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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G043030
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 10925764-10948213 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

8132 bp · TkA02G043030|TK1151|cDNA

CTTGTCCAAATTTAAATAATCAAAGCGCCATAGACGTTTTTACACACACCTACCAAATTTCAAATTTCTCCACAAATTCAAACGACAAAACCCCCTCATTATGGTTTCTTGATGTGTGTGAGAGAGATTGAGGGCTAGAGTGAGAGAAGGAGAGATTTTGAATCAACATTCATTATTTTTCATGTAGAGCTAAAAACACATGTAATCCTACAGTTTGTACTTTGTATTGATTGTTTTGGAACAATTGCAGGAGTTGGTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

7653 bp · TkA02G043030|TK1151|CDS

ATGTTGAGAGATCTCAATTTCTTGCGTCGGAATTCTGGTAAAAACACTGATACCGATGAACCTGAAAATGTGCCTGTAAACGGCAAATTTCATGAATCATCAGTAGCTCAGATGGGTGCCGACTCTTCATCAAGACCACCATTGAGTGCAATTCGAGACCCTGTGCAAAACCCTAGCAAGCGTGAACAGGAATCAGCGTTTAAAAACACGAAACTCGATAGAACGCCCACTAAGGTCAATGCTACGATGAAAACTCCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2550 aa · TkA02G043030|TK1151|PROTEIN

MLRDLNFLRRNSGKNTDTDEPENVPVNGKFHESSVAQMGADSSSRPPLSAIRDPVQNPSKREQESAFKNTKLDRTPTKVNATMKTPEKQGGLARNRYGWASDSKHEVKNGNMNMNITTSTPRSCRTVGRAVSSGYSECNLTPNTQCNSTQNTPTKSVNKPPNPGLSSRPPISGGVRNNGSFAALSRGFQNTYPHVNTIEVPHFDLKEDPSFWMDHNVQVLIRIRPLNNMELSAQGYNRCLKQDSAQCLTWVGQPETRFKF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G043030
TK1151 IDTkA02G043030
OH-1004 IDLXL04_017448
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.048
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G043030
位置Chr02:10925764-10948213 (+)
描述Similar to KIN12D: Kinesin-like protein KIN-12D
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g19050 通过适当的成膜体引导参与胞质分裂的空间控制。
Two kinesins are involved in the spatial control of cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.034
At3g17360 通过适当的成膜体引导参与胞质分裂的空间控制。
Two kinesins are involved in the spatial control of cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.034
Tangled localization at the cortical division site of plant cells occurs by several mechanisms.2011 · DOI: 10.1242/jcs.073676

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0590500 类驱动蛋白KIN-12F。 暂无已核实直接文献
Os07g0638000 类动力蛋白 KIN-12E。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q75LL2 类驱动蛋白KIN-12G。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017448 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0080175 phragmoplast microtubule organization 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0032153 cell division site 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G17360
ath:AT3G19050
dosa:Os12g0590500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.645
排名 1 · TkA02G043030 · TK1151
细胞核0.241
排名 2 · TkA02G043030 · TK1151
细胞膜0.134
排名 3 · TkA02G043030 · TK1151
高尔基体0.099
排名 4 · TkA02G043030 · TK1151
内质网0.047
排名 5 · TkA02G043030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd216-368 aa
PF00225Kinesin222-553 aa
PF30550RR_cyano_HH639-665 aa
PF15081DUF4548754-849 aa
PF16796Microtub_bd931-970 aa
PF00225Kinesin935-980 aa
PF16796Microtub_bd1050-1113 aa
PF00225Kinesin1085-1140 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G043030PF16796Microtub_bd2163685.6e-2175.8
TkA02G043030PF00225Kinesin2225536.7e-111371.1
TkA02G043030PF30550RR_cyano_HH6396650.1512.6
TkA02G043030PF15081DUF45487548490.1212.9
TkA02G043030PF16796Microtub_bd9319705.6e-2175.8
TkA02G043030PF00225Kinesin9359806.7e-111371.1
TkA02G043030PF16796Microtub_bd105011135.6e-2175.8
TkA02G043030PF00225Kinesin108511406.7e-111371.1
TkA02G043030PF00225Kinesin139214636.7e-111371.1
TkA02G043030PF13613HTH_Tnp_4147914890.03714.4
TkA02G043030PF07756DUF1612150615410.000521.0
TkA02G043030PF13613HTH_Tnp_4152915430.03714.4
TkA02G043030PF13613HTH_Tnp_4157815890.03714.4
TkA02G043030PF07756DUF1612161216620.000521.0
TkA02G043030PF13613HTH_Tnp_4164916590.03714.4
TkA02G043030PF07756DUF1612168017260.000521.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q27IK6拟南芥sp|Q27IK6|KN12D_ARATH Kinesin-like protein KIN-12D38.500%Swiss-Prot中等置信
Q27IK7拟南芥sp|Q27IK7|KN12C_ARATH Kinesin-like protein KIN-12C52.300%Swiss-Prot中等置信
B9GE13水稻sp|B9GE13|KN12F_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12F36.000%Swiss-Prot中等置信
B9FUF9水稻sp|B9FUF9|KN12E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12E58.800%Swiss-Prot低置信
Q75LL2水稻sp|Q75LL2|KN12G_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-12G52.700%Swiss-Prot低置信

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