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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G318540
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 80909663-80917970 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5078 bp · TkA02G318540|TK1151|cDNA

GCTCTATAATGCACAAATGATTGTGTATGACAAAAAACTGTTGTACACAAATCAGTTCCCAATTTATTATATTACGATAACACATAGTGAATGGTCGATGACCATCTCCGTACGTACTTTCTTATATATAAGATAATTATTCACAAACTTTATATAGTTCAGAATCTCTCTCCAACTCTGTATCATAACCAGACCATTCATTCATTCATTCATTCGGGTCAAGAACCATTAAGTCAAGCATTAAGATGCTTTTGAAGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

4473 bp · TkA02G318540|TK1151|CDS

ATGCGTTCTAAAGCTATGGAGGTCATAAAAGGTTCGAACATTTCTGAGTTTTGGACACCATGGATGCAGCCAGGCTCGCCCTGTTTGTGGGAAATCGCCAGCATTATCCTCCAACTTGGGTTCCTTGCGGTCCTATTAATCGGCCTTTTAAAACGACTCATTGAGCCACGGTCCACCCACAAACCAAAAGCCATGACCCCCGACCGGTACCCAACCAACATCAAAACTGGTCTCTCCTACAAACTAAGTCTAGTATGCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1490 aa · TkA02G318540|TK1151|PROTEIN

MRSKAMEVIKGSNISEFWTPWMQPGSPCLWEIASIILQLGFLAVLLIGLLKRLIEPRSTHKPKAMTPDRYPTNIKTGLSYKLSLVCSILLLGTHIMVPLTFTTRNKAHCEFEIPILSSEIMQMISWVMTLIAIYLIPKRQKVDFPWIIRVWWLCTFLLTTSRFTLDVHFLVLNHGHPGLLEYIDLVSVLSSTCLLFIAIKGKTGLTVADPSAITEPFLHGNDHKKQEKLECPYGKASIFQLITFSWLNPLFVVGIKKPLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G318540
TK1151 IDTkA02G318540
OH-1004 IDLXL04_015541
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G318540
位置Chr02:80909663-80917970 (+)
描述Similar to ABCC9: ABC transporter C family member 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g60160 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g60970 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At1g04120 谷胱甘肽 S-结合物泵。
The Arabidopsis thaliana ABC transporter AtMRP5 controls root development and stomata movement.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.8.1875
The plant multidrug resistance ABC transporter AtMRP5 is involved in guard cell hormonal signalling and water use.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016012.x
Binding of sulfonylurea by AtMRP5, an Arabidopsis multidrug resistance-related protein that functions in salt tolerance.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.027045
The Arabidopsis ATP-binding cassette protein AtMRP5/AtABCC5 is a high affinity inositol hexakisphosphate transporter involved in guard cell signaling and phytate storage.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m109.030247
At3g13080 谷胱甘肽 S-结合物泵。
An ABC-transporter of Arabidopsis thaliana has both glutathione-conjugate and chlorophyll catabolite transport activity.1998 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1998.00076.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XCD4 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015541 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04120
ath:AT3G13080
ath:AT3G60160
ath:AT3G60970
zma:100125659
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.451
排名 1 · TkA02G318540 · TK1151
溶酶体／液泡0.266
排名 2 · TkA02G318540 · TK1151
细胞质0.174
排名 3 · TkA02G318540 · TK1151
内质网0.138
排名 4 · TkA02G318540 · TK1151
高尔基体0.098
排名 5 · TkA02G318540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane304-571 aa
PF08477Roc484-509 aa
PF02463SMC_N586-811 aa
PF20703nSTAND1632-674 aa
PF03193RsgA_GTPase634-671 aa
PF03308MeaB635-667 aa
PF00005ABC_tran636-770 aa
PF00158Sigma54_activat637-668 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G318540PF00664ABC_membrane3045713.9e-60204.6
TkA02G318540PF08477Roc4845091.49.9
TkA02G318540PF02463SMC_N5868116.4e-0833.0
TkA02G318540PF20703nSTAND16326740.005617.1
TkA02G318540PF03193RsgA_GTPase6346710.0002121.9
TkA02G318540PF03308MeaB6356670.01714.9
TkA02G318540PF00005ABC_tran6367709.2e-48163.0
TkA02G318540PF00158Sigma54_activat6376680.02315.1
TkA02G318540PF12775AAA_76396720.005816.9
TkA02G318540PF02367TsaE6416690.2711.9
TkA02G318540PF09818ABC_ATPase6416661.68.4
TkA02G318540PF13555AAA_296426631.3e-0732.0
TkA02G318540PF20693YobI-ATPase6456800.01615.5
TkA02G318540PF01935DUF876476730.0003721.4
TkA02G318540PF00009GTP_EFTU6476720.04114.2
TkA02G318540PF00437T2SSE6476700.07112.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M1C7拟南芥sp|Q9M1C7|AB9C_ARATH ABC transporter C family member 962.800%Swiss-Prot高置信
Q7FB56拟南芥sp|Q7FB56|AB15C_ARATH Putative ABC transporter C family member 1567.900%Swiss-Prot高置信
Q7GB25拟南芥sp|Q7GB25|AB5C_ARATH ABC transporter C family member 549.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LK64拟南芥sp|Q9LK64|AB3C_ARATH ABC transporter C family member 349.900%Swiss-Prot中等置信
A2XCD4水稻sp|A2XCD4|AB13C_ORYSI ABC transporter C family member 1351.200%Swiss-Prot高置信

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