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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G264730
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 67796295-67800464 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

945 bp · TkA02G264730|TK1151|cDNA

ATGGGTGGAGGTAGGGTGGCTCATCCGGTGTTGAAAGGGCCTAGTGTGGTGAAGGAGCTGGTGATTGGGGCGGTGCTAGGGTTAGCCGCTGGCGGCTTATGGAAGATGCACCACTGGAATGAGCAGAGAAAAACTAGGGCTTTTTATGACTTATTGGAGAAGGGAAGTAGAAAAATGGCGGATGATGTAACGAGATGGTCGGTGACCTACACGAAGCACATAAAGCAGAAGCGTAAAGTTTATGAAGACGGATTTTTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

945 bp · TkA02G264730|TK1151|CDS

ATGGGTGGAGGTAGGGTGGCTCATCCGGTGTTGAAAGGGCCTAGTGTGGTGAAGGAGCTGGTGATTGGGGCGGTGCTAGGGTTAGCCGCTGGCGGCTTATGGAAGATGCACCACTGGAATGAGCAGAGAAAAACTAGGGCTTTTTATGACTTATTGGAGAAGGGAAGTAGAAAAATGGCGGATGATGTAACGAGATGGTCGGTGACCTACACGAAGCACATAAAGCAGAAGCGTAAAGTTTATGAAGACGGATTTTTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

314 aa · TkA02G264730|TK1151|PROTEIN

MGGGRVAHPVLKGPSVVKELVIGAVLGLAAGGLWKMHHWNEQRKTRAFYDLLEKGSRKMADDVTRWSVTYTKHIKQKRKVYEDGFLEVQSSSHKVKLYDDCDKLLDSKIVKLDDDAVKSGETITFGSYLVDIGDPQGDIKPIPNIILQRDKIIADKTHMSNTKTSKVSSRVGKTSSINLSPSQKIIREFKRREVKKYSSPPSCQTTTKDESTEWEVLYTAQLTQKAKKFHDGILKVAISGLRGRQAILYDETRKQLDSKF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G264730
TK1151 IDTkA02G264730
OH-1004 IDLXL04_029497
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.682 / OH-1004 57.117
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G264730
位置Chr02:67796295-67800464 (-)
描述Similar to COX5C2: Cytochrome c oxidase subunit 5C-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g62400 该蛋白是细胞色素c氧化酶的一条核编码多肽链，该酶是线粒体电子传递链的终末氧化酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0561000 该蛋白是细胞色素c氧化酶的一条核编码多肽链，该酶是线粒体电子传递链的终末氧化酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029497 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G62400
dosa:Os12g0561000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.902
排名 1 · TkA02G264730 · TK1151
细胞质0.166
排名 2 · TkA02G264730 · TK1151
细胞膜0.038
排名 3 · TkA02G264730 · TK1151
内质网0.026
排名 4 · TkA02G264730 · TK1151
线粒体0.015
排名 5 · TkA02G264730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30944COX5C23-47 aa
PF08706D5_N34-115 aa
PF10382ZGRF1-like_N63-137 aa
PF26323EsxC63-123 aa
PF26018BSH_RND_rel81-123 aa
PF21544PorZ_N_b_propeller88-157 aa
PF10382ZGRF1-like_N213-289 aa
PF26018BSH_RND_rel226-226 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G264730PF30944COX5C23471.9e-1660.0
TkA02G264730PF08706D5_N341150.09113.8
TkA02G264730PF10382ZGRF1-like_N631371.2e-32112.7
TkA02G264730PF26323EsxC631230.7910.9
TkA02G264730PF26018BSH_RND_rel811230.2711.8
TkA02G264730PF21544PorZ_N_b_propeller881570.1712.8
TkA02G264730PF10382ZGRF1-like_N2132891.2e-32112.7
TkA02G264730PF26018BSH_RND_rel2262260.2711.8
TkA02G264730PF26323EsxC2432670.7910.9
TkA02G264730PF22523DUF69992603090.1911.4
TkA02G264730PF21544PorZ_N_b_propeller2753060.1712.8
TkA02G264730PF26323EsxC2923120.7910.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZQ0拟南芥sp|Q9LZQ0|CX5C2_ARATH Cytochrome c oxidase subunit 5C-281.800%Swiss-Prot低置信
Q9SXX7水稻sp|Q9SXX7|COX5C_ORYSJ Cytochrome c oxidase subunit 5C80.000%Swiss-Prot低置信

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