TkA01G625870 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G625870

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 157991351-157996861 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2843 bp · TkA01G625870|TK1151|cDNA

TTGCTCTTTTGTTAATTTAAATGAAAAAGAAGAAAAACAAGCTTGAAAAAGCAAAGGAAAGAAAGAAGGAATGGTTGGTTTCCATTGCGCCTTTCTTTTTCTTGTTTCTCTCTGCTAAGCATCTTTTCTTTCCTTCACTTTTTTGGGTTCTTTTCTTAGTCTCTCAATCTCTCAAACACTAGACACTTTACCTTCTTGTAAAAAAAATTCTCTGAGTTCTCTACCTCAACCATTTCTTTATAATCTTCAGGATTTCCGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1743 bp · TkA01G625870|TK1151|CDS

ATGGGACTTTGTCATGGAAAACCGAATCAGACCCTCGAAAGCCAACTCGAAAATTCCAATTTCCCAAATGAAATTGAACCAACAGCAGTGAATTCCCAAACAGGGAAATCATCATTCCCTTACTACAGTCCCAGTCCTTTCCATAACAGTAGCGCCTACAAGAATTCACCTGCGAATTCAAATTCAAGCGTCAGTTCGACGCCTCTTCGCATATTTAAACGCCCTTTCCCACCCCCATCACCTGCCAAACATATTCGATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

580 aa · TkA01G625870|TK1151|PROTEIN

MGLCHGKPNQTLESQLENSNFPNEIEPTAVNSQTGKSSFPYYSPSPFHNSSAYKNSPANSNSSVSSTPLRIFKRPFPPPSPAKHIRSLLARRHGSVKPNEAPIPEGNEFEVGLDKNFGYSKQLLSHYELGEEVGRGHFGYTCTAKGKKGSMKGHDVAVKVIPKSKMTTVIAIEDARREVKILRALTGHDNLVQFYDAYEDEDNVYIIMELCKGGELLDRILARGGKYSEEDAKAVMVQILRVTAYCHLQGVVHRDLKPEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G625870`
TK1151 ID	TkA01G625870
OH-1004 ID	LXL04_000245
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G625870

位置 Chr01:157991351-157996861 (+)

描述 Similar to CRK7: CDPK-related kinase 7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g56760`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At2g41140`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。	The calmodulin-binding protein kinase 3 is part of heat-shock signal transduction in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03544.x
`At3g50530`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0366200`	在体外具备激酶活性。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G41140

ath:AT3G50530

ath:AT3G56760

dosa:Os03g0366200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.373

排名 1 · TkA01G625870 · TK1151

细胞质0.359

排名 2 · TkA01G625870 · TK1151

细胞核0.230

排名 3 · TkA01G625870 · TK1151

高尔基体0.085

排名 4 · TkA01G625870 · TK1151

内质网0.068

排名 5 · TkA01G625870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase127-389 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr128-381 aa

PF03109ABC1152-167 aa

PF01636APH173-225 aa

PF06293Kdo203-277 aa

PF03109ABC1205-289 aa

PF14531Kinase-like234-337 aa

PF01636APH234-282 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G625870	`PF00069`	Pkinase	127	389	1.3e-71	241.8
TkA01G625870	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	128	381	4.7e-32	112.0
TkA01G625870	`PF03109`	ABC1	152	167	0.00011	22.2
TkA01G625870	`PF01636`	APH	173	225	0.0032	18.0
TkA01G625870	`PF06293`	Kdo	203	277	4.5e-05	23.7
TkA01G625870	`PF03109`	ABC1	205	289	0.00011	22.2
TkA01G625870	`PF14531`	Kinase-like	234	337	0.00075	19.6
TkA01G625870	`PF01636`	APH	234	282	0.0032	18.0
TkA01G625870	`PF05235`	CHAD	343	403	0.12	13.1
TkA01G625870	`PF13499`	EF-hand_7	436	493	0.031	15.3
TkA01G625870	`PF13405`	EF-hand_6	436	461	0.087	13.3
TkA01G625870	`PF00036`	EF-hand_1	439	462	0.056	13.7
TkA01G625870	`PF00036`	EF-hand_1	489	496	0.056	13.7
TkA01G625870	`PF11154`	DUF2934	507	526	0.23	11.9
TkA01G625870	`PF13499`	EF-hand_7	513	568	0.031	15.3
TkA01G625870	`PF00036`	EF-hand_1	514	533	0.056	13.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LET1`	拟南芥	sp\|Q9LET1\|CAMK7_ARATH CDPK-related kinase 7	77.700%	Swiss-Prot	高置信
`O80673`	拟南芥	sp\|O80673\|CAMK1_ARATH CDPK-related kinase 1	76.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SCS2`	拟南芥	sp\|Q9SCS2\|CAMK5_ARATH CDPK-related kinase 5	67.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q10KY3`	水稻	sp\|Q10KY3\|CAMK1_ORYSJ Calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase 1	67.700%	Swiss-Prot	高置信

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