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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G402950
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 102337412-102341194 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3621 bp · TkA02G402950|TK1151|cDNA

AAAGCGTTGCTGCTTTTCGCTATCGGTGTTCGATACATACGGCCACCGATAGAAGTCAAGTCACATCTCCCGGGGTTACATCGCTTTCTTAGCATTCCACTCCCAGTTGCTATGCACTAATTTCACTCACCAACCTTCTAGCTGTTTCATTTCCTCCTCCAAATCCATCGCTTTACCATATTCATCAACACTTTGCTCTGTCGGAAGCTATAATTCTTGGTTATGCACATTGCCCAAGCAAATTATCTCAGTTATCCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2907 bp · TkA02G402950|TK1151|CDS

ATGCAGACTATGTGTTTGATTATACTACTACTTGCTAAATTGGTAGCCGGAACAACAGAATTGGATTCACTTTTGGAGGTAAAAAGGGGCATTCAGGAGGATTCTTCCGGTAAAGTTTTAAGTTCATGGGATCCCAAATCCTTGTCATCAAACGGTTGCCCCCTTCAATGGTACGGCGTGACCTGTACCAGTGGCCATGTGACCTCCCTGATGCTTAATAATTTAGGTCTAGTCGGGACCTTTTCTTTTGCTTCAATTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

968 aa · TkA02G402950|TK1151|PROTEIN

MQTMCLIILLLAKLVAGTTELDSLLEVKRGIQEDSSGKVLSSWDPKSLSSNGCPLQWYGVTCTSGHVTSLMLNNLGLVGTFSFASITGLINLHNFSISNNRFDGIISKEVGSIASLEYLDISSNSFHGPLPTEITNSRRLVHLNLSLNNLEGTVPSGFEYLKQLQYLDLHSNTFSGKVMDLLSQLGSIIYLDLSSNGFIGTLDLGLGSEKFVSAIKYLNVSHNNLDGVLFSHDGMPYFDNLEVFDASNNQFVGIIPSFNF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G402950
TK1151 IDTkA02G402950
OH-1004 IDLXL04_014715
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G402950
位置Chr02:102337412-102341194 (-)
描述Similar to GHR1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GHR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g20940 受体激酶作为脱落酸 信号传导的早期成分。
A plasma membrane receptor kinase, GHR1, mediates abscisic acid- and hydrogen peroxide-regulated stomatal movement in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.100107
A Dominant Mutation in the HT1 Kinase Uncovers Roles of MAP Kinases and GHR1 in CO2-Induced Stomatal Closure.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00131
Coordinating the overall stomatal response of plants: Rapid leaf-to-leaf communication during light stress.2018 · DOI: 10.1126/scisignal.aam9514
The Receptor-like Pseudokinase GHR1 Is Required for Stomatal Closure.2018 · DOI: 10.1105/tpc.18.00441
At5g10020 可能失活的受体激酶 At5g10020。 暂无已核实直接文献
At3g56100 能磷酸化 AGL24。 暂无已核实直接文献
At3g24660 似乎没有保守的激酶活性。 暂无已核实直接文献
At1g50610 受体样激酶参与花粉萌发和花粉管极性生长的控制。
GRIM REAPER peptide binds to receptor kinase PRK5 to trigger cell death in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.15252/embj.201488582

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014715 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009745 sucrose mediated signaling 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程
GO:0071485 cellular response to absence of light 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:1905392 plant organ morphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51740
ath:AT4G20940
ath:AT5G10020
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.868
排名 1 · TkA02G402950 · TK1151
内质网0.082
排名 2 · TkA02G402950 · TK1151
细胞质0.067
排名 3 · TkA02G402950 · TK1151
细胞核0.052
排名 4 · TkA02G402950 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA02G402950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_219-63 aa
PF13855LRR_869-125 aa
PF23598LRR_1473-192 aa
PF00560LRR_191-111 aa
PF12799LRR_491-124 aa
PF24048LRR_NXF1-5114-153 aa
PF00560LRR_1115-136 aa
PF13516LRR_6115-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G402950PF08263LRRNT_219631.3e-0732.5
TkA02G402950PF13855LRR_8691251.5e-2279.9
TkA02G402950PF23598LRR_14731929e-0935.3
TkA02G402950PF00560LRR_1911111.6e-38123.1
TkA02G402950PF12799LRR_4911248.5e-2174.2
TkA02G402950PF24048LRR_NXF1-51141530.8510.0
TkA02G402950PF00560LRR_11151361.6e-38123.1
TkA02G402950PF13516LRR_61151252.9e-0730.7
TkA02G402950PF13855LRR_81381971.5e-2279.9
TkA02G402950PF12799LRR_41391738.5e-2174.2
TkA02G402950PF00560LRR_11401611.6e-38123.1
TkA02G402950PF13516LRR_61401512.9e-0730.7
TkA02G402950PF00560LRR_11631851.6e-38123.1
TkA02G402950PF13516LRR_61641752.9e-0730.7
TkA02G402950PF00560LRR_11882061.6e-38123.1
TkA02G402950PF12799LRR_41892258.5e-2174.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGQ9拟南芥sp|C0LGQ9|GHR1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GHR143.500%Swiss-Prot中等置信
Q0WR59拟南芥sp|Q0WR59|Y5020_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g1002039.000%Swiss-Prot低置信
C0LGP9拟南芥sp|C0LGP9|IMK3_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK337.000%Swiss-Prot低置信
P33543拟南芥sp|P33543|TMKL1_ARATH Putative kinase-like protein TMKL131.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LPT1拟南芥sp|Q9LPT1|PRK5_ARATH Pollen receptor-like kinase 534.500%Swiss-Prot低置信

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