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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G406390
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 103322851-103325363 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1774 bp · TkA02G406390|TK1151|cDNA

ATATTATTTTACATAAATTTTTTACACATTTAAATTTTTTACAAAACACTTTTACAGAAGTAAAAGAACGACTTCGCTTCCAACTTGTAGTTTTGCCGAACAAAGATCGGGCATGCTTTGGGGACAATACAAGTAGGCTGCTAAAGAACATTCGTTTATTTAGAGAGAGAAACAAAACCCTAAATTTCCACGCTTTCCATCAATCATCTCCCAGAAATCTCGGTGATTCTGGTTCAATTTAGGTCTAGGCTTATCTTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1212 bp · TkA02G406390|TK1151|CDS

ATGTCGGATACTGAGAAAAACGCCCTTGTTAACTCACCAACGAGCTCCCGGTCGGTCACGGAGACAGTAAACGGCTCTCACCATTTCGTTATACAGGGTTATTCCTTAGCCAAAGGTATGGGAATCGGAAAACACATCGCTAGCGATAATTTTACGGTCGGAGGCTATCAATGGGCTGTATACTTCTACCCCGATGGGAAAAATCCTGAAGACAATTCGACATATGTTTCTGTCTTCATTGCACTTGCCAGCGAGGGCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

403 aa · TkA02G406390|TK1151|PROTEIN

MSDTEKNALVNSPTSSRSVTETVNGSHHFVIQGYSLAKGMGIGKHIASDNFTVGGYQWAVYFYPDGKNPEDNSTYVSVFIALASEGTDVRALFELTLVDQSGKGKHKIHSHFDRSLESGPYTLKYRGSMWGYKRFYRRALLETSDYLKDDCLRINCTVGVVVSAVDCSSLHSIKVPESDIGSHFGTLLDNKEGSDIIFNVSGQKFHAHKLVLAARSPVFRSRFFKQDEEHEHEIDVTDMEPKVFKAMLHFIYRDAVMEDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G406390
TK1151 IDTkA02G406390
OH-1004 IDLXL04_014652
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G406390
位置Chr02:103322851-103325363 (-)
描述Similar to BPM4: BTB/POZ and MATH domain-containing protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g03740 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At3g43700 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g21010 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At3g06190 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g19000 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0071472 cellular response to salt stress 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G03740
ath:AT3G06190
ath:AT3G43700
ath:AT5G19000
ath:AT5G21010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.642
排名 1 · TkA02G406390 · TK1151
细胞质0.415
排名 2 · TkA02G406390 · TK1151
细胞膜0.122
排名 3 · TkA02G406390 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA02G406390 · TK1151
线粒体0.026
排名 5 · TkA02G406390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22486MATH_227-158 aa
PF00917MATH47-158 aa
PF21355TRAF-mep_MATH48-154 aa
PF24570BACK_BPM_SPOP146-153 aa
PF00651BTB186-302 aa
PF02214BTB_2197-255 aa
PF07707BACK238-256 aa
PF24570BACK_BPM_SPOP277-295 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G406390PF22486MATH_2271589.8e-31107.5
TkA02G406390PF00917MATH471580.002618.7
TkA02G406390PF21355TRAF-mep_MATH481542.5e-0525.4
TkA02G406390PF24570BACK_BPM_SPOP1461531.3e-1661.2
TkA02G406390PF00651BTB1863024.2e-2692.0
TkA02G406390PF02214BTB_21972550.1812.9
TkA02G406390PF07707BACK2382560.001519.3
TkA02G406390PF24570BACK_BPM_SPOP2772951.3e-1661.2
TkA02G406390PF07707BACK2803030.001519.3
TkA02G406390PF26017BACK_BTBD83053600.212.7
TkA02G406390PF00651BTB3073344.2e-2692.0
TkA02G406390PF24570BACK_BPM_SPOP3083591.3e-1661.2
TkA02G406390PF21872SAM_53103610.03314.7
TkA02G406390PF07707BACK3123490.001519.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SRV1拟南芥sp|Q9SRV1|BPM4_ARATH BTB/POZ and MATH domain-containing protein 472.600%Swiss-Prot高置信
A1L4W5拟南芥sp|A1L4W5|BPM6_ARATH BTB/POZ and MATH domain-containing protein 666.200%Swiss-Prot高置信
Q1EBV6拟南芥sp|Q1EBV6|BPM5_ARATH BTB/POZ and MATH domain-containing protein 566.200%Swiss-Prot高置信
Q9M8J9拟南芥sp|Q9M8J9|BPM2_ARATH BTB/POZ and MATH domain-containing protein 257.800%Swiss-Prot高置信
Q8L765拟南芥sp|Q8L765|BPM1_ARATH BTB/POZ and MATH domain-containing protein 155.900%Swiss-Prot高置信

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