TkA02G397240 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G397240

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 100889082-100893137 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1859 bp · TkA02G397240|TK1151|cDNA

GTACCCCGAATCAAAATTTCTGGTTCAGCCACTGCCCACGTGAACAATGTTGTTATAAAAGGTTGAGCTGATTTCGAACCACACTTTCAGAAATTCCATTTTATACAAATCGCGACTGGGTTTTCTCGAATCTCCGGCACAGGCACTCGAACTATCATTACGGTCTCAATTCTCTCTCCGATCAAACAGCCATGAAACGTGGGAATGTTAACTCTAAAGGGAATTTACATAATTTATCACAGGAAAACGGTTCAAAAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1566 bp · TkA02G397240|TK1151|CDS

ATGAAACGTGGGAATGTTAACTCTAAAGGGAATTTACATAATTTATCACAGGAAAACGGTTCAAAAGATTTCCTTCCTCTTGGAAACCTAGAAAAAGCTGTAAACGAAATGGTTGACCAGCCTCTTGTTGAAGGCAAAATTGAAGATGATCTTATTGAGTTTTCAGATGCCATGAGAACTGTTGGCAAGGTTTTAAGACAAGCAGCAGAAGCCAAAGCTGCAGCTCAAGCTGAAGCCACGGAATGGAAACGGAAATATGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

521 aa · TkA02G397240|TK1151|PROTEIN

MKRGNVNSKGNLHNLSQENGSKDFLPLGNLEKAVNEMVDQPLVEGKIEDDLIEFSDAMRTVGKVLRQAAEAKAAAQAEATEWKRKYEEERERNRNRNLHLEQKGPSLFEHEVDSIQQIQIPETCEKSQTCCGENGICSHEVLRDRERDSYPNVHNKMTRKASFKLQWCSKSKKDDQHKHDIVSFEKGNITTAERSSKQISLKWETPPQTVLILTKPNSTSVKILCAEMVRWLKEKKRLNIFVEPRVRNELLEESEYYSFA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G397240`
TK1151 ID	TkA02G397240
OH-1004 ID	LXL04_014786
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	95.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G397240

位置 Chr02:100889082-100893137 (-)

描述 Similar to NADK1: NAD(H) kinase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g21070`	能磷酸化 NAD(+) 和 NADH，对 NADH 有两倍的偏好。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0957000`	可能的 NAD 激酶 1。	暂无已核实直接文献
`Os05g0388400`	推测的NAD激酶3。	暂无已核实直接文献
`Os11g0191400`	参与叶绿素合成并保护叶绿体免受氧化损伤。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014786 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006741 NADP+ biosynthetic process 生物过程

GO:0019674 NAD+ metabolic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0003951 NAD+ kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0042736 NADH kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G21640

ath:AT3G21070

dosa:Os01g0957000

dosa:Os11g0191400

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.556

排名 1 · TkA02G397240 · TK1151

细胞核0.328

排名 2 · TkA02G397240 · TK1151

细胞膜0.219

排名 3 · TkA02G397240 · TK1151

高尔基体0.091

排名 4 · TkA02G397240 · TK1151

线粒体0.087

排名 5 · TkA02G397240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28212TraW-like56-172 aa

PF01513NAD_kinase210-331 aa

PF00781DAGK_cat251-309 aa

PF20143NAD_kinase_C363-478 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G397240	`PF28212`	TraW-like	56	172	0.29	11.2
TkA02G397240	`PF01513`	NAD_kinase	210	331	1.1e-18	68.5
TkA02G397240	`PF00781`	DAGK_cat	251	309	0.0026	18.1
TkA02G397240	`PF20143`	NAD_kinase_C	363	478	9.2e-32	110.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q56YN3`	拟南芥	sp\|Q56YN3\|NADK1_ARATH NAD(H) kinase 1	62.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q5JK52`	水稻	sp\|Q5JK52\|NADK1_ORYSJ Probable NAD kinase 1	64.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q60E60`	水稻	sp\|Q60E60\|NADK3_ORYSJ Putative NAD kinase 3	63.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q53NI2`	水稻	sp\|Q53NI2\|NADK2_ORYSJ Probable NAD kinase 2, chloroplastic	45.100%	Swiss-Prot	中等置信

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