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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G260670
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 66484515-66487816 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2461 bp · TkA02G260670|TK1151|cDNA

AAAAGCTTTGTTTTATGTGCTGCAACTTCTAAACCCTTTTACTTTAAATTAAAAATCACCCCTCCCAATTCAGACCCCCTTCAAGTCTTCAACCCCAACACTCCCCCATTTTTAAACAACCCTATTTTCTCTCAACAATCCTCGCTTTTTCTTCAGTTCTTTTAATATTCACAACCTTTCTACATGTGAGCTTGTTGTATTCTTGACCGTTTTTGAAAAAAAGTCGACATTCTTCACCTTTTTCTTCCATGGGTTCGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1857 bp · TkA02G260670|TK1151|CDS

ATGGAGATTTTCAAGTTTTTTTTAATGGGTTTGCTCTTGTTTGGAGCAAACGCCATTGTTCTTGAAGATGACAAAAGAGCATTGTTGGATTTCATGAACAATTTTCCACACTCACGCTCACTAAACTGGGATTCAAACTCAAGTAGTGTGTGTAATGAATGGACTGGAGTCACGTGCAGTGAAGACGGGTTACGTGTCATTGCTCTCCGGCTTCCCGGCGTTGGGTTTAACGGTGACATTCCGGCGAACACCATTAGCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

618 aa · TkA02G260670|TK1151|PROTEIN

MEIFKFFLMGLLLFGANAIVLEDDKRALLDFMNNFPHSRSLNWDSNSSSVCNEWTGVTCSEDGLRVIALRLPGVGFNGDIPANTISRLSALQILSLRSNGISGSFPVDFYNLENLSLLYLQFNQFSGELPLDFSVWKNLTIINLSNNKFNGSIPSSISSLTHLSALNLANNSLIGQIPDLRMQNLQVLDLSNNNLSGVVPKSLHKFPKSVFSGNNLSLIYSTDEVPFVMPTHKPNPTSKTDRKLNEKALLAIIVAISAIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G260670
TK1151 IDTkA02G260670
OH-1004 IDLXL04_011852
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.984 / OH-1004 89.587
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G260670
位置Chr02:66484515-66487816 (+)
描述Similar to At4g23740: Probable inactive receptor kinase At4g23740
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23740 可能的非活性受体激酶 At4g23740。 暂无已核实直接文献
At1g64210 推定不活性的类受体蛋白激酶 At1g64210。 暂无已核实直接文献
At5g58300 可能是非活性受体激酶 At5g58300。 暂无已核实直接文献
At5g53320 可能不活跃的受体激酶 At5g53320。 暂无已核实直接文献
At3g08680 可能的非活性受体激酶 At3g08680。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011852 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64210
ath:AT2G26730
ath:AT4G23740
ath:AT5G24100
ath:AT5G53320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · TkA02G260670 · TK1151
细胞质0.074
排名 2 · TkA02G260670 · TK1151
内质网0.068
排名 3 · TkA02G260670 · TK1151
细胞核0.057
排名 4 · TkA02G260670 · TK1151
溶酶体／液泡0.020
排名 5 · TkA02G260670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_222-60 aa
PF13855LRR_879-125 aa
PF23598LRR_1480-121 aa
PF23598LRR_1486-189 aa
PF23211LRR_LRWD187-135 aa
PF00560LRR_191-112 aa
PF12799LRR_491-125 aa
PF13516LRR_691-103 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G260670PF08263LRRNT_222602e-1041.4
TkA02G260670PF13855LRR_8791251.8e-1660.3
TkA02G260670PF23598LRR_14801211.8e-0627.7
TkA02G260670PF23598LRR_14861891.8e-0627.7
TkA02G260670PF23211LRR_LRWD1871350.1412.6
TkA02G260670PF00560LRR_1911121e-1349.2
TkA02G260670PF12799LRR_4911251e-1145.4
TkA02G260670PF13516LRR_6911030.09813.5
TkA02G260670PF00560LRR_11141341e-1349.2
TkA02G260670PF13516LRR_61141280.09813.5
TkA02G260670PF13855LRR_81331731.8e-1660.3
TkA02G260670PF12799LRR_41371811e-1145.4
TkA02G260670PF00560LRR_11381601e-1349.2
TkA02G260670PF13516LRR_61381500.09813.5
TkA02G260670PF23211LRR_LRWD11542300.1412.6
TkA02G260670PF13516LRR_61601740.09813.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUQ3拟南芥sp|Q9SUQ3|Y4374_ARATH Probable inactive receptor kinase At4g2374064.300%Swiss-Prot高置信
Q9SH71拟南芥sp|Q9SH71|Y1421_ARATH Putative inactive receptor-like protein kinase At1g6421057.400%Swiss-Prot高置信
Q9LVM0拟南芥sp|Q9LVM0|Y5830_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g5830050.800%Swiss-Prot高置信
Q9FK10拟南芥sp|Q9FK10|Y5332_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g5332056.600%Swiss-Prot高置信
Q9C9Y8拟南芥sp|Q9C9Y8|Y3868_ARATH Probable inactive receptor kinase At3g0868051.800%Swiss-Prot高置信

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