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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G357100
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 90722758-90724356 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1507 bp · TkA02G357100|TK1151|cDNA

TAAGAAACTTAGAACGGTAAAAACCACTATCCCTATAAAATGAAGTTTTAAGACATTAAGGAACAAACCAAAACTAAGCCATGGAGTCTATTTCTATGCATTCTTTACGAAGTTTCCCTCTCACATCAGTCCGCAACCCATTTGGCAAGACTACCACTTCACATCAATGTGTCAATAACATGCTTACACATGCTACTGCAACAACACCACCGTCAACCACCACTCACCGCCATACCGTTACCCACAAAATGCCACCGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1185 bp · TkA02G357100|TK1151|CDS

ATGGAGTCTATTTCTATGCATTCTTTACGAAGTTTCCCTCTCACATCAGTCCGCAACCCATTTGGCAAGACTACCACTTCACATCAATGTGTCAATAACATGCTTACACATGCTACTGCAACAACACCACCGTCAACCACCACTCACCGCCATACCGTTACCCACAAAATGCCACCGGAAAAAATTGAAGTCTTTAAGTCCCTCGAGCCTTGGGTTGCCCAATCCATCCTCCCTCTTCTAAAATCAACAGAACAGTCCTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

394 aa · TkA02G357100|TK1151|PROTEIN

MESISMHSLRSFPLTSVRNPFGKTTTSHQCVNNMLTHATATTPPSTTTHRHTVTHKMPPEKIEVFKSLEPWVAQSILPLLKSTEQSWQPSDFLPNSSQSTDQFTTEVQILRDQSANLPDDYLVVLIGNMITEEALPTYQTVFNTFHGVNDETGASPSPWATWTRSWTAEENRHGDLLRTYLYLSGRVNMTMIERTVQNLIASGMDPGTENNPYLGFVYTSFQERATFISHGNTARLAKENGDPSLARICGIIASDEKRHE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G357100
TK1151 IDTkA02G357100
OH-1004 IDLXL04_015196
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.746 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G357100
位置Chr02:90722758-90724356 (-)
描述Similar to S-ACP-DES6: Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase 6, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g43800 通过在酰基链的碳 9 和碳 10 之间引入顺式双键，将硬脂酰 -ACP 转化为油酰 -ACP。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8A7A3 通过在酰基链的碳 9 和碳 10 之间引入顺式双键，将硬脂酰 -ACP 转化为油酰 -ACP。 暂无已核实直接文献
Os01g0880800 通过在酰基链的碳 9 和碳 10 之间引入顺式双键，将硬脂酰 -ACP 转化为油酰 -ACP。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015196 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0045300 stearoyl-[ACP] desaturase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G43800
dosa:Os01g0880800
dosa:Os04g0379900
sot:102577562
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.866
排名 1 · TkA02G357100 · TK1151
线粒体0.128
排名 2 · TkA02G357100 · TK1151
细胞质0.079
排名 3 · TkA02G357100 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA02G357100 · TK1151
过氧化物酶体0.028
排名 5 · TkA02G357100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03405FA_desaturase_260-387 aa
PF02915Rubrerythrin136-179 aa
PF07618DUF1580148-192 aa
PF02915Rubrerythrin232-265 aa
PF09807ELP6306-321 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G357100PF03405FA_desaturase_2603873.9e-147490.0
TkA02G357100PF02915Rubrerythrin1361790.0003721.6
TkA02G357100PF07618DUF15801481920.01116.1
TkA02G357100PF02915Rubrerythrin2322650.0003721.6
TkA02G357100PF09807ELP63063210.2611.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84VY3拟南芥sp|Q84VY3|STAD6_ARATH Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase 6, chloroplastic69.900%Swiss-Prot高置信
B8A7A3水稻sp|B8A7A3|STAD1_ORYSI Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase 1, chloroplastic64.400%Swiss-Prot高置信
Q8LJJ9水稻sp|Q8LJJ9|STAD1_ORYSJ Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase 1, chloroplastic64.400%Swiss-Prot高置信

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