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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G347360
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 88254361-88256785 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1989 bp · TkA02G347360|TK1151|cDNA

TGACAGACTCTCTCAAGCTTAGCTTATTACAATACGTTAAAAAACCTCAAACCATAATTTCTTCTTTTCCCATATATAACTTGGAACCACGAGACATAATACCACCAACAATATAAGTTCGAAAGATATATTCTTTTGCAACCATTCACAAACGTGAAAATGCAAACCACTGGATCAAGAACAACAACTCAAAGAAGAAGACCAATCTCTCTAATGGGTAGAAAAATCAAAGCCAAACAAAAACAGCAATCGGTGAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA02G347360|TK1151|CDS

ATGCAAACCACTGGATCAAGAACAACAACTCAAAGAAGAAGACCAATCTCTCTAATGGGTAGAAAAATCAAAGCCAAACAAAAACAGCAATCGGTGAACAAAACAGGTAATCAAGTAGAATCCATTACCCAGGAAACAAAGATGATCAATACTTCAAGTCTCAGTAACAAGTATCAGCCAAGACTCTTCCAAGAAATTGTGGGGCATGGTATTGTAATCAAAACCCTGTCTAACGCCATCCAGAAGAAAAAAATCGCGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

610 aa · TkA02G347360|TK1151|PROTEIN

MQTTGSRTTTQRRRPISLMGRKIKAKQKQQSVNKTGNQVESITQETKMINTSSLSNKYQPRLFQEIVGHGIVIKTLSNAIQKKKIAPIYLFHGPTGTGKTSTARVFAMALNCESTFHNTKPCCSCKGCSRSLYTMDLCSANGFGKIKTILHNTSFAQAIPGLKVFIIEECQLLTMDTWDELMRLVEGPYASNLVFLLITTDANSIAGNISSRCHKFYFKKLNDEDVAEKLSRILVHERLGIETEALKLIVAKSEGSLRDA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G347360
TK1151 IDTkA02G347360
OH-1004 IDLXL04_015311
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 91.742
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G347360
位置Chr02:88254361-88256785 (-)
描述Similar to At5g45720: Protein STICHEL-like 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45720 类 STICHEL 蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At4g24790 STICHEL样蛋白2。 暂无已核实直接文献
At1g14460 类STICHEL蛋白 1。 暂无已核实直接文献
At2g02480 通过一种与内重复无关的途径，作为毛状体分枝的关键调控因子。 暂无已核实直接文献
At4g18820 STICHEL样蛋白3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015311 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006261 DNA-templated DNA replication 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0010026 trichome differentiation 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005663 DNA replication factor C complex 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009360 DNA polymerase III complex 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003887 DNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14460
ath:AT2G02480
ath:AT4G18820
ath:AT4G24790
ath:AT5G45720
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.662
排名 1 · TkA02G347360 · TK1151
细胞质0.234
排名 2 · TkA02G347360 · TK1151
细胞膜0.052
排名 3 · TkA02G347360 · TK1151
质体0.051
排名 4 · TkA02G347360 · TK1151
内质网0.030
排名 5 · TkA02G347360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13476AAA_2322-56 aa
PF13086AAA_1125-50 aa
PF06309Torsin44-109 aa
PF05496RuvB_N60-113 aa
PF13177DNA_pol3_delta271-221 aa
PF13191AAA_1672-112 aa
PF04851ResIII73-110 aa
PF02367TsaE76-114 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G347360PF13476AAA_2322565.78.3
TkA02G347360PF13086AAA_1125500.1412.6
TkA02G347360PF06309Torsin441090.1113.3
TkA02G347360PF05496RuvB_N601130.07913.4
TkA02G347360PF13177DNA_pol3_delta2712213.9e-2176.4
TkA02G347360PF13191AAA_16721120.03415.4
TkA02G347360PF04851ResIII731100.113.2
TkA02G347360PF02367TsaE761140.212.4
TkA02G347360PF13086AAA_11771110.1412.6
TkA02G347360PF13401AAA_22871948.3e-0523.6
TkA02G347360PF13476AAA_23871105.78.3
TkA02G347360PF00004AAA892198.6e-0730.2
TkA02G347360PF12775AAA_7891180.09512.9
TkA02G347360PF07728AAA_5901140.05114.3
TkA02G347360PF00910RNA_helicase901240.08914.0
TkA02G347360PF13191AAA_161641940.03415.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KEM0拟南芥sp|F4KEM0|STIL4_ARATH Protein STICHEL-like 435.100%Swiss-Prot中等置信
F4JRP8拟南芥sp|F4JRP8|STIL2_ARATH Protein STICHEL-like 233.400%Swiss-Prot中等置信
F4HW65拟南芥sp|F4HW65|STIL1_ARATH Protein STICHEL-like 141.400%Swiss-Prot中等置信
O64728拟南芥sp|O64728|STI_ARATH Protein STICHEL39.300%Swiss-Prot中等置信
F4JRP0拟南芥sp|F4JRP0|STIL3_ARATH Protein STICHEL-like 334.300%Swiss-Prot中等置信

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