TkA02G071470 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G071470

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 18533765-18539974 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3582 bp · TkA02G071470|TK1151|cDNA

TTGTTATTGACTGGTGTCATTCCTAATTTCATTTTCTTCCGCTCGTATAACCATTATCAACCGAGGAGGAAGATCTATCAATCAACCGGTGTTAGAACATGGCGGCAGCTCGTTCAATCTTCGTTGGACTCATCCGGAATTACAGCAGACAGACGACACCTATAGTTCACTGAGGTTCCTGTCTTCGTCGTCTTCATCTTCAACGGCTTCGAAATTAGAAATCGTCTATGACGAATCGCCGATTTCGGTTCCAGAAGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

489 bp · TkA02G071470|TK1151|CDS

ATGAAGATTCTCAATCTTTTCATCTTGTTATGGCTTTGTAGTGGTGGGAGGTTGCTTGATCGTATGTGGGAAGACGGTTTGTTTTCAGAGCAAAAAGCCGCTAATTTAATCAAAGAATTGATGTTGGTTCTTAAATATTGTCATGATATGGGTGTCATTCATCGCGATATAAAACCCGAAAATATCCTTCTTTCTGCTAATGGTACCATAAAGCTTGCCGATTTCGGATTGGCCGCTAGAATCGCTAACGGTCAGAGTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

162 aa · TkA02G071470|TK1151|PROTEIN

MKILNLFILLWLCSGGRLLDRMWEDGLFSEQKAANLIKELMLVLKYCHDMGVIHRDIKPENILLSANGTIKLADFGLAARIANGQSLYGVVGSPAYVAPEVLSGGYTEKVDIWSAGVVLHAVLVGYLPFGGDSVNTVFEAVKNVSVDFQGNFGNRYLNLRVI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G071470`
TK1151 ID	TkA02G071470
OH-1004 ID	LXL04_031130
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	70.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 84.568 / OH-1004 28.842 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G071470

位置 Chr02:18533765-18539974 (-)

描述 Similar to PEPKR2: Serine/threonine-protein kinase PEPKR2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g12680`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 PEPKR2。	暂无已核实直接文献
`At1g76040`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At4g09570`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	A novel yeast two-hybrid approach to identify CDPK substrates: characterization of the interaction between AtCPK11 and AtDi19, a nuclear zinc finger protein.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.01.013 Two calcium-dependent protein kinases, CPK4 and CPK11, regulate abscisic acid signal transduction in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050666
`At1g08650`	一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031130 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能

GO:0005509 calcium ion binding 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12680

ath:AT1G50700

ath:AT1G76040

dosa:Os03g0788500

gmx:547825

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.668

排名 1 · TkA02G071470 · TK1151

细胞核0.413

排名 2 · TkA02G071470 · TK1151

线粒体0.065

排名 3 · TkA02G071470 · TK1151

内质网0.061

排名 4 · TkA02G071470 · TK1151

过氧化物酶体0.054

排名 5 · TkA02G071470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase6-140 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr6-143 aa

PF12330Haspin_kinase6-82 aa

PF06293Kdo23-75 aa

PF10707YrbL-PhoP_reg31-69 aa

PF07387Seadorna_VP737-75 aa

PF14531Kinase-like40-134 aa

PF03109ABC141-83 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G071470	`PF00069`	Pkinase	6	140	8.8e-42	144.0
TkA02G071470	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	6	143	2.8e-19	70.2
TkA02G071470	`PF12330`	Haspin_kinase	6	82	0.042	13.6
TkA02G071470	`PF06293`	Kdo	23	75	0.018	15.2
TkA02G071470	`PF10707`	YrbL-PhoP_reg	31	69	0.14	12.6
TkA02G071470	`PF07387`	Seadorna_VP7	37	75	0.056	13.2
TkA02G071470	`PF14531`	Kinase-like	40	134	2.5e-05	24.4
TkA02G071470	`PF03109`	ABC1	41	83	0.00028	20.9
TkA02G071470	`PF17667`	Pkinase_fungal	48	104	0.055	12.9
TkA02G071470	`PF01636`	APH	48	76	0.15	12.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W490`	拟南芥	sp\|Q8W490\|PEPK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase PEPKR2	69.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q8RWL2`	拟南芥	sp\|Q8RWL2\|CDPKT_ARATH Calcium-dependent protein kinase 29	45.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q38869`	拟南芥	sp\|Q38869\|CDPK4_ARATH Calcium-dependent protein kinase 4	45.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SPK4`	拟南芥	sp\|Q9SPK4\|PPCK1_ARATH Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 1	48.900%	Swiss-Prot	中等置信

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