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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G063560
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16534695-16536395 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1419 bp · TkA02G063560|TK1151|cDNA

AGGCTATGGGATATAACCTCCGGTGGGTTAGCAAGCTTCACCACCTATTTCTCCTTCGTAATAGACTCAGACTCAGAAGCATATTACGGAGATGGGCTCACATTCTTTCCCGCCGAGAACAATTCCGAGATATCCGCCGGTTCATCCATGCGGCTTCCGATCACCAACTCAAGAAGTACGCACCCGTTTATTGCAGTCGAATTTGATACATTTGCAAACCCGAAATGGGATCCGAGAAACTCTAGTAATGATTTGATCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1419 bp · TkA02G063560|TK1151|CDS

AGGCTATGGGATATAACCTCCGGTGGGTTAGCAAGCTTCACCACCTATTTCTCCTTCGTAATAGACTCAGACTCAGAAGCATATTACGGAGATGGGCTCACATTCTTTCCCGCCGAGAACAATTCCGAGATATCCGCCGGTTCATCCATGCGGCTTCCGATCACCAACTCAAGAAGTACGCACCCGTTTATTGCAGTCGAATTTGATACATTTGCAAACCCGAAATGGGATCCGAGAAACTCTAGTAATGATTTGATCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

472 aa · TkA02G063560|TK1151|PROTEIN

RLWDITSGGLASFTTYFSFVIDSDSEAYYGDGLTFFPAENNSEISAGSSMRLPITNSRSTHPFIAVEFDTFANPKWDPRNSSNDLIGDHVGISINSLTSVASQKWYSNVIGGGVCQAWIKYDSLSKNLSVSFTGFQNNIIVRQELHYVIDLKVVLPEWVIFGFSAATGNAFQKNTVKSWGFNSSDFQIDANDVLPRKNKTTLAVSLVVGLCVMIIFLALIAFCVWRKKKSEGEQGFDVGMNNEFERITGPKKFSYRELAR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G063560
TK1151 IDTkA02G063560
OH-1004 IDLXL04_017231
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.576 / OH-1004 77.593
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G063560
位置Chr02:16534695-16536395 (+)
描述Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10530 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g65600 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At4g02410 含L型凝集素结构域的受体激酶 IV.3。 暂无已核实直接文献
At5g06740 可能的L型凝集素结构域受体激酶 S.5。 暂无已核实直接文献
At1g15530 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017231 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G55550
ath:AT5G06740
ath:AT5G10530
ath:AT5G55830
ath:AT5G65600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.763
排名 1 · TkA02G063560 · TK1151
内质网0.119
排名 2 · TkA02G063560 · TK1151
细胞质0.079
排名 3 · TkA02G063560 · TK1151
溶酶体／液泡0.074
排名 4 · TkA02G063560 · TK1151
细胞核0.038
排名 5 · TkA02G063560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB1-187 aa
PF03388Lectin_leg-like2-173 aa
PF18483Lectin_L-type_dom12-177 aa
PF01034Syndecan102-115 aa
PF06024Orf78184-231 aa
PF14610Psg1190-230 aa
PF31037DUF8777195-230 aa
PF08693SKG6197-234 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G063560PF00139Lectin_legB11871.3e-45156.6
TkA02G063560PF03388Lectin_leg-like21730.01615.3
TkA02G063560PF18483Lectin_L-type_dom121771.2e-0629.3
TkA02G063560PF01034Syndecan1021150.08913.5
TkA02G063560PF06024Orf781842310.1513.1
TkA02G063560PF14610Psg11902300.04314.3
TkA02G063560PF31037DUF87771952300.005117.6
TkA02G063560PF08693SKG61972340.004516.7
TkA02G063560PF14914LRRC37AB_C1972300.08713.5
TkA02G063560PF28764GEX3_C1972310.09513.8
TkA02G063560PF22812CR_prot_dom_plant1982290.2112.8
TkA02G063560PF01034Syndecan2002320.08913.5
TkA02G063560PF28839F59B103_C2012310.04814.0
TkA02G063560PF00069Pkinase2663033.7e-2589.5
TkA02G063560PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2683032.2e-2073.8
TkA02G063560PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3004492.2e-2073.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LXA5拟南芥sp|Q9LXA5|LRK91_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.138.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LSL5拟南芥sp|Q9LSL5|LRK92_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.236.900%Swiss-Prot中等置信
O81292拟南芥sp|O81292|LRK43_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.330.900%Swiss-Prot中等置信
Q9FG33拟南芥sp|Q9FG33|LRKS5_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.531.700%Swiss-Prot中等置信
Q9M9E0拟南芥sp|Q9M9E0|LRKS1_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.131.200%Swiss-Prot中等置信

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