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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G629880
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 159269420-159270271 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

810 bp · TkA01G629880|TK1151|cDNA

ATGGATCAATCAAGATATTGGATCCCGAAGGAAAGAGCTTGTTTAAATTCGCATGTGTTATCTTCGTTTGGTGATTCTTGGGAAGAACAAGCGTTCGCGGAAGATGCAGCCGGGCCACTCGGAGGTTGCATATGGCCGCCAAGATCTTACACTTGCAGTTTCTGTCGAAGAGAATTTCGGTCGGCGCAAGCTCTTGGGGGTCACATGAACGTTCATCGGAGAGATAGGGCAAGACTCAAGCAAAGTCCAGATAACAATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

810 bp · TkA01G629880|TK1151|CDS

ATGGATCAATCAAGATATTGGATCCCGAAGGAAAGAGCTTGTTTAAATTCGCATGTGTTATCTTCGTTTGGTGATTCTTGGGAAGAACAAGCGTTCGCGGAAGATGCAGCCGGGCCACTCGGAGGTTGCATATGGCCGCCAAGATCTTACACTTGCAGTTTCTGTCGAAGAGAATTTCGGTCGGCGCAAGCTCTTGGGGGTCACATGAACGTTCATCGGAGAGATAGGGCAAGACTCAAGCAAAGTCCAGATAACAATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

269 aa · TkA01G629880|TK1151|PROTEIN

MDQSRYWIPKERACLNSHVLSSFGDSWEEQAFAEDAAGPLGGCIWPPRSYTCSFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLKQSPDNNQILEPNNTSLVGRCNMLRNPNEIYNPNFDLDHAVFSSSSPRPSTSSNILRPFTCSFVQEQEKSTPILSWSKFEPGKRFQIADMGNQEKGFTKAIELNINTTSTSKKRNTRQIEDHFAGNMNSRVIGTCDITVGNEKKERDDDGLIFKRSNLINGDEGESVVSLKSSPNSTLELD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G629880
TK1151 IDTkA01G629880
OH-1004 IDLXL04_000169
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G629880
位置Chr01:159269420-159270271 (+)
描述Similar to ZFP10: Zinc finger protein 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g37740 可能调节细胞分裂和生长的推测转录因子。
Ectopic expression of an Arabidopsis single zinc finger gene in tobacco results in dwarf plants.2002 · DOI: 10.1093/pcp/pcf086
At5g06070 可能的转录调控因子，对花瓣发育至关重要。 暂无已核实直接文献
At2g42410 可能调节细胞分裂和生长的推测转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g23130 可能的转录调节因子，被认为是地籍蛋白，通过间接作用阻止B类同源异型蛋白APETALA3以及可能的PISTILLATA在心皮轮中发挥作用。
Regulation of SUP expression identifies multiple regulators involved in arabidopsis floral meristem development.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.9.1607
The FLO10 Gene Product Regulates the Expression Domain of Homeotic Genes AP3 and PI in Arabidopsis Flowers.1991 · DOI: 10.1105/tpc.3.11.1221
At3g09290 激活因子，通过调节 BT2 介导端粒酶活性并增强对生长素的响应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000169 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010093 specification of floral organ identity 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048441 petal development 生物过程
GO:0090691 formation of plant organ boundary 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37740
ath:AT2G42410
ath:AT3G09290
ath:AT3G23130
ath:AT5G06070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.970
排名 1 · TkA01G629880 · TK1151
细胞质0.091
排名 2 · TkA01G629880 · TK1151
细胞膜0.027
排名 3 · TkA01G629880 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA01G629880 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA01G629880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13894zf-C2H2_414-21 aa
PF26331DUF808626-32 aa
PF23077zf-C2H2_ZNF462_1st49-72 aa
PF13912zf-C2H2_650-74 aa
PF13894zf-C2H2_450-72 aa
PF00096zf-C2H250-72 aa
PF12171zf-C2H2_jaz50-70 aa
PF12756zf-C2H2_250-81 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G629880PF13894zf-C2H2_414210.0003321.8
TkA01G629880PF26331DUF808626322.08.4
TkA01G629880PF23077zf-C2H2_ZNF462_1st49720.05613.9
TkA01G629880PF13912zf-C2H2_650744.7e-0627.1
TkA01G629880PF13894zf-C2H2_450720.0003321.8
TkA01G629880PF00096zf-C2H250720.008817.2
TkA01G629880PF12171zf-C2H2_jaz50700.1612.9
TkA01G629880PF12756zf-C2H2_250810.2712.2
TkA01G629880PF12874zf-met50710.2912.2
TkA01G629880PF26331DUF80861202052.08.4
TkA01G629880PF10637Ofd1_CTDD1552540.2111.7
TkA01G629880PF12874zf-met2132210.2912.2
TkA01G629880PF12171zf-C2H2_jaz2142210.1612.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80942拟南芥sp|O80942|ZFP10_ARATH Zinc finger protein 1063.300%Swiss-Prot低置信
Q9LHS9拟南芥sp|Q9LHS9|RBE_ARATH Probable transcriptional regulator RABBIT EARS69.100%Swiss-Prot低置信
Q9SLB8拟南芥sp|Q9SLB8|ZFP11_ARATH Zinc finger protein 1164.900%Swiss-Prot低置信
Q38895拟南芥sp|Q38895|SUP_ARATH Transcriptional regulator SUPERMAN89.500%Swiss-Prot低置信
Q9SR34拟南芥sp|Q9SR34|TA1_ARATH Transcriptional regulator TAC158.000%Swiss-Prot低置信

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