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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G182580
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 46928934-46930702 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1677 bp · TkA02G182580|TK1151|cDNA

TTTAAATAATTCCAAGTACCATACCAACATCAATAATTGAAATAGACGGTCCGTACCTTTATGGGTCTTTCATGCACCAATGGAGATTAATCAAACAAAAAGGCTAGTGTAAGGGGGTATACTCTGATCATCCTCCATCTTCAAATAAGCATTTCATGTAGTTCTCTCTCGCAAAACTTTCTGATAGAAATACTCATATTTGAAACTGTAAATCGTCTTTTAGTATACCAGTTGTTGAGCATAAGCTCTTGCAATGACTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1092 bp · TkA02G182580|TK1151|CDS

ATGACTACTAACGGTGAAACAAAAGCTTCACCGAAAGTATCAAAGAAGCCTCATCTTAACGATCAAACAGCCTCCCTGAAAAGAAGAAGATTCCGACGAATCAAAAGTGCCCCACTTGCCGACTCTTTCGGTTCCGATTTCAAAAAGGCCGCCGCATCTCTGCCAAGCCCCAAATCCGTTTTCGACCATTTTTACCCGAGTTACTGGAAGGTAGGTGTCGTCTTACTCGTTTATCTAGTTGCAGGTATGGTTTGCTTCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

363 aa · TkA02G182580|TK1151|PROTEIN

MTTNGETKASPKVSKKPHLNDQTASLKRRRFRRIKSAPLADSFGSDFKKAAASLPSPKSVFDHFYPSYWKVGVVLLVYLVAGMVCFHLARHQISGKKTNSILDALYFTVVTMTSVGYGDLVPATTLTILLACLFVVLGMLIVGVVLSKAADLLVEKQAHLLVKALHMNETVGEAEILKKIKTKNVRNKCIILVVFLLVFMAAGTGLLLSVEDLDFINAFYCVVATLTGLGYIDKCFSTTGGRVFALFWILLGTIYVAQLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G182580
TK1151 IDTkA02G182580
OH-1004 IDLXL04_031029
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G182580
位置Chr02:46928934-46930702 (-)
描述Similar to TPK1: Two-pore potassium channel 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55630 电压无关、大电导和钾选择性液泡膜离子通道。
TPK1 is a vacuolar ion channel different from the slow-vacuolar cation channel.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.065599
TPK1, a Ca(2+)-regulated Arabidopsis vacuole two-pore K(+) channel is activated by 14-3-3 proteins.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03255.x
At4g01840 可能的电压非依赖性钾选择性液泡膜离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0752300 高选择性内向整流钾通道，专门位于大液泡的液泡膜中。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
Os07g0108800 高选择性内向整流钾通道，特异性位于蛋白贮藏液泡的液泡膜上。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
Os09g0299400 内向整流钾通道。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031029 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010196 nonphotochemical quenching 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0071257 cellular response to electrical stimulus 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0097623 potassium ion export across plasma membrane 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G01840
ath:AT4G18160
ath:AT5G55630
dosa:Os03g0752300
dosa:Os07g0108800
osa:4334137
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.456
排名 1 · TkA02G182580 · TK1151
溶酶体／液泡0.255
排名 2 · TkA02G182580 · TK1151
内质网0.143
排名 3 · TkA02G182580 · TK1151
细胞质0.124
排名 4 · TkA02G182580 · TK1151
高尔基体0.085
排名 5 · TkA02G182580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30508DUF862053-106 aa
PF14316DUF438166-105 aa
PF23494bPH_1066-92 aa
PF28825CD19_TM69-84 aa
PF00520Ion_trans73-146 aa
PF07885Ion_trans_274-154 aa
PF00060Lig_chan74-142 aa
PF27171YxeC76-111 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G182580PF30508DUF8620531060.4311.5
TkA02G182580PF14316DUF4381661050.02915.4
TkA02G182580PF23494bPH_1066920.6110.2
TkA02G182580PF28825CD19_TM69843.28.3
TkA02G182580PF00520Ion_trans731461.2e-1145.0
TkA02G182580PF07885Ion_trans_2741541.8e-2486.1
TkA02G182580PF00060Lig_chan741425.37.6
TkA02G182580PF27171YxeC761110.7110.5
TkA02G182580PF20664DUF6814771059.87.2
TkA02G182580PF14316DUF43811211660.02915.4
TkA02G182580PF23494bPH_101211570.6110.2
TkA02G182580PF28825CD19_TM1211403.28.3
TkA02G182580PF30508DUF86201271500.4311.5
TkA02G182580PF20664DUF68141762079.87.2
TkA02G182580PF00520Ion_trans1832601.2e-1145.0
TkA02G182580PF30508DUF86201892240.4311.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LBL1拟南芥sp|Q8LBL1|KCO1_ARATH Two-pore potassium channel 151.000%Swiss-Prot高置信
Q9S6Z8拟南芥sp|Q9S6Z8|KCO5_ARATH Two-pore potassium channel 533.000%Swiss-Prot中等置信
Q850M0水稻sp|Q850M0|KCO1_ORYSJ Two pore potassium channel a48.900%Swiss-Prot中等置信
Q8LIN5水稻sp|Q8LIN5|KCO2_ORYSJ Two pore potassium channel b50.500%Swiss-Prot高置信
Q69TN4水稻sp|Q69TN4|KCO3_ORYSJ Two pore potassium channel c36.800%Swiss-Prot中等置信

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