TkA02G134750 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G134750

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 34804892-34810220 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2244 bp · TkA02G134750|TK1151|cDNA

GTGAATCCAAAATGATAGAATTGTCCGAATTCCAAAATGTCTTTCCCGTATTCCCCAATCTGGTAAAACATAAGCTATTTGGTTAGACTCGACCGAACGAATCAAGAGGCAAAATCATGAATCTTCGATCGATGTTCAAATAACCTGATCGTGTTACTCTTATGTTGTCGGCTGCGAAGTAGTTAGAGAAATAGATCAATGGAGCGAATGCTAAAAGCCGCCAGAGCGTCTGGCTCTCTCAATCTATCAAATCGCTCTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1755 bp · TkA02G134750|TK1151|CDS

ATGGAGCGAATGCTAAAAGCCGCCAGAGCGTCTGGCTCTCTCAATCTATCAAATCGCTCTCTCAAGGAAGTACCTGATGAGGTATACAAGAGTTTGGATGCAGTTGGTGAAGGTGAAAATTGGTGGGAGGCAGTTGAGTTACAAAAGCTGATATTAGCTCATAATGAGATTGAATTGCTAAAAGAAGACATAAGAAACTTACCAATGTTATCTGTACTAAATATCAGCCACAACAAGCTTTCCCACCTTCCAGCTGCTAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

584 aa · TkA02G134750|TK1151|PROTEIN

MERMLKAARASGSLNLSNRSLKEVPDEVYKSLDAVGEGENWWEAVELQKLILAHNEIELLKEDIRNLPMLSVLNISHNKLSHLPAAIGELKSLKALDVSSNLLREIPEEIGSVTSLIKFDCSSNQLKDLPCSLGDCQALSDLKASNNSLISLPEDLSNCSKMFKLDLEGNKLTALSDKLVASWTSITEINAAKNTLNGVPESIGGLSRLIRLDLHQNKISLIPSSIKGCSLLAEFYIGNNFLTSLPAEIGQLTNLGTFDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G134750`
TK1151 ID	TkA02G134750
OH-1004 ID	LXL04_016488
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	91.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G134750

位置 Chr02:34804892-34810220 (+)

描述 Similar to IRL6: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 6

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0826600`	富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016488 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os02g0826600

gga:424713

hsa:55631

xla:444098

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.691

排名 1 · TkA02G134750 · TK1151

细胞核0.321

排名 2 · TkA02G134750 · TK1151

细胞膜0.092

排名 3 · TkA02G134750 · TK1151

高尔基体0.074

排名 4 · TkA02G134750 · TK1151

内质网0.045

排名 5 · TkA02G134750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24048LRR_NXF1-512-23 aa

PF13855LRR_813-33 aa

PF00560LRR_113-27 aa

PF12799LRR_414-26 aa

PF29252LRR_NLRC443-90 aa

PF13855LRR_846-103 aa

PF12799LRR_446-84 aa

PF00560LRR_147-67 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G134750	`PF24048`	LRR_NXF1-5	12	23	0.013	15.8
TkA02G134750	`PF13855`	LRR_8	13	33	1.2e-49	166.6
TkA02G134750	`PF00560`	LRR_1	13	27	1.9e-28	93.1
TkA02G134750	`PF12799`	LRR_4	14	26	5.8e-38	128.8
TkA02G134750	`PF29252`	LRR_NLRC4	43	90	3.1	7.6
TkA02G134750	`PF13855`	LRR_8	46	103	1.2e-49	166.6
TkA02G134750	`PF12799`	LRR_4	46	84	5.8e-38	128.8
TkA02G134750	`PF00560`	LRR_1	47	67	1.9e-28	93.1
TkA02G134750	`PF14580`	LRR_9	47	100	9.5e-05	22.8
TkA02G134750	`PF13516`	LRR_6	47	57	0.00048	20.7
TkA02G134750	`PF25013`	LRR_Zer-1	55	83	0.052	14.4
TkA02G134750	`PF24048`	LRR_NXF1-5	57	106	0.013	15.8
TkA02G134750	`PF23952`	LRR_EndoS	61	101	0.00078	20.4
TkA02G134750	`PF23598`	LRR_14	62	189	4.4e-30	105.3
TkA02G134750	`PF23286`	LRR_13	67	133	1.8e-08	35.1
TkA02G134750	`PF24758`	LRR_At5g56370	67	101	1.1	9.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6K7R2`	水稻	sp\|Q6K7R2\|PIRL6_ORYSJ Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 6	68.200%	Swiss-Prot	高置信

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