基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G606490
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 152818108-152822192
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2263 bp · TkA01G606490|TK1151|cDNA
TAAATTCATAATCAAAATACGCTCCTCATTTATCCCCGAAACCCAATTCATTTCCCAAAGCGGCTTCCTGCTCCGCACCACCACCATCACCAGTATGCCGCCATCGTTACCATCTGTCTCGATCACACCTACCCACACCGCTCAACTCTTTCTATCCTTCTCTAAATGTATTTTGTTTCTAGGGTTTTGACTAATGATAGCGGCTAATAAGTGTAAAATCAGAATTTATACTATCAAGGATAAAAGTGTGCTTCAAACTT...
CDS
下载 CDS FASTA1056 bp · TkA01G606490|TK1151|CDS
ATGGAAACTTCAAATCATGTTCTACTCATTGTGAGCTCTTCTGCTATTTATGGTGTAAAACATGACATTCAAGCCCTCTGTGTTTATTATTTTTCAGGCAACAATGACTTTCAAAGCTTTTTGGTTCAATTAATTGTGTTATTATTCCTGAAAACCCCATGGAGGGTTTTGGCTTACTGTGGCACATCATTTACCTCCTGTACAACTGATTATTGCAAATCCCCCAACAGACGGTACAAATCAGTGCAAAGTGTTGAAAA...
351 aa · TkA01G606490|TK1151|PROTEIN
METSNHVLLIVSSSAIYGVKHDIQALCVYYFSGNNDFQSFLVQLIVLLFLKTPWRVLAYCGTSFTSCTTDYCKSPNRRYKSVQSVENTFQLTRADRDLLVKLEYDVQAWCMLLNDRVPMRATNRPGAQMLGANGHDDGPIITQCTQDEINKISLTGCDPRVFCLGVRIVKRRTLQQILHLIPKESDGERFEDALARGRRCVGGGAPTENADSDSDLEVCLILYPLTYVALCVGEEDVTEIEVKPDGSWRAESEDGRKSLG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G606490 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G606490 |
| OH-1004 ID | LXL04_033089 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 66.600 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 76.923 / OH-1004 43.276覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G606490 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:152818108-152822192 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to SIZ1: E3 SUMO-protein ligase SIZ1 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009553 embryo sac development 生物过程 GO:0009787 regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程 GO:0010113 negative regulation of systemic acquired resistance 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0010247 detection of phosphate ion 生物过程 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G60410 dosa:Os03g0719100 dosa:Os05g0125000 hsa:83637 mmu:52915 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.466
细胞质0.387
线粒体0.135
细胞膜0.080
内质网0.056
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。