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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G637910
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 161401995-161404737 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

777 bp · TkA01G637910|TK1151|cDNA

ATGGGTTCGACTCGATCCGATCATGGCTCCGGGAAAGAGCGATTGAAATGGACTCAAGAACTCCATGATTTGTTCGAAAAGGCAGTTACTCAGCTTGGAGGTCCTGATCGTGCAACACCTAAGGGTATATTAAAGGCCATGGGGATCACAGGGCTTACTATTTACCATGTTAAAAGCCACTTACAGAAATATAGAATGTCGAAATTTGTTCCGGAAACATCGAGAAGAGAAAGGTTTGAAAAAAGAAGCATATCTGAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

777 bp · TkA01G637910|TK1151|CDS

ATGGGTTCGACTCGATCCGATCATGGCTCCGGGAAAGAGCGATTGAAATGGACTCAAGAACTCCATGATTTGTTCGAAAAGGCAGTTACTCAGCTTGGAGGTCCTGATCGTGCAACACCTAAGGGTATATTAAAGGCCATGGGGATCACAGGGCTTACTATTTACCATGTTAAAAGCCACTTACAGAAATATAGAATGTCGAAATTTGTTCCGGAAACATCGAGAAGAGAAAGGTTTGAAAAAAGAAGCATATCTGAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

258 aa · TkA01G637910|TK1151|PROTEIN

MGSTRSDHGSGKERLKWTQELHDLFEKAVTQLGGPDRATPKGILKAMGITGLTIYHVKSHLQKYRMSKFVPETSRRERFEKRSISELFPNFSVTSGAQLNEALQMQMEVQRRLSDQLEVQKNLKLKIEAQSKFLEKLSQEHKTSKPNFTKINKVITSPTSLPSLCDVSESIMKDLESDSDDVDANEMQPKQPKRLRVDEDHDLIPSTQRLKPSSTLNTYNIHLPKSGTPFPPQDNNIFPWSSAFCQSPLVPTWFNSFG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G637910
TK1151 IDTkA01G637910
OH-1004 IDLXL04_000063
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G637910
位置Chr01:161401995-161404737 (+)
描述Similar to PHL7: Myb family transcription factor PHL7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g01060 Myb家族转录因子PHL7。 暂无已核实直接文献
At5g06800 Myb 家族转录因子 PHL5。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XYN9 转录因子结合靶基因启动子上的特定 DNA 序列，例如 R1BS 基序 5'-NAKATNCN-3' 和 P1BS 基序 5'-GNATATNC-3' 以触发其表达（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os04g0665600 转录因子，可结合目标基因启动子的特定DNA序列，如R1BS基序5'-NAKATNCN-3'和P1BS基序5'-GNATATNC-3'以触发其表达。
An SPX-RLI1 Module Regulates Leaf Inclination in Response to Phosphate Availability in Rice.2018 · DOI: 10.1105/tpc.17.00738
Modulation of nitrate-induced phosphate response by the MYB transcription factor RLI1/HINGE1 in the nucleus.2021 · DOI: 10.1016/j.molp.2020.12.005
UniProt: A2X0Q0 参与磷缺乏信号传导的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000063 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0010966 regulation of phosphate transport 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0016132 brassinosteroid biosynthetic process 生物过程
GO:0034765 regulation of monoatomic ion transmembrane transport 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01060
ath:AT4G28610
ath:AT5G06800
dosa:Os04g0665600
osa:4337318
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.946
排名 1 · TkA01G637910 · TK1151
细胞质0.177
排名 2 · TkA01G637910 · TK1151
线粒体0.023
排名 3 · TkA01G637910 · TK1151
细胞膜0.015
排名 4 · TkA01G637910 · TK1151
内质网0.007
排名 5 · TkA01G637910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding14-65 aa
PF14379Myb_CC_LHEQLE98-140 aa
PF05701WEMBL100-142 aa
PF30276Arminin125-151 aa
PF00249Myb_DNA-binding135-153 aa
PF30276Arminin166-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G637910PF00249Myb_DNA-binding14654.4e-1040.2
TkA01G637910PF14379Myb_CC_LHEQLE981402.5e-1866.3
TkA01G637910PF05701WEMBL1001420.05912.8
TkA01G637910PF30276Arminin1251510.6610.7
TkA01G637910PF00249Myb_DNA-binding1351534.4e-1040.2
TkA01G637910PF30276Arminin1661960.6610.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJW0拟南芥sp|Q9SJW0|PHL7_ARATH Myb family transcription factor PHL754.100%Swiss-Prot低置信
Q0WVU3拟南芥sp|Q0WVU3|PHL5_ARATH Myb family transcription factor PHL549.100%Swiss-Prot低置信
A2XYN9水稻sp|A2XYN9|RLI1_ORYSI Myb family transcription factor RLI153.700%Swiss-Prot低置信
Q0J995水稻sp|Q0J995|RLI1_ORYSJ Myb family transcription factor RLI153.700%Swiss-Prot低置信
A2X0Q0水稻sp|A2X0Q0|PHR3_ORYSI Protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 346.800%Swiss-Prot中等置信

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