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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G383710
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 97506765-97510907 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2273 bp · TkA02G383710|TK1151|cDNA

CTTTGAGGGGCCACAACATTATATTTAGTGTTCTATGTAGGTTTTTAAAGTAAAGTTATGGGCTCACCCCCACTCCCTCCGCCTACTGAGACGGCAATAAATAAATACGATAAGCCCAAACTTTTATTATAGAGTCCTGTAAATCCTTTGTCATCTTTACCTGAGAATTTTGAATCATTTTACTTGAGAAGAAGATTGCAAGACTAAGCTAAAAGCCAGGTGCATGCTACCAGAAGAAATTAAGAATTTCCAACAATGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1692 bp · TkA02G383710|TK1151|CDS

ATGGATGTTTTCAGTGAAATTATGAAGCCGGTTGTTCAGGTTCTCATGGTTCCTGCAAAAAAAGAACTAGGTTATTTGATTTCATGTGCAACACATGTGAAGGACATGCGTAGAAAAATGACAGAGTTGGAAGTTGCAAAATGCGGTGAGGAAGAGCACTTGAACCGGAACACAGAAAACCGTTTAGAGATTTCATCTCAAGTGAGGGAATGGTTGGAAAAAGTAAAAAACATTAATGCAAAGGTGGAAAACTTTCCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

563 aa · TkA02G383710|TK1151|PROTEIN

MDVFSEIMKPVVQVLMVPAKKELGYLISCATHVKDMRRKMTELEVAKCGEEEHLNRNTENRLEISSQVREWLEKVKNINAKVENFPSEVGSCFNIMDRHKLGRKAFQILEEIESVTTQHSLITWSDRPIPLGRVDSTRTSVSAPLTTNHHEDFQSRNQTFLEALKAFQPNHKSHMIALCGMGGVGKTTMMEKLKKVAEKKKTFNYIVEVVIGENTDPIAAIQDVVATYIGIELKEKDKRARANKLCQGFKAKSDGGKNKF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G383710
TK1151 IDTkA02G383710
OH-1004 IDLXL04_014925
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 41.753
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G383710
位置Chr02:97506765-97510907 (-)
描述Similar to RPS2: Disease resistance protein RPS2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g12280 抗病蛋白，可介导对细菌病原体番茄青枯假单胞菌（Pseudomonas syringae pv tomato）DC3000株及高毒性卵菌Hyaloperonospora arabidopsidis Noco2分离株的防御反应。
The MEKK1-MKK1/MKK2-MPK4 kinase cascade negatively regulates immunity mediated by a mitogen-activated protein kinase kinase kinase in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.097253
At5g43740 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g47250 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g43730 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014925 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12280
ath:AT1G61180
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.814
排名 1 · TkA02G383710 · TK1151
细胞质0.121
排名 2 · TkA02G383710 · TK1151
内质网0.105
排名 3 · TkA02G383710 · TK1151
细胞核0.059
排名 4 · TkA02G383710 · TK1151
细胞外0.037
排名 5 · TkA02G383710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24073DUF73655-86 aa
PF00005ABC_tran31-82 aa
PF00006ATP-synt_ab52-99 aa
PF03308MeaB147-195 aa
PF25199nSTAND_NTPase5159-192 aa
PF12847Methyltransf_18161-202 aa
PF03193RsgA_GTPase162-199 aa
PF07693KAP_NTPase163-254 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G383710PF24073DUF73655860.08613.7
TkA02G383710PF00005ABC_tran31820.2112.9
TkA02G383710PF00006ATP-synt_ab52990.1912.1
TkA02G383710PF03308MeaB1471950.112.3
TkA02G383710PF25199nSTAND_NTPase51591920.02115.4
TkA02G383710PF12847Methyltransf_181612020.07813.7
TkA02G383710PF03193RsgA_GTPase1621990.004217.7
TkA02G383710PF07693KAP_NTPase1632540.009915.8
TkA02G383710PF00006ATP-synt_ab1642210.1912.1
TkA02G383710PF24883NPHP3_N1691940.1712.8
TkA02G383710PF00931NB-ARC1703313.5e-2692.5
TkA02G383710PF20720nSTAND31702010.08613.2
TkA02G383710PF13191AAA_161712140.02515.8
TkA02G383710PF04665Pox_A321722900.02714.7
TkA02G383710PF25201nSTAND61722010.1912.5
TkA02G383710PF00005ABC_tran1721970.2112.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722028.200%Swiss-Prot低置信
P60838拟南芥sp|P60838|SUMM2_ARATH Disease resistance protein SUMM227.500%Swiss-Prot低置信
Q9FG90拟南芥sp|Q9FG90|DRL33_ARATH Probable disease resistance protein At5g4374027.500%Swiss-Prot低置信
Q9LVT4拟南芥sp|Q9LVT4|DRL37_ARATH Probable disease resistance protein At5g4725027.100%Swiss-Prot低置信
Q9FG91拟南芥sp|Q9FG91|DRL32_ARATH Probable disease resistance protein At5g4373028.800%Swiss-Prot低置信

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