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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G397950
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 101103807-101105357 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1362 bp · TkA02G397950|TK1151|cDNA

ATGGATTTGGTATTTAGAGCAGCCAGACGGGAGATCAATTACGTTTGGTATTGCACCAAAAACGTTGACAAATTAAGAAATGAATCTCAAAAGCTCAAAGATATGAAGGCCATTCTTGAACGTCGAATCAATACAGCACAAGAAAAAGGAGAACTTCTCTTAGATGGTGTGCAAATCTGGATAAAAAACACAGACACTGAATTATCCACAGTCGCGAAGTTTCTTGAAGAAGAAGCTACCGCCAAAAAGACATGCTTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1362 bp · TkA02G397950|TK1151|CDS

ATGGATTTGGTATTTAGAGCAGCCAGACGGGAGATCAATTACGTTTGGTATTGCACCAAAAACGTTGACAAATTAAGAAATGAATCTCAAAAGCTCAAAGATATGAAGGCCATTCTTGAACGTCGAATCAATACAGCACAAGAAAAAGGAGAACTTCTCTTAGATGGTGTGCAAATCTGGATAAAAAACACAGACACTGAATTATCCACAGTCGCGAAGTTTCTTGAAGAAGAAGCTACCGCCAAAAAGACATGCTTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

453 aa · TkA02G397950|TK1151|PROTEIN

MDLVFRAARREINYVWYCTKNVDKLRNESQKLKDMKAILERRINTAQEKGELLLDGVQIWIKNTDTELSTVAKFLEEEATAKKTCFNSRPSILNLYERKNLDDINTHKLTLKEILTALADDSVQIVGIYGLGGVGKTTLAKEVATEVRNLYADIVFITVSQTVDGKVIQEKVEAAAKRIIIGEKVLIILDDMWEYVELSEVGIPCGNSHMNCKILLTSRSKNVCESMNVQSNICVKTLKKDEAWVLFKRVVGERLETDIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G397950
TK1151 IDTkA02G397950
OH-1004 IDLXL04_014775
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.702 / OH-1004 48.808
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G397950
位置Chr02:101103807-101105357 (-)
描述Similar to At4g27190: Disease resistance protein At4g27190
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27190 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g15890 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g05400 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g12290 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014775 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12290
ath:AT1G61180
ath:AT1G61190
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.383
排名 1 · TkA02G397950 · TK1151
细胞质0.319
排名 2 · TkA02G397950 · TK1151
内质网0.169
排名 3 · TkA02G397950 · TK1151
细胞核0.123
排名 4 · TkA02G397950 · TK1151
细胞外0.062
排名 5 · TkA02G397950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13173AAA_1420-60 aa
PF13207AAA_1720-87 aa
PF13238AAA_1822-56 aa
PF09386ParD24-48 aa
PF13401AAA_2228-61 aa
PF13191AAA_1630-68 aa
PF00005ABC_tran47-74 aa
PF20720nSTAND364-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G397950PF13173AAA_1420602.8e-0524.9
TkA02G397950PF13207AAA_1720870.003518.3
TkA02G397950PF13238AAA_1822560.05714.6
TkA02G397950PF09386ParD24480.3112.2
TkA02G397950PF13401AAA_2228610.01416.4
TkA02G397950PF13191AAA_1630680.0003521.9
TkA02G397950PF00005ABC_tran47740.0914.1
TkA02G397950PF20720nSTAND3641090.01415.8
TkA02G397950PF13238AAA_1869970.05714.6
TkA02G397950PF00154RecA_N911690.006516.7
TkA02G397950PF05970PIF11091630.01615.5
TkA02G397950PF00931NB-ARC1102531.9e-29103.2
TkA02G397950PF01637ATPase_21101771.8e-0731.9
TkA02G397950PF13191AAA_161111490.0003521.9
TkA02G397950PF25201nSTAND61111640.001919.0
TkA02G397950PF25199nSTAND_NTPase51122210.0005920.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T048拟南芥sp|Q9T048|DRL27_ARATH Disease resistance protein At4g2719035.600%Swiss-Prot中等置信
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722032.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LMP6拟南芥sp|Q9LMP6|DRL3_ARATH Probable disease resistance protein At1g1589029.800%Swiss-Prot低置信
Q9FLB4拟南芥sp|Q9FLB4|DRL31_ARATH Putative disease resistance protein At5g0540029.300%Swiss-Prot低置信
P60839拟南芥sp|P60839|DRL2_ARATH Probable disease resistance protein At1g1229029.400%Swiss-Prot低置信

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