RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G406010
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 103183528-103187083 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1943 bp · TkA02G406010|TK1151|cDNA

GAAAGACTCTCTTATTATTTAAAGTTGAAGCAGGTACATGTTACATCTCAGCACACATGGGACCCGATGTGGAGGGTGTCAGATCATATTTGGATGTTGTTGGACGGCATGATAAACAACGACAACAAAGGCTGCATCATCGATTATCCTCTTACCTAACAAATCATACTTCCCAACAATCTTCTGTTGTCTACCATCATTCAAACTTTCTTCTGTTTCTCTGCTCCTTCTCAATTTCACTGAATCCAGTTGTTTCGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1320 bp · TkA02G406010|TK1151|CDS

ATGAGTACTCCCAAAATCAAGCGTAGAGTGGGTAAATACGAGATGGGAAGAACAATCGGTGAGGGAACTTTTGCGAAAGTGAAGTTTGCTAGGAATTCTGAAACTGGGGAACCTGTGGCTATTAAGATCCTTGACAAAGAAAAAGTTGTTAAACACAAAATGGCTGAACAGATAAAAATGGAAATAGCTACAATGAAGTTGATAAAGCATCCAAATGTCGTCCGCTTATACGAGGTTATGGGGAGCAAGACCAAGATATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

439 aa · TkA02G406010|TK1151|PROTEIN

MSTPKIKRRVGKYEMGRTIGEGTFAKVKFARNSETGEPVAIKILDKEKVVKHKMAEQIKMEIATMKLIKHPNVVRLYEVMGSKTKIFIILEFVTGGELFDKIVNHGRMHEDEARKYFQQLINAVDYCHSRGVYHRDLKPENLLLDASGNLKVSDFGLSAVSRQVRDDGLLHTTCGTPNYVAPEVLNDRGYDGATADLWSCGVILFVLLAGYLPFDDSNLMNLYKKISAAEFTCPPWISFSAIKLITRILDPNPMTRITVT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G406010
TK1151 IDTkA02G406010
OH-1004 IDLXL04_031095
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.811 / OH-1004 95.312
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G406010
位置Chr02:103183528-103187083 (-)
描述Similar to CIPK8: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26980 可能通过调控冷和盐诱导基因的表达，参与幼苗的盐及高渗胁迫响应。
CIPK3, a calcium sensor-associated protein kinase that regulates abscisic acid and cold signal transduction in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.006858
At5g21326 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
The Calcineurin B-like calcium sensors CBL1 and CBL9 together with their interacting protein kinase CIPK26 regulate the Arabidopsis NADPH oxidase RBOHF.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst009

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0132200 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os11g0134300 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os03g0319400 参与耐寒应激。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031095 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24400
ath:AT5G35410
dosa:Os01g0536000
dosa:Os06g0606000
dosa:Os07g0150700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522
排名 1 · TkA02G406010 · TK1151
细胞核0.412
排名 2 · TkA02G406010 · TK1151
细胞膜0.272
排名 3 · TkA02G406010 · TK1151
高尔基体0.050
排名 4 · TkA02G406010 · TK1151
内质网0.048
排名 5 · TkA02G406010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase13-268 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr14-264 aa
PF14531Kinase-like16-72 aa
PF03109ABC119-69 aa
PF14303NAM-associated43-57 aa
PF01636APH52-123 aa
PF03109ABC154-160 aa
PF06293Kdo78-149 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G406010PF00069Pkinase132681.2e-75255.0
TkA02G406010PF07714PK_Tyr_Ser-Thr142642.4e-37129.4
TkA02G406010PF14531Kinase-like16724.5e-0730.1
TkA02G406010PF03109ABC119696.7e-0522.9
TkA02G406010PF14303NAM-associated43578.9e-0730.6
TkA02G406010PF01636APH521230.06513.7
TkA02G406010PF03109ABC1541606.7e-0522.9
TkA02G406010PF06293Kdo781490.003617.5
TkA02G406010PF14531Kinase-like1072164.5e-0730.1
TkA02G406010PF01636APH1211560.06513.7
TkA02G406010PF14303NAM-associated2714198.9e-0730.6
TkA02G406010PF03822NAF3083672.6e-2485.8
TkA02G406010PF02149KA13974240.02215.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q2V452拟南芥sp|Q2V452|CIPK3_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 381.600%Swiss-Prot高置信
Q84VQ3拟南芥sp|Q84VQ3|CIPKQ_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2677.800%Swiss-Prot高置信
Q2QY53水稻sp|Q2QY53|CIPKW_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 3282.900%Swiss-Prot高置信
Q2RAX3水稻sp|Q2RAX3|CIPKX_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 3380.000%Swiss-Prot高置信
Q6X4A2水稻sp|Q6X4A2|CIPKV_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 3174.400%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看