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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G135340
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 34972534-34976367 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1918 bp · TkA02G135340|TK1151|cDNA

CAAAATCGAAGCCTTTTTGATCAAATCTACAGAGAAATATATATAACTAAAATTGCTGTGATGTTGATAAACACTATGAGTTCAAAAGCAGAATAGTTGGGATAGATAAATGGTCATAAAGATTCCGTTATCAAAATGAAATCACCCACCATTCCTCTCTGCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTCTGTTTCCGCTCCACTTTTTGAAGCTTTTAACAATGGCAATGGGGGATTCAAATTGGAAGAAAAAGAAGAACCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1026 bp · TkA02G135340|TK1151|CDS

ATGAAATCACCCACCATTCCTCTCTGCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTCTGTTTCCGCTCCACTTTTTGAAGCTTTTAACAATGGCAATGGGGGATTCAAATTGGAAGAAAAAGAAGAACCCCAAATTAAAAGATCCGATTTCCCACCCGGGTTTCTTTTCGGACTAGCCACTTCTGCTTACCAAGTTGAAGGAGCTTATCTCGAAGATGGTAAATCATTAAGCAACTGGGATGTATTTTGTCATTCCGTTGGTTGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

341 aa · TkA02G135340|TK1151|PROTEIN

MKSPTIPLCFFFFIFFSVSAPLFEAFNNGNGGFKLEEKEEPQIKRSDFPPGFLFGLATSAYQVEGAYLEDGKSLSNWDVFCHSVGCGENAENGDIADDHYHLFLKDIEMMHSLGVKAYKFSISWARILPRGRFGEVNPAGILFYNKIIDNLILKGIEPFVTLFHNDYPQELEQIYGHGPWLNPEMQEDYVHLAETCFKSFGDRVKYWITINEPNVFIELSYEFGFFPPSRCSQPFGKCNAGNSDVEPLIAMHNMLLAHGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G135340
TK1151 IDTkA02G135340
OH-1004 IDLXL04_016475
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.361 / OH-1004 62.667
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G135340
位置Chr02:34972534-34976367 (+)
描述Similar to BGLU18: Beta-glucosidase 18
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61820 水解对硝基苯基β-D-葡萄糖苷、对硝基苯基β-D-半乳糖苷和天然葡萄糖苷，如柳苷、对香豆醇葡萄糖苷、苯基β-D-葡萄糖苷、木脂素苷、丁香苷和熊果苷。
Arabidopsis thaliana beta-Glucosidases BGLU45 and BGLU46 hydrolyse monolignol glucosides.2006 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2006.05.022
At1g61810 水解对硝基苯基β-D-葡萄糖苷和天然葡萄糖苷，如丁香苷、木脂素苷和对香豆醇葡萄糖苷。
Arabidopsis thaliana beta-Glucosidases BGLU45 and BGLU46 hydrolyse monolignol glucosides.2006 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2006.05.022

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0513900 水解苷类和单木质醇糖苷。 暂无已核实直接文献
Os04g0513100 可能为非活性β-葡萄糖苷酶14。 暂无已核实直接文献
Os04g0513400 水解苷类和单木质醇糖苷。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016475 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程
GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程
GO:0016137 glycoside metabolic process 生物过程
GO:0033491 coniferin metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004565 beta-galactosidase activity 分子功能
GO:0008422 beta-glucosidase activity 分子功能
GO:0033907 beta-D-fucosidase activity 分子功能
GO:0047782 coniferin beta-glucosidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61810
ath:AT4G21760
dosa:Os04g0513100
dosa:Os04g0513400
dosa:Os04g0513900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.441
排名 1 · TkA02G135340 · TK1151
溶酶体／液泡0.361
排名 2 · TkA02G135340 · TK1151
细胞质0.098
排名 3 · TkA02G135340 · TK1151
质体0.059
排名 4 · TkA02G135340 · TK1151
细胞膜0.053
排名 5 · TkA02G135340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00232Glyco_hydro_146-339 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G135340PF00232Glyco_hydro_1463397.9e-95318.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80690拟南芥sp|O80690|BGL46_ARATH Beta-glucosidase 4655.800%Swiss-Prot高置信
O80689拟南芥sp|O80689|BGL45_ARATH Beta-glucosidase 4556.200%Swiss-Prot高置信
Q7XSK0水稻sp|Q7XSK0|BGL18_ORYSJ Beta-glucosidase 1859.400%Swiss-Prot高置信
Q7XPY7水稻sp|Q7XPY7|BGL14_ORYSJ Probable inactive beta-glucosidase 1455.700%Swiss-Prot高置信
Q7XSK2水稻sp|Q7XSK2|BGL16_ORYSJ Beta-glucosidase 1654.700%Swiss-Prot高置信

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