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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G400370
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 101677333-101683910 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4094 bp · TkA02G400370|TK1151|cDNA

AAAAACCCTACCCATCCAAACTCATTCAGCCTACACCCTTTTGTTTTGAATTGAGCGACGCCTCCATCGCCTGCTTCGCTTCTTCCGCTTCGCCATCATAGACATTCGTTTTTCTCAAAAAGCTTAAAACTCCACACTGGGTTTAAAACTGGATCTTTGCGACAAAACATTGAAAAACGAGAGAGCTGTTTGCGGCTTCAAATTAGGGTTCGTTCTTCCAGCTTCCGATTTTGCAAGGGTGATTTTCACTTGTCAGCTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

3552 bp · TkA02G400370|TK1151|CDS

ATGGAGCGATCTCAGAAGTCTCATAGGTCTCGTCAATCTGGCCCTTCAGCCAAGAAGAAATCCGATAATGATAAGAGGAAACGTGGCCTCATTGAAGAGAAGCCTGATAAGACCAAAGAAAACAAATCCGATACTGATAAGAAGAAACGCGTCCCCACCAAAGAGAAGAACCAAAACCCTAAGGCATTCGCGTTTAATTCAACTGTGAAAGCTAAACGTCTACAGTCGCGGGCTTCAGAGAAAGAGCAGCGCCGCCTCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1183 aa · TkA02G400370|TK1151|PROTEIN

MERSQKSHRSRQSGPSAKKKSDNDKRKRGLIEEKPDKTKENKSDTDKKKRVPTKEKNQNPKAFAFNSTVKAKRLQSRASEKEQRRLHIPTIDRNTGEPAPYVIVVHGPPQVGKSLLIKSLVKHYTKHNIPDVRGPITIVSGKQRRLQFVECPNDINGMIDAAKFADLALVLIDGSYGFEMETFEFLNIMQVHGFPKVMGVLTHLDKFKDVKKLKKTKQRLKHRFWTEIYDGAKLFYLSGLIHGKYVKREVHNLARFISVM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G400370
TK1151 IDTkA02G400370
OH-1004 IDLXL04_014739
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G400370
位置Chr02:101677333-101683910 (+)
描述Similar to bms1: Ribosome biogenesis protein bms1 (Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014739 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000472 endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000479 endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000480 endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0030490 maturation of SSU-rRNA 生物过程
GO:0042255 ribosome assembly 生物过程
GO:0042274 ribosomal small subunit biogenesis 生物过程
GO:2000232 regulation of rRNA processing 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
hsa:642517
hsa:9790
sce:YPL217C
spo:2540390
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.903
排名 1 · TkA02G400370 · TK1151
细胞质0.142
排名 2 · TkA02G400370 · TK1151
线粒体0.030
排名 3 · TkA02G400370 · TK1151
细胞膜0.021
排名 4 · TkA02G400370 · TK1151
内质网0.010
排名 5 · TkA02G400370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04950RIBIOP_C22-59 aa
PF01637ATPase_292-127 aa
PF13191AAA_1693-142 aa
PF13401AAA_22101-154 aa
PF13173AAA_14101-127 aa
PF01926MMR_HSR1103-189 aa
PF00910RNA_helicase103-128 aa
PF00004AAA104-173 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G400370PF04950RIBIOP_C22594.2e-86289.7
TkA02G400370PF01637ATPase_2921270.02215.3
TkA02G400370PF13191AAA_16931420.001819.5
TkA02G400370PF13401AAA_221011540.004817.9
TkA02G400370PF13173AAA_141011270.09613.4
TkA02G400370PF01926MMR_HSR11031890.03415.0
TkA02G400370PF00910RNA_helicase1031280.06514.5
TkA02G400370PF00004AAA1041730.008217.3
TkA02G400370PF00009GTP_EFTU1412334.7e-0523.8
TkA02G400370PF22298Tsr1_G-like1432208e-0523.2
TkA02G400370PF08142AARP2CN2613342.2e-2898.4
TkA02G400370PF04950RIBIOP_C71110244.2e-86289.7
TkA02G400370PF01637ATPase_27158380.02215.3
TkA02G400370PF08142AARP2CN7737922.2e-2898.4
TkA02G400370PF00910RNA_helicase8548890.06514.5
TkA02G400370PF22298Tsr1_G-like110811558e-0523.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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