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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G168600
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 43231987-43232913 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

927 bp · TkA02G168600|TK1151|cDNA

ATGGTTGTTTATTCTTCTAATGGAAGAATCGAAGACGCGAAACGAGTTTTCAAGAGTATACCATCCAAAACTTTGATCTCATGGAACTCGATGATATCAGGGTTAACTCAAAACGGTTACCCAAGTGAAGCACTTGCATGTTTTACCGAATTAAACACAACGGGGTTCAAAATCGATAGATTTAGTCTCGCGAGTGTGATAAGCACATGTGGGACCATTTCGTGTCGGACACTTGGCGAACAGTTATTCGCCAGGGCTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA02G168600|TK1151|CDS

ATGGTTGTTTATTCTTCTAATGGAAGAATCGAAGACGCGAAACGAGTTTTCAAGAGTATACCATCCAAAACTTTGATCTCATGGAACTCGATGATATCAGGGTTAACTCAAAACGGTTACCCAAGTGAAGCACTTGCATGTTTTACCGAATTAAACACAACGGGGTTCAAAATCGATAGATTTAGTCTCGCGAGTGTGATAAGCACATGTGGGACCATTTCGTGTCGGACACTTGGCGAACAGTTATTCGCCAGGGCTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

308 aa · TkA02G168600|TK1151|PROTEIN

MVVYSSNGRIEDAKRVFKSIPSKTLISWNSMISGLTQNGYPSEALACFTELNTTGFKIDRFSLASVISTCGTISCRTLGEQLFARAIVISLESDKTMSTSLVDFYCKCGDVVNGRRLFDQMVEVESDEASWNAMLMGYATNGYGIEALDLFGIMRNTKGVYPTGITFTAVLSACDHCGLLEEGLKWFNGMKREYCIDPGIEHYSCMVDLFARVGRLEEAMDLLVSMPFEADVSMWSAISRGCIAHGDTLLGKKVAEKMME...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G168600
TK1151 IDTkA02G168600
OH-1004 IDLXL04_011659
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.013 / OH-1004 39.412
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G168600
位置Chr02:43231987-43232913 (+)
描述Similar to PCMP-E5: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77010, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g77010 假定的五螺旋肽重复蛋白At1g77010，线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g68930 推测含有五肽重复序列的蛋白 At1g68930。 暂无已核实直接文献
At3g49170 可能在胚胎发生中起作用。 暂无已核实直接文献
At2g37320 含五十二肽重复的蛋白At2g37320。 暂无已核实直接文献
At4g19191 含五重复肽的蛋白质 At4g19191，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011659 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0080156 mitochondrial mRNA modification 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G77010
ath:AT2G13600
ath:AT2G22070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.572
排名 1 · TkA02G168600 · TK1151
质体0.252
排名 2 · TkA02G168600 · TK1151
细胞核0.053
排名 3 · TkA02G168600 · TK1151
细胞质0.031
排名 4 · TkA02G168600 · TK1151
细胞膜0.005
排名 5 · TkA02G168600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01535PPR3-22 aa
PF13041PPR_23-20 aa
PF20431E_motif3-17 aa
PF13431TPR_173-14 aa
PF13428TPR_144-19 aa
PF14559TPR_194-22 aa
PF12854PPR_16-18 aa
PF13041PPR_225-70 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G168600PF01535PPR3222.4e-34115.9
TkA02G168600PF13041PPR_23205.4e-2691.2
TkA02G168600PF20431E_motif3173.5e-1350.3
TkA02G168600PF13431TPR_173140.00218.9
TkA02G168600PF13428TPR_144191.7e-0628.8
TkA02G168600PF14559TPR_194221.9e-0525.6
TkA02G168600PF12854PPR_16181.6e-1866.8
TkA02G168600PF13041PPR_225705.4e-2691.2
TkA02G168600PF12854PPR_125491.6e-1866.8
TkA02G168600PF01535PPR26512.4e-34115.9
TkA02G168600PF13812PPR_326560.0003121.5
TkA02G168600PF23276TPR_2428680.0001822.2
TkA02G168600PF13428TPR_1430511.7e-0628.8
TkA02G168600PF23276TPR_24661210.0001822.2
TkA02G168600PF10602RPN7981230.09113.2
TkA02G168600PF01535PPR991232.4e-34115.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49287拟南芥sp|O49287|PP127_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77010, mitochondrial53.800%Swiss-Prot高置信
Q9CAA8拟南芥sp|Q9CAA8|PP108_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g6893040.800%Swiss-Prot中等置信
Q5G1T1拟南芥sp|Q5G1T1|PP272_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g49170, chloroplastic35.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZUT4拟南芥sp|Q9ZUT4|PP192_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g3732035.000%Swiss-Prot中等置信
P0C8Q2拟南芥sp|P0C8Q2|PP323_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19191, mitochondrial38.900%Swiss-Prot中等置信

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