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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G015360
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 3526011-3535294 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1053 bp · TkA02G015360|TK1151|cDNA

CTGAGAAAAAGGGGAATTGTTCTTGCATCAAAGAAATCTTCGCGAACTGCAGCTGAGGGTTTGCTTGCTCTTGCACAGAATGATACAAAGGCTGCTGTTATTGAACTAAACTGTGAAACTGATTTTGTTGCAAGAAATGAAATATTTCAGTACCTGGCGTTATCTTTGGCCAAGCTGGCATTATCTGCTGAAAGTTCAGGACAAGTAACCTCTGTTGGACTTGAGAGTTTGGAGGAGTTGAAAATTAACATTGACCATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2211 bp · TkA02G015360|TK1151|CDS

ATGAACCCCACGTCGCTCAAGAGCCGCAACAGTGGGAATGTGCCCAGCAGCCGCCCTCCAGATGAAGCACAAGACCTTAATAGGGACCTCCTTTTTCCAATGAGGAGCTTTAGAGGTGGACGTGACAGACATTGGAAGGACTATCCTTTGAGACCGGAAGAGAAAAGTCACCATGGCCGGAGCACTGCACCTCCTTCAAGACATCTGTGGGTTGGGAATCTATCTCATACCTTAACTGAACGTGCATTGAGCAATCACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

736 aa · TkA02G015360|TK1151|PROTEIN

MNPTSLKSRNSGNVPSSRPPDEAQDLNRDLLFPMRSFRGGRDRHWKDYPLRPEEKSHHGRSTAPPSRHLWVGNLSHTLTERALSNHFRQFGELESVGFSPGRSYAFVNFIEVSAAFAAIGALQGFILAGNALRIEFTKAEKSPSRDEDDKYLHRREEFPPRDSRIRHSNSGSDPNYQNQKPSTKEDEEPNEVLWIGFPQSLKVDEHSFYTAFSPFGEIEKVSSYPGRTYAFVRYKHINSAIRAKDNLQGKLFGNPRVHIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G015360
TK1151 IDTkA02G015360
OH-1004 IDLXL04_017681
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.342 / OH-1004 91.576
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G015360
位置Chr02:3526011-3535294 (-)
描述Similar to FPA: Flowering time control protein FPA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g11120 与 EF-Tu.GDP 复合物结合并诱导 GDP 向 GTP 的交换。 暂无已核实直接文献
At2g43410 通过降低FLOWERING LOCUS C mRNA水平，在自主开花途径中调节开花时间。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0399600 与 EF-Tu.GDP 复合物结合并诱导 GDP 向 GTP 的交换。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8BAI9 与 EF-Tu.GDP 复合物结合并诱导 GDP 向 GTP 的交换。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017681 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000381 regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0000395 mRNA 5'-splice site recognition 生物过程
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0001510 RNA methylation 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0006406 mRNA export from nucleus 生物过程
GO:0008380 RNA splicing 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G43410
hsa:29890
spo:2540865
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.903
排名 1 · TkA02G015360 · TK1151
细胞质0.178
排名 2 · TkA02G015360 · TK1151
细胞膜0.041
排名 3 · TkA02G015360 · TK1151
内质网0.029
排名 4 · TkA02G015360 · TK1151
质体0.015
排名 5 · TkA02G015360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28976RRM_ACIN167-125 aa
PF00076RRM_169-133 aa
PF16842RRM_occluded69-134 aa
PF25701RRM_YTH169-121 aa
PF08777RRM_376-124 aa
PF14605Nup35_RRM_285-112 aa
PF28977DUF8489106-125 aa
PF00076RRM_1203-256 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G015360PF28976RRM_ACIN1671250.007317.1
TkA02G015360PF00076RRM_1691333.4e-2278.8
TkA02G015360PF16842RRM_occluded691340.0007420.1
TkA02G015360PF25701RRM_YTH1691210.001219.4
TkA02G015360PF08777RRM_3761240.2212.3
TkA02G015360PF14605Nup35_RRM_2851120.01116.3
TkA02G015360PF28977DUF84891061250.1313.2
TkA02G015360PF00076RRM_12032563.4e-2278.8
TkA02G015360PF08777RRM_32052460.2212.3
TkA02G015360PF16842RRM_occluded2112590.0007420.1
TkA02G015360PF14605Nup35_RRM_22122400.01116.3
TkA02G015360PF28976RRM_ACIN12162520.007317.1
TkA02G015360PF25701RRM_YTH12272560.001219.4
TkA02G015360PF28977DUF84892302620.1313.2
TkA02G015360PF07744SPOC4445573.1e-2589.6
TkA02G015360PF28977DUF84894855080.1313.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5XF75拟南芥sp|Q5XF75|EFTS_ARATH Elongation factor Ts, mitochondrial63.800%Swiss-Prot高置信
Q8LPQ9拟南芥sp|Q8LPQ9|FPA_ARATH Flowering time control protein FPA30.700%Swiss-Prot中等置信
Q6ZJS7水稻sp|Q6ZJS7|EFTS_ORYSJ Elongation factor Ts, mitochondrial63.800%Swiss-Prot高置信
B8BAI9水稻sp|B8BAI9|EFTS_ORYSI Elongation factor Ts, mitochondrial63.200%Swiss-Prot高置信

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