TkA01G637120 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G637120

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 161176730-161177440 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

675 bp · TkA01G637120|TK1151|cDNA

ATGTCGTCGAAGAAAAGAAGACCTCATACCCACAAGAAAATAGTTCAACAGAATTCGAAGTTTGTCTCCGGGGAGGTTAATTTAGCCGGAAGATGCTACTGTCGCGGTACACCGGAATCCATTTGGACGGTTTCGAATTCTTCTGACACTGAGTTTTTATCGCCGGAGCTACCTGTTTCGTCTCGTGAATCTGTTAGTTGTTCGTGTAACACGACTTCGTCGTATGATGAAGTGTATGGGAAAGTTGACCTCCGGCCGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

675 bp · TkA01G637120|TK1151|CDS

ATGTCGTCGAAGAAAAGAAGACCTCATACCCACAAGAAAATAGTTCAACAGAATTCGAAGTTTGTCTCCGGGGAGGTTAATTTAGCCGGAAGATGCTACTGTCGCGGTACACCGGAATCCATTTGGACGGTTTCGAATTCTTCTGACACTGAGTTTTTATCGCCGGAGCTACCTGTTTCGTCTCGTGAATCTGTTAGTTGTTCGTGTAACACGACTTCGTCGTATGATGAAGTGTATGGGAAAGTTGACCTCCGGCCGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

224 aa · TkA01G637120|TK1151|PROTEIN

MSSKKRRPHTHKKIVQQNSKFVSGEVNLAGRCYCRGTPESIWTVSNSSDTEFLSPELPVSSRESVSCSCNTTSSYDEVYGKVDLRPIITKKEGGRSGKWMVEEESRSLSTRSPVKRFPGGKVKGNCYSPRVGNRVRIQGINGGRRSHGYRRSLSESMAVVKTSVDPGRDFKESMVEMIMENNMKSSKDLEDLLACYLLLNSDEYHDLIIKIFKQIWFESTDIRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G637120`
TK1151 ID	TkA01G637120
OH-1004 ID	LXL04_015134
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	44.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 60.268 / OH-1004 11.496 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G637120

位置 Chr01:161176730-161177440 (-)

描述 Similar to EXL3: GDSL esterase/lipase EXL3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g06920`	转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE 和 KNOX TALE 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。	OVATE FAMILY PROTEIN4 (OFP4) interaction with KNAT7 regulates secondary cell wall formation in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04595.x Arabidopsis ovate family proteins, a novel transcriptional repressor family, control multiple aspects of plant growth and development.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0023896
`At2g30400`	转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。	暂无已核实直接文献
`At5g01840`	转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE 和 KNOX TALE 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。	A central role of Arabidopsis thaliana ovate family proteins in networking and subcellular localization of 3-aa loop extension homeodomain proteins.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0501181102 Arabidopsis Ovate Family Protein 1 is a transcriptional repressor that suppresses cell elongation.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03096.x OVATE FAMILY PROTEIN4 (OFP4) interaction with KNAT7 regulates secondary cell wall formation in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04595.x Arabidopsis ovate family proteins, a novel transcriptional repressor family, control multiple aspects of plant growth and development.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0023896
`At5g58360`	转录抑制因子，可能通过调控 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源结构域转录因子，影响植物生长和发育的多个方面。	暂无已核实直接文献
`At4g18830`	转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。	A central role of Arabidopsis thaliana ovate family proteins in networking and subcellular localization of 3-aa loop extension homeodomain proteins.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0501181102 Cell-fate switch of synergid to egg cell in Arabidopsis eostre mutant embryo sacs arises from misexpression of the BEL1-like homeodomain gene BLH1.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.054890 Arabidopsis ovate family proteins, a novel transcriptional repressor family, control multiple aspects of plant growth and development.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0023896

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015134 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0016298 lipase activity 分子功能

GO:0016746 acyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G75880

ath:AT1G75900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.393

排名 1 · TkA01G637120 · TK1151

细胞核0.379

排名 2 · TkA01G637120 · TK1151

细胞膜0.341

排名 3 · TkA01G637120 · TK1151

内质网0.064

排名 4 · TkA01G637120 · TK1151

质体0.060

排名 5 · TkA01G637120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04844Ovate8-16 aa

PF04844Ovate163-218 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G637120	`PF04844`	Ovate	8	16	3.7e-23	82.0
TkA01G637120	`PF04844`	Ovate	163	218	3.7e-23	82.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4HNU8`	拟南芥	sp\|F4HNU8\|OFP4_ARATH Transcription repressor OFP4	45.000%	Swiss-Prot	中等置信
`O04351`	拟南芥	sp\|O04351\|OFP2_ARATH Transcription repressor OFP2	45.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LZW2`	拟南芥	sp\|Q9LZW2\|OFP1_ARATH Transcription repressor OFP1	44.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LVL4`	拟南芥	sp\|Q9LVL4\|OFP3_ARATH Transcription repressor OFP3	62.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q8VZN1`	拟南芥	sp\|Q8VZN1\|OFP5_ARATH Transcription repressor OFP5	35.400%	Swiss-Prot	中等置信

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