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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G184890
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 47559176-47560678 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1503 bp · TkA02G184890|TK1151|cDNA

ATGCTCTTCCGAGGAAGATGCAATCAACTTCCTCATCAGCTAACGGTGGCTGTCGCCATTGGTGTCCGATTTTATTCTTCAGATTTGGAATTTGAAGTCAAAAAAATTACAAAAATCATCAACGACCATCCTTTTCCTGATCAACCTATTTATCCAAAACTTGCCCAAACTATCCCTTCAGCTACCCTTTCAACCACCTTAGTAGAAAATGTTCTTGGCTCTCTCTTTGCGTCCCACTCTAATGGCCTTAAAGCTTTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1503 bp · TkA02G184890|TK1151|CDS

ATGCTCTTCCGAGGAAGATGCAATCAACTTCCTCATCAGCTAACGGTGGCTGTCGCCATTGGTGTCCGATTTTATTCTTCAGATTTGGAATTTGAAGTCAAAAAAATTACAAAAATCATCAACGACCATCCTTTTCCTGATCAACCTATTTATCCAAAACTTGCCCAAACTATCCCTTCAGCTACCCTTTCAACCACCTTAGTAGAAAATGTTCTTGGCTCTCTCTTTGCGTCCCACTCTAATGGCCTTAAAGCTTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

500 aa · TkA02G184890|TK1151|PROTEIN

MLFRGRCNQLPHQLTVAVAIGVRFYSSDLEFEVKKITKIINDHPFPDQPIYPKLAQTIPSATLSTTLVENVLGSLFASHSNGLKAFEFFKFSLQFCPSSDAFEKTLHILTRMRDFNKAWELIEQVHKTHPSLITLKSMSIMLSRTAKFQSFDETLEAFQKMENKLSDCKQFGTDEFNLLLRAFCTQRQMKEARSVFNRLYPRFSPNTKTMNILLLGFKESGDITSVELFYHDMIRRGFKPNIITYNIRIDSYCKGGRFLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G184890
TK1151 IDTkA02G184890
OH-1004 IDLXL04_030286
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)26.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 39.200 / OH-1004 16.756
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G184890
位置Chr02:47559176-47560678 (-)
描述Similar to At1g77360: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61360 含五十二肽重复序列蛋白 At3g61360。 暂无已核实直接文献
At1g02420 假定含有五重复螺旋蛋白的 At1g02420。 暂无已核实直接文献
At5g15010 含五十二肽重复序列的蛋白 At5g15010，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030286 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11050
ath:AT1G52640
ath:AT1G71060
ath:AT1G77360
ath:AT2G48010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.836
排名 1 · TkA02G184890 · TK1151
质体0.093
排名 2 · TkA02G184890 · TK1151
细胞核0.057
排名 3 · TkA02G184890 · TK1151
细胞质0.037
排名 4 · TkA02G184890 · TK1151
细胞膜0.011
排名 5 · TkA02G184890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29070MSC6_N53-229 aa
PF01535PPR70-90 aa
PF12921ATP1394-132 aa
PF02284COX5A94-127 aa
PF17177PPR_long96-222 aa
PF28774DUF845798-126 aa
PF29834SOV1_C102-127 aa
PF13041PPR_2106-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G184890PF29070MSC6_N532291.3e-1661.4
TkA02G184890PF01535PPR70909.6e-36120.3
TkA02G184890PF12921ATP13941328.4e-0626.4
TkA02G184890PF02284COX5A941270.04414.6
TkA02G184890PF17177PPR_long962221.4e-1144.9
TkA02G184890PF28774DUF8457981260.1313.3
TkA02G184890PF29834SOV1_C1021270.007516.0
TkA02G184890PF13041PPR_21061258.3e-47157.8
TkA02G184890PF13812PPR_31061291e-1558.2
TkA02G184890PF23276TPR_241071611.7e-1557.8
TkA02G184890PF13428TPR_141071310.01916.4
TkA02G184890PF01535PPR1081249.6e-36120.3
TkA02G184890PF00566RabGAP-TBC1271480.1112.9
TkA02G184890PF13041PPR_21381648.3e-47157.8
TkA02G184890PF01535PPR1391639.6e-36120.3
TkA02G184890PF28774DUF84571471620.1313.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2C8拟南芥sp|Q9M2C8|PP291_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g6136058.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FZ19拟南芥sp|Q9FZ19|PPR5_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g0242036.400%Swiss-Prot低置信
Q9LFQ4拟南芥sp|Q9LFQ4|PP383_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15010, mitochondrial24.700%Swiss-Prot低置信

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