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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G399380
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 101433714-101437640 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1914 bp · TkA02G399380|TK1151|cDNA

GTTGTAAATATTGTTATTGGCATTTGGCCCCGGGTACTGCCGCATCCGCCTTTCCTAATTCTGTGACGCGACCGTCTCCTTTGTTCACAAACTGCAAACCCCTCGTAACCCCCTATTCCTCTATTCCTCAGCCACGAACCAGCTTGACAGCTTGTAGAGATGGATTTTCAAGTGGTCGTATTGGCAGGAGGCACTTCGAAGAAGCTTGCCCCTCTTGTTTCCAAGGACGTTCCCAAATCGCTACTCCCAGTTGCGAACCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1383 bp · TkA02G399380|TK1151|CDS

ATGGATTTTCAAGTGGTCGTATTGGCAGGAGGCACTTCGAAGAAGCTTGCCCCTCTTGTTTCCAAGGACGTTCCCAAATCGCTACTCCCAGTTGCGAACCGTCCAGTGTTATCGTACGTTTTGGAGCTACTGGAACAGAGTAATCTCAAAGATCTTATTGTTGTTGTGGAAGGGGAAGACACAGATGGTCTTGTTGAAAATTGGATATCAGAGGCTTATGTCGATCGATTACATGTTCAGGTTGCTTCTGTCCCAGAGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

460 aa · TkA02G399380|TK1151|PROTEIN

MDFQVVVLAGGTSKKLAPLVSKDVPKSLLPVANRPVLSYVLELLEQSNLKDLIVVVEGEDTDGLVENWISEAYVDRLHVQVASVPEEVGTAGALRAIAHHLTASDILVVSGDLVCDISPGAVAAAHRRHDAVVTAMLCSVPVSGTQDSASSGGKDKTKKPGKFNIVGLDLTQQFLLYIAAGIDVEKDLRVQKNILRAVGKMEIRADLMDAHLYAFKRSVLQQVLNQKQSFRSLKQDVVPYLVKSQLRSEILFNGGGQVEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G399380
TK1151 IDTkA02G399380
OH-1004 IDLXL04_014758
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G399380
位置Chr02:101433714-101437640 (+)
描述Similar to eif2b3: Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014758 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002183 cytoplasmic translational initiation 生物过程
GO:0006412 translation 生物过程
GO:0006413 translational initiation 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0043434 response to peptide hormone 生物过程
GO:0045948 positive regulation of translational initiation 生物过程
GO:0050852 T cell receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005851 eukaryotic translation initiation factor 2B complex 细胞组分
GO:0003743 translation initiation factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ddi:DDB_G0290693
hsa:8891
rno:171145
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.527
排名 1 · TkA02G399380 · TK1151
细胞核0.320
排名 2 · TkA02G399380 · TK1151
高尔基体0.109
排名 3 · TkA02G399380 · TK1151
细胞膜0.080
排名 4 · TkA02G399380 · TK1151
溶酶体／液泡0.078
排名 5 · TkA02G399380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00483NTP_transferase5-143 aa
PF12804NTP_transf_35-128 aa
PF00535Glycos_transf_233-135 aa
PF25084LbH_EIF2B177-205 aa
PF00483NTP_transferase208-252 aa
PF25084LbH_EIF2B316-341 aa
PF25087GMPPB_C324-346 aa
PF00132Hexapep325-340 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G399380PF00483NTP_transferase51431.6e-1764.6
TkA02G399380PF12804NTP_transf_351289.3e-1246.1
TkA02G399380PF00535Glycos_transf_2331350.0414.6
TkA02G399380PF25084LbH_EIF2B1772058.8e-2174.6
TkA02G399380PF00483NTP_transferase2082521.6e-1764.6
TkA02G399380PF25084LbH_EIF2B3163418.8e-2174.6
TkA02G399380PF25087GMPPB_C3243462.4e-1350.5
TkA02G399380PF00132Hexapep3253404.1e-1142.8
TkA02G399380PF24894Hexapep_GlmU3303642.4e-0834.8
TkA02G399380PF25087GMPPB_C3504402.4e-1350.5
TkA02G399380PF00132Hexapep3513774.1e-1142.8
TkA02G399380PF25247LbH_GLGC3513790.0002721.6
TkA02G399380PF25084LbH_EIF2B3564488.8e-2174.6
TkA02G399380PF07959Fucose_pyrophosphorylase3614400.0009818.9
TkA02G399380PF16314DUF49543634070.03813.3
TkA02G399380PF14602Hexapep_23643780.04414.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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