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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G063250
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16479190-16480908 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1680 bp · TkA02G063250|TK1151|cDNA

ATGGGGCTTCCGGTCAATGGCACCACCATTAATTCCACGAACCCATTTGTGGCAGTGGAGTTTGATACTTTTCAGAACCTTAACTGGGATCCAAGAGACTCTAACAATACTCTAATTGGTGATCATGTAGGTATTAGCATTAGTTCTCTTGCTTCAGTTAGGCATCAGAAATGGTTTAGTAATATAACTGGTGGGAGAGTTTGTCAAGCTTGGATTACATATGATTCTGTTTCGCAAAATCTTAGTGTTTCGTTTACGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1680 bp · TkA02G063250|TK1151|CDS

ATGGGGCTTCCGGTCAATGGCACCACCATTAATTCCACGAACCCATTTGTGGCAGTGGAGTTTGATACTTTTCAGAACCTTAACTGGGATCCAAGAGACTCTAACAATACTCTAATTGGTGATCATGTAGGTATTAGCATTAGTTCTCTTGCTTCAGTTAGGCATCAGAAATGGTTTAGTAATATAACTGGTGGGAGAGTTTGTCAAGCTTGGATTACATATGATTCTGTTTCGCAAAATCTTAGTGTTTCGTTTACGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

559 aa · TkA02G063250|TK1151|PROTEIN

MGLPVNGTTINSTNPFVAVEFDTFQNLNWDPRDSNNTLIGDHVGISISSLASVRHQKWFSNITGGRVCQAWITYDSVSQNLSVSFTGFRNNTIVRQVGLEYTVDLRAVLPETVIFGFSAATGALFEKNNVRSWSFSGSDLQVDENSNNNSKVGLVVGLPIGVTFMVVVAFVLWRRGKKKESREHEDEDGELGFDIEMNNEFEMGTGPKRFSYQELARSTNEFSDNEKLGEGGFGGVYRGFLKNSNTYIAVKRVSKSSKQG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G063250
TK1151 IDTkA02G063250
OH-1004 IDLXL04_017249
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 82.421
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G063250
位置Chr02:16479190-16480908 (+)
描述Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10530 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g65600 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At3g55550 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At3g53810 花粉发育期间必需。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0531400 含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017249 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G55550
ath:AT5G06740
ath:AT5G10530
ath:AT5G55830
ath:AT5G65600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.803
排名 1 · TkA02G063250 · TK1151
细胞质0.097
排名 2 · TkA02G063250 · TK1151
内质网0.089
排名 3 · TkA02G063250 · TK1151
细胞核0.060
排名 4 · TkA02G063250 · TK1151
溶酶体／液泡0.038
排名 5 · TkA02G063250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB1-148 aa
PF18483Lectin_L-type_dom11-131 aa
PF08693SKG6141-208 aa
PF14610Psg1141-178 aa
PF20485DUF6724150-190 aa
PF29481SKG1151-191 aa
PF26472DUF8147154-184 aa
PF00069Pkinase223-489 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G063250PF00139Lectin_legB11484.9e-35122.0
TkA02G063250PF18483Lectin_L-type_dom111311.8e-0525.4
TkA02G063250PF08693SKG61412080.0001521.6
TkA02G063250PF14610Psg11411780.2112.1
TkA02G063250PF20485DUF67241501900.1412.7
TkA02G063250PF29481SKG11511910.0008420.0
TkA02G063250PF26472DUF81471541840.06714.1
TkA02G063250PF00069Pkinase2234891.3e-52179.6
TkA02G063250PF03109ABC12242710.01415.3
TkA02G063250PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2254911.9e-50172.3
TkA02G063250PF03109ABC12943750.01415.3
TkA02G063250PF01636APH3303570.1312.7
TkA02G063250PF17667Pkinase_fungal3394080.000519.6
TkA02G063250PF14531Kinase-like3414310.1112.4
TkA02G063250PF08693SKG65255490.0001521.6
TkA02G063250PF29481SKG15255470.0008420.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LXA5拟南芥sp|Q9LXA5|LRK91_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.150.400%Swiss-Prot高置信
Q9LSL5拟南芥sp|Q9LSL5|LRK92_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.250.800%Swiss-Prot高置信
Q9M2S4拟南芥sp|Q9M2S4|LRKS4_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.442.200%Swiss-Prot中等置信
Q9M345拟南芥sp|Q9M345|LRK42_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.240.800%Swiss-Prot中等置信
Q7XUN6水稻sp|Q7XUN6|SIT2_ORYSJ L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT241.400%Swiss-Prot中等置信

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