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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G017960
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 4232020-4235876 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3471 bp · TkA02G017960|TK1151|cDNA

CTAAATTTAGGTCTCGGATATTTTGTGTCCATCCACAACCATTCAGTGGGATCTGGGCCGGATCCCATCCCATTCCTAAATTCTCCATTCATGTGTCATTTTGGCGGACTCTTAAGATAATATTGAAGAAGTTTGTTAACACTGTGGATACTCTGCTTTCTGAGTTAAAAATTGAGTTAAAATTGAAGAGAAGTTATAGAGTTGGATTGAAAATGCTACACTCGCCAAGATTTCTCTGAAGGGTATAAACCTTAAAATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2601 bp · TkA02G017960|TK1151|CDS

ATGAGATCCTGCATAAGAGATGCTGAAAGAAAACAATTGAAGAGTGAACTGGTTGAAACATGGGTGAGACAAGTGCGGGAAGTTGCCCAGAAAATCGAAGATGTGTTAGACGAGTATGTTTACTATCAAGATTTGGGAGAAGAAAAAAAGGGGTTCAAGAATTTGATGCAAGACATCATCAAAGTTCCAATGCACATGAGCAGAAAACGTAAAATATCTATGAAGCTTCAAAAGCTTAAAGCCGAGGTTCGTGAAGTTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

866 aa · TkA02G017960|TK1151|PROTEIN

MRSCIRDAERKQLKSELVETWVRQVREVAQKIEDVLDEYVYYQDLGEEKKGFKNLMQDIIKVPMHMSRKRKISMKLQKLKAEVREVCERRKKYTFDEKTDDWRGRNASIDWWQRQEMFVDEDEIVGMDDNKNKLMEWLMEDDPRRMVISVVGMGGLGKTTLVTKVYNDQAIQRCFDCWAWVSVSQTKGVDELLRSMIKKLFGRKRETLPLDLGLMSYRELVEMLIDYLHKKRYVIILDDVWNILLWSRIRSAFPENGLGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G017960
TK1151 IDTkA02G017960
OH-1004 IDLXL04_017658
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 95.585
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G017960
位置Chr02:4232020-4235876 (-)
描述Similar to RPM1: Disease resistance protein RPM1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g07040 对病原体特异性识别由铜绿假单胞菌产生的AvrRpm1型III效应子非致病蛋白的抗性（R）蛋白。
The Arabidopsis thaliana RPM1 disease resistance gene product is a peripheral plasma membrane protein that is degraded coincident with the hypersensitive response.1998 · DOI: 10.1073/pnas.95.26.15849
At5g35450 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g43470 抗病蛋白。
Intragenic recombination and diversifying selection contribute to the evolution of downy mildew resistance at the RPP8 locus of Arabidopsis.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.11.1861
At3g50950 CC-NB-LRR 受体样蛋白，必需用于识别病原细菌Ⅲ型效应蛋白（T3E），如假单胞菌HopZ1a和HopF2a及十字花叶黄单胞菌（Xcc）XopAC/AvrAC；这种识别需要ZED1相关激酶（如PBL2、ZRK3和ZED1/ZRK5）。
Allele-specific virulence attenuation of the Pseudomonas syringae HopZ1a type III effector via the Arabidopsis ZAR1 resistance protein.2010 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1000894
At1g59620 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017658 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002230 positive regulation of defense response to virus by host 生物过程
GO:0002239 response to oomycetes 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0071446 cellular response to salicylic acid stimulus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53350
ath:AT3G07040
ath:AT5G35450
ath:AT5G43470
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.606
排名 1 · TkA02G017960 · TK1151
细胞质0.279
排名 2 · TkA02G017960 · TK1151
细胞核0.156
排名 3 · TkA02G017960 · TK1151
内质网0.057
排名 4 · TkA02G017960 · TK1151
质体0.028
排名 5 · TkA02G017960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18052Rx_N1-51 aa
PF00931NB-ARC51-89 aa
PF28416Kizuna_N59-93 aa
PF00931NB-ARC128-301 aa
PF13481AAA_25135-165 aa
PF25201nSTAND6143-207 aa
PF13401AAA_22145-240 aa
PF13191AAA_16145-240 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G017960PF18052Rx_N1512.1e-1247.7
TkA02G017960PF00931NB-ARC51895.5e-47160.3
TkA02G017960PF28416Kizuna_N59932.09.1
TkA02G017960PF00931NB-ARC1283015.5e-47160.3
TkA02G017960PF13481AAA_251351650.2311.8
TkA02G017960PF25201nSTAND61432070.002118.8
TkA02G017960PF13401AAA_221452405.4e-0524.2
TkA02G017960PF13191AAA_161452407e-0524.1
TkA02G017960PF13173AAA_141452650.03614.8
TkA02G017960PF13671AAA_331472570.04314.9
TkA02G017960PF05729NACHT1472000.1113.0
TkA02G017960PF23559WHD_DRP3924633e-2279.1
TkA02G017960PF13401AAA_224274705.4e-0524.2
TkA02G017960PF29857DUF85924605210.212.2
TkA02G017960PF24758LRR_At5g563704866050.02614.9
TkA02G017960PF23598LRR_145208251.5e-49169.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39214拟南芥sp|Q39214|RPM1_ARATH Disease resistance protein RPM137.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FJB5拟南芥sp|Q9FJB5|RP8L3_ARATH Disease resistance RPP8-like protein 325.900%Swiss-Prot低置信
Q8W4J9拟南芥sp|Q8W4J9|RPP8_ARATH Disease resistance protein RPP825.000%Swiss-Prot低置信
Q38834拟南芥sp|Q38834|R13L4_ARATH Disease resistance RPP13-like protein 432.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LQ54拟南芥sp|Q9LQ54|DRL12_ARATH Probable disease resistance protein At1g5962026.000%Swiss-Prot低置信

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