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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G598060
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150571416-150576081 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1581 bp · TkA01G598060|TK1151|cDNA

ATGATCACTCCACCAAATTGGGTACGAGGGGTTTGCATCGGAAGAGGCTCATTCGGAACTGTAAATCTCGCCGTCGATAAATCCGACGGTGGGGTGTTCGCCGTTAAGTCAGTGAAACAGAACTCCAGACGCTTCTCTCAAGCTTTGGAGAATGAGATTCGGATTCTCAAATCTTTGTCGTCTCCTTATGTCGTTGGGTATCTCCGCGATGATGTCACGGCGGATAATTCTTCGGTGGTTTACCGGAACTTGCATATGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1581 bp · TkA01G598060|TK1151|CDS

ATGATCACTCCACCAAATTGGGTACGAGGGGTTTGCATCGGAAGAGGCTCATTCGGAACTGTAAATCTCGCCGTCGATAAATCCGACGGTGGGGTGTTCGCCGTTAAGTCAGTGAAACAGAACTCCAGACGCTTCTCTCAAGCTTTGGAGAATGAGATTCGGATTCTCAAATCTTTGTCGTCTCCTTATGTCGTTGGGTATCTCCGCGATGATGTCACGGCGGATAATTCTTCGGTGGTTTACCGGAACTTGCATATGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

526 aa · TkA01G598060|TK1151|PROTEIN

MITPPNWVRGVCIGRGSFGTVNLAVDKSDGGVFAVKSVKQNSRRFSQALENEIRILKSLSSPYVVGYLRDDVTADNSSVVYRNLHMEYMAGGTVADLAKHGEDATVRSYTRCIVSALSYIHARNIVHCDVKGKNVLVGGIPGKAKLADFGSALELNGAPVSGIRGSPLWMAPEVIRGEGQGPESDVWSLGCTVIEMVTGMPAWQDRGVDTLCQIGYSDDLPTLPGHFSDELRDFLNKCLIRVPSERWSCNQLLRHPFLLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G598060
TK1151 IDTkA01G598060
OH-1004 IDLXL04_000641
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 75.856 / OH-1004 83.648
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G598060
位置Chr01:150571416-150576081 (-)
描述Similar to MAPKKK17: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g32510 脱落酸（ABA）信号通路的组成部分，在非生物胁迫情况下可能作为ABA信号转导子。 暂无已核实直接文献
At1g05100 脱落酸 信号通路的组成部分，在非生物胁迫下充当 ABA 信号转导器。
An abscisic acid inducible Arabidopsis MAPKKK, MAPKKK18 regulates leaf senescence via its kinase activity.2015 · DOI: 10.1007/s11103-015-0295-0
Arabidopsis ABA-Activated Kinase MAPKKK18 is Regulated by Protein Phosphatase 2C ABI1 and the Ubiquitin-Proteasome Pathway.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcv146
At1g53570 丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶 3。 暂无已核实直接文献
At1g54960 通过调控MAP65-1等微管相关蛋白的磷酸化状态，参与皮层微管的组织和稳定。
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
At1g09000 可能参与氧化应激介导的信号级联反应，磷酸化下游 MAP 激酶 MPK3 和 MPK6。
Functional analysis of oxidative stress-activated mitogen-activated protein kinase cascade in plants.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.6.2940
An Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase kinase gene family encodes essential positive regulators of cytokinesis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001164

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000641 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009653 anatomical structure morphogenesis 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0030435 sporulation resulting in formation of a cellular spore 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1900057 positive regulation of leaf senescence 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05100
ath:AT1G09000
ath:AT1G54960
ath:AT2G32510
ddi:DDB_G0283265
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.523
排名 1 · TkA01G598060 · TK1151
细胞质0.426
排名 2 · TkA01G598060 · TK1151
细胞膜0.151
排名 3 · TkA01G598060 · TK1151
内质网0.059
排名 4 · TkA01G598060 · TK1151
质体0.038
排名 5 · TkA01G598060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase11-258 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr13-254 aa
PF03109ABC113-43 aa
PF03109ABC183-155 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G598060PF00069Pkinase112583e-56191.4
TkA01G598060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr132541.6e-2797.2
TkA01G598060PF03109ABC113430.001318.6
TkA01G598060PF03109ABC1831550.001318.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80888拟南芥sp|O80888|M3K17_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1746.700%Swiss-Prot低置信
Q9ZVP5拟南芥sp|Q9ZVP5|M3K18_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1845.300%Swiss-Prot低置信
F4HRJ4拟南芥sp|F4HRJ4|M3K3A_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 339.200%Swiss-Prot低置信
Q9FZ36拟南芥sp|Q9FZ36|M3K2_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 238.300%Swiss-Prot中等置信
O22040拟南芥sp|O22040|ANP1_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase ANP139.400%Swiss-Prot低置信

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