TkA02G082690 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G082690

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 21476305-21478266 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1063 bp · TkA02G082690|TK1151|cDNA

TAAATATCTCTCCTTTCTGTTGAACAATGTAGCAGGCACCTTGTTTTATTTTACCAAATAACTAACGTCTCTTTATAAGAAACCCAGTCGTTGTGCAAAATCAGGGATGCCAGCGGCGTTGAACGCTGTAATGAACGGCGGATTAACAGGCGGAGGTGCCACCGCGGCCCAAAAAACGGTGCTGATAACAGGTGTTAGCAGAGGTCTTGGCAAAGCCCTAGCAGTAGAAATCGCGAAGAGAGGCCATTCCGTTATCGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

768 bp · TkA02G082690|TK1151|CDS

ATGCCAGCGGCGTTGAACGCTGTAATGAACGGCGGATTAACAGGCGGAGGTGCCACCGCGGCCCAAAAAACGGTGCTGATAACAGGTGTTAGCAGAGGTCTTGGCAAAGCCCTAGCAGTAGAAATCGCGAAGAGAGGCCATTCCGTTATCGGCTGCTCTCGCTCTCAAGAGAAGCTCGATTCTCTCCAGTCGGAGCTCTGTTCTGGACCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCCGAAAAACACCTCTTCTTCAACGCCGACGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

255 aa · TkA02G082690|TK1151|PROTEIN

MPAALNAVMNGGLTGGGATAAQKTVLITGVSRGLGKALAVEIAKRGHSVIGCSRSQEKLDSLQSELCSGPSSSSSSSEKHLFFNADVCSNSSVQELARAVMEKKGVPDIIVNNAGTINKNNRLWEVPEEEFNAVIDTNLKGVANILRHFIPLMIEKKQGVLVNMSSGWGRSAAAQVAPYCASKWAVEGLTKSVAKELPAGMAIVALNPGVINTEMLQSCFGTSSSLYQAPDSWAPKAADMILNLTVADNGASLSV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G082690`
TK1151 ID	TkA02G082690
OH-1004 ID	LXL04_021372
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 26.275 / OH-1004 39.181 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G082690

位置 Chr02:21476305-21478266 (+)

描述 Similar to At1g10310: NADPH-dependent pterin aldehyde reductase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g10310`	NADPH依赖的蝶呤醛还原酶，参与叶酸代谢过程中蝶呤醛的回收。	Folate salvage in plants: pterin aldehyde reduction is mediated by multiple non-specific aldehyde reductases.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03143.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021372 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006760 folic acid-containing compound metabolic process 生物过程

GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004316 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity 分子功能

GO:0016616 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

GO:0051287 NAD binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G10310

sam:MW1114

sep:SE_0906

ser:SERP0797

tma:TM1724

tmi:THEMA_05620

tmm:Tmari_1732

tmw:THMA_1766

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.468

排名 1 · TkA02G082690 · TK1151

细胞质0.332

排名 2 · TkA02G082690 · TK1151

细胞核0.178

排名 3 · TkA02G082690 · TK1151

过氧化物酶体0.147

排名 4 · TkA02G082690 · TK1151

质体0.082

排名 5 · TkA02G082690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00257Dehydrin15-78 aa

PF00106adh_short23-218 aa

PF08659KR24-196 aa

PF04321RmlD_sub_bind24-63 aa

PF01370Epimerase25-206 aa

PF16363GDP_Man_Dehyd26-152 aa

PF13561adh_short_C229-229 aa

PF03807F420_oxidored34-72 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G082690	`PF00257`	Dehydrin	15	78	0.26	12.4
TkA02G082690	`PF00106`	adh_short	23	218	1.9e-46	158.8
TkA02G082690	`PF08659`	KR	24	196	1.2e-07	32.5
TkA02G082690	`PF04321`	RmlD_sub_bind	24	63	0.13	12.0
TkA02G082690	`PF01370`	Epimerase	25	206	1e-07	32.3
TkA02G082690	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	26	152	0.034	14.3
TkA02G082690	`PF13561`	adh_short_C2	29	229	6.7e-33	114.9
TkA02G082690	`PF03807`	F420_oxidored	34	72	0.0015	19.8
TkA02G082690	`PF03446`	NAD_binding_2	34	99	0.026	15.3
TkA02G082690	`PF00213`	OSCP	49	127	0.041	14.7
TkA02G082690	`PF03807`	F420_oxidored	86	115	0.0015	19.8
TkA02G082690	`PF10491`	Nrf1_DNA-bind	113	176	0.23	11.9
TkA02G082690	`PF00213`	OSCP	126	159	0.041	14.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SY73`	拟南芥	sp\|Q9SY73\|PTALR_ARATH NADPH-dependent pterin aldehyde reductase	71.500%	Swiss-Prot	高置信

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