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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G382240
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 97182680-97189941 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2059 bp · TkA02G382240|TK1151|cDNA

TTTTCATCGGATACATTCGTATCATTCATAAGCGACCTCCTCTGAAACACATAAGCGAGAGAGAAGCGCGAATGCCGAGTTTGAGTGGCTCCGATTCGAGAAGGGAATCTGGAATTACGGGGATGTGTTTGTGTCACCAGAAACTTGTGGACAAATAACTTCAGCGAATTTTATGGGAATTTCAACATTCGTGGATGAGATTCTTTGGAGGTTTCAACGACATAATCATCTGTCTTCTTCTGTTACTTCCACTAACCCCA...

1677 bp · TkA02G382240|TK1151|CDS

ATGGGAATTTCAACATTCGTGGATGAGATTCTTTGGAGGTTTCAACGACATAATCATCTGTCTTCTTCTGTTACTTCCACTAACCCCAATCCCGTTGTTCTGAATCCCGATTATGAACCCAAACCATCGTCATCATTATCCACAATTGTTCAAGGGTTCCATCTTCCTGCACTTGAGAATACCAGAGTTCCAAAACGCATCGCTTTCCCACCAATGGATCCTATGAAAAGGCTGGAAAGAGAGTTCTTCACGGAATATGG...

558 aa · TkA02G382240|TK1151|PROTEIN

MGISTFVDEILWRFQRHNHLSSSVTSTNPNPVVLNPDYEPKPSSSLSTIVQGFHLPALENTRVPKRIAFPPMDPMKRLEREFFTEYGEAGRYEVQEVVGKGSYGVVGSATDKHTGDRVAIKKINDVFEHVSDATRILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFRDIYVVFELMESDLHQVIRANDDLTPEHYQFFLYQLLRGLKYIHSANVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARVSFNDAPSAIFWTDYVATR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G382240
TK1151 IDTkA02G382240
OH-1004 IDLXL04_014939
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.928 / OH-1004 95.851
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G382240
位置Chr02:97182680-97189941 (-)
描述Similar to MPK9: Mitogen-activated protein kinase 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g18040 丝裂原活化蛋白激酶9。 暂无已核实直接文献
At1g18150 MKK3-MPK8 和 CAMs-MPK8 模块通过控制受伤期间 RBOHD 基因的表达来负向调节 ROS 积累。
At1g73670 丝裂原活化蛋白激酶 15。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0708000 可能参与防御信号通路。
Os05g0576800 丝裂原活化蛋白激酶17。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_014939 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18150
ath:AT1G73670
ath:AT3G18040
dosa:Os05g0576800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.626
排名 1 · TkA02G382240 · TK1151
细胞核0.413
排名 2 · TkA02G382240 · TK1151
细胞膜0.100
排名 3 · TkA02G382240 · TK1151
高尔基体0.045
排名 4 · TkA02G382240 · TK1151
线粒体0.043
排名 5 · TkA02G382240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase92-383 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr93-308 aa
PF14531Kinase-like95-123 aa
PF03109ABC198-123 aa
PF06293Kdo125-231 aa
PF14531Kinase-like199-286 aa
PF03109ABC1207-241 aa
PF12330Haspin_kinase216-255 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G382240PF00069Pkinase923835.5e-66223.4
TkA02G382240PF07714PK_Tyr_Ser-Thr933081.4e-31110.4
TkA02G382240PF14531Kinase-like951230.05813.4
TkA02G382240PF03109ABC1981230.02414.5
TkA02G382240PF06293Kdo1252310.0001522.0
TkA02G382240PF14531Kinase-like1992860.05813.4
TkA02G382240PF03109ABC12072410.02414.5
TkA02G382240PF12330Haspin_kinase2162550.00816.0
TkA02G382240PF12330Haspin_kinase4024150.00816.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV37拟南芥sp|Q9LV37|MPK9_ARATH Mitogen-activated protein kinase 984.100%Swiss-Prot高置信
Q9LM33拟南芥sp|Q9LM33|MPK8_ARATH Mitogen-activated protein kinase 881.100%Swiss-Prot高置信
Q9C9U4拟南芥sp|Q9C9U4|MPK15_ARATH Mitogen-activated protein kinase 1581.700%Swiss-Prot高置信
Q5Z9J0水稻sp|Q5Z9J0|MPK12_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1276.500%Swiss-Prot高置信
Q6L5F7水稻sp|Q6L5F7|MPK17_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1774.900%Swiss-Prot高置信

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