73.200%Swiss-Prot高置信
Q8RWA7拟南芥sp|Q8RWA7|NDADA_ARATH NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A83.900%Swiss-Prot高置信
O49313拟南芥sp|O49313|NDADB_ARATH NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-B83.900%Swiss-Prot高置信
Q94AX5拟南芥sp|Q94AX5|PAM71_ARATH Protein PAM71, chloroplastic48.600%Swiss-Prot中等置信
Q2R2Z4水稻sp|Q2R2Z4|GDT12_ORYSJ GDT1-like protein 2, chloroplastic66.100%Swiss-Prot高置信
Q5NAY7水稻sp|Q5NAY7|GDT11_ORYSJ GDT1-like protein 1, chloroplastic46.400%Swiss-Prot中等置信
B8AAM2水稻sp|B8AAM2|GDT11_ORYSI GDT1-like protein 1, chloroplastic46.400%Swiss-Prot中等置信

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