TkA02G104930 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G104930

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 27459372-27463979 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3233 bp · TkA02G104930|TK1151|cDNA

TTATAAAGGAGATGTTCTCAACAAAATTAAATGTTGACAGAGTCCGCATCTAAAAACTAAATTTGTTAGATGATTTTTGCTATTTTAAAATACTTGAAAGTATGTAAAAGGTAAAAATGTAATTTAAAAAAATAACTCGAATAAGCTCACAAATTTTTCAAAAAACTCAATAAAGTATCCAACCGGGTCCCAAAAGCGCATCGTCTCTCACAAATAATCATCTGTTCACACTCAACTCAGACGACGCGTTGACCTGGAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2559 bp · TkA02G104930|TK1151|CDS

ATGGCTTTTCTCGTAGATTCCCTCCTTTCCGAATCCATCACCAAACTAACAACACTGGTAATACATGTATATCAAACCACCGCCAATTTCAAGCCAGAACTGAAGCTACTCCGAGACACTTTGGGGAGAATCACACCCATCATTGTCGATATAGTGAATACGAATCGGAAACTAGATCGTTCAGAGGGAGAGTGTCAGATGTTCATAAAAGAAATTGAAGAAGCCGCAAAACTCGTCGCCAAATGTTCGAAAGTAAAGAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

852 aa · TkA02G104930|TK1151|PROTEIN

MAFLVDSLLSESITKLTTLVIHVYQTTANFKPELKLLRDTLGRITPIIVDIVNTNRKLDRSEGECQMFIKEIEEAAKLVAKCSKVKRNVIKKFTYSLKLKDFNGKLLRFFQIEVQAIQTRGITETLLGVNDVKIRMDSLSLDLQDMRQRTSWIGNYSGSMSTSVSTSISTRTDRSGCDNMERERYGWRVPALPSGIVAFDEPLAKLKAEIVAGIDNEDDSNLDPMDCDDRSVLVVAAAGGCGKTTLVKMLCHDPEIKGKF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G104930`
TK1151 ID	TkA02G104930
OH-1004 ID	LXL04_016759
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G104930

位置 Chr02:27459372-27463979 (-)

描述 Similar to At5g66900: Probable disease resistance protein At5g66900

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g66900`	可能的疾病抗性蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g66910`	可能的疾病抗性蛋白。	暂无已核实直接文献
`At4g33300`	可能的疾病抗性蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g04720`	可能的疾病抗性蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g47280`	潜在的抗病蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016759 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0012505 endomembrane system 细胞组分

GO:0048046 apoplast 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0043531 ADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G33300

ath:AT5G04720

ath:AT5G47280

ath:AT5G66900

ath:AT5G66910

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.565

排名 1 · TkA02G104930 · TK1151

细胞质0.217

排名 2 · TkA02G104930 · TK1151

细胞核0.151

排名 3 · TkA02G104930 · TK1151

内质网0.121

排名 4 · TkA02G104930 · TK1151

溶酶体／液泡0.057

排名 5 · TkA02G104930 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_49-21 aa

PF05659RPW811-136 aa

PF23286LRR_1334-66 aa

PF22794jr-ZPR173-103 aa

PF00931NB-ARC228-376 aa

PF25199nSTAND_NTPase5228-267 aa

PF24883NPHP3_N228-261 aa

PF25201nSTAND6229-259 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G104930	`PF12799`	LRR_4	9	21	0.14	13.1
TkA02G104930	`PF05659`	RPW8	11	136	1.5e-25	90.1
TkA02G104930	`PF23286`	LRR_13	34	66	2.5e-05	24.8
TkA02G104930	`PF22794`	jr-ZPR1	73	103	0.15	12.7
TkA02G104930	`PF00931`	NB-ARC	228	376	1e-15	58.4
TkA02G104930	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	228	267	0.029	14.9
TkA02G104930	`PF24883`	NPHP3_N	228	261	0.12	13.3
TkA02G104930	`PF25201`	nSTAND6	229	259	0.024	15.4
TkA02G104930	`PF13401`	AAA_22	229	322	0.04	14.9
TkA02G104930	`PF20720`	nSTAND3	229	255	0.12	12.8
TkA02G104930	`PF13191`	AAA_16	231	323	0.28	12.4
TkA02G104930	`PF01443`	Viral_helicase1	233	253	0.085	13.4
TkA02G104930	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	299	348	0.029	14.9
TkA02G104930	`PF22794`	jr-ZPR1	299	341	0.15	12.7
TkA02G104930	`PF24883`	NPHP3_N	332	346	0.12	13.3
TkA02G104930	`PF25201`	nSTAND6	387	449	0.024	15.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FKZ1`	拟南芥	sp\|Q9FKZ1\|DRL42_ARATH Probable disease resistance protein At5g66900	36.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FKZ0`	拟南芥	sp\|Q9FKZ0\|DRL43_ARATH Probable disease resistance protein At5g66910	32.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SZA7`	拟南芥	sp\|Q9SZA7\|DRL29_ARATH Probable disease resistance protein At4g33300	30.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LZ25`	拟南芥	sp\|Q9LZ25\|DRL30_ARATH Probable disease resistance protein At5g04720	29.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LVT1`	拟南芥	sp\|Q9LVT1\|DRL39_ARATH Putative disease resistance protein At5g47280	34.100%	Swiss-Prot	中等置信

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