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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G596240
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150119604-150124884 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2410 bp · TkA01G596240|TK1151|cDNA

AACGGCACGTGACGAATCAGATGTGAATTGAAGAACGGCGCCATTATAAAATCCCAAGAACAAAAGACATGGTCAATCCAACAAGACAAAATCCCAAAAGAAACATCTCCGAAACTCATAATTATTCGCTCCATTCTCCACTCCCATACGCAAAACATCCAGATCTTCTTCTGTAACTGAAACCCACATTCCCTGCAGTCGGTGACTATTTTTTTATTACGGGTTACCGCGTTTCAAGCCTGATCTTGCGTAATCTAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1968 bp · TkA01G596240|TK1151|CDS

ATGGAGAGGTTCTGGAATTACAACCGGTTTAAGCTGCGGTTAGCAGTCCTGCTTACTGCTTTATTAGTAATCGATTACAATTTTAGTCTCTGTTGGTCTCTCAACACCGAAGGGATGGCGTTGTTGAAGTTTCGGGATGGAATTGAGAGGGACCCTTTAGGCGTTTTGTCTGGATGGAATAACGACGATGAAGTGGCGGATTTGGGTCATTGTTCTTGGTTCGGCGTTGAGTGTTCCGATGGAAAAGTGGTCATCTTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

655 aa · TkA01G596240|TK1151|PROTEIN

MERFWNYNRFKLRLAVLLTALLVIDYNFSLCWSLNTEGMALLKFRDGIERDPLGVLSGWNNDDEVADLGHCSWFGVECSDGKVVILNLKDLCLEGTLAPELGKLTNVKSIILRNNSFNGTIPQEIGDLKQLEVLDLGYNNFTGPFPSDLVNNLSLSILLLDNNNFLDNLSLEVNHLKTLSEVQVDEEQLTNSHDNDFTCNKKSSSWNVITERKLLQIPPSSSLSPSRHPVSSISFPPFATSPSMSAVPFPSPSTSPVPAP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G596240
TK1151 IDTkA01G596240
OH-1004 IDLXL04_000649
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G596240
位置Chr01:150119604-150124884 (+)
描述Similar to MDIS2: Protein MALE DISCOVERER 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18640 通过结合不明的雌性引诱剂参与花粉管对雌性信号的感知。
Analysis of the root-hair morphogenesis transcriptome reveals the molecular identity of six genes with roles in root-hair development in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02609.x
At5g45840 参与花粉管对雌性信号的感知。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At3g56050 可能的非活性受体样蛋白激酶 At3g56050。 暂无已核实直接文献
At2g40270 非活性受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g40270。 暂无已核实直接文献
At1g63430 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g63430。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000649 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63430
ath:AT2G40270
ath:AT3G56050
ath:AT4G18640
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.781
排名 1 · TkA01G596240 · TK1151
内质网0.085
排名 2 · TkA01G596240 · TK1151
细胞质0.076
排名 3 · TkA01G596240 · TK1151
细胞核0.059
排名 4 · TkA01G596240 · TK1151
质体0.043
排名 5 · TkA01G596240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_234-79 aa
PF00560LRR_184-104 aa
PF23598LRR_1486-188 aa
PF12799LRR_4105-142 aa
PF13855LRR_8106-165 aa
PF00560LRR_1106-128 aa
PF12799LRR_4129-170 aa
PF00560LRR_1130-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G596240PF08263LRRNT_234793.4e-0937.6
TkA01G596240PF00560LRR_1841040.0001721.7
TkA01G596240PF23598LRR_14861884.9e-0626.3
TkA01G596240PF12799LRR_41051420.003318.4
TkA01G596240PF13855LRR_81061657.9e-0523.1
TkA01G596240PF00560LRR_11061280.0001721.7
TkA01G596240PF12799LRR_41291700.003318.4
TkA01G596240PF00560LRR_11301510.0001721.7
TkA01G596240PF00560LRR_11541720.0001721.7
TkA01G596240PF13855LRR_81671817.9e-0523.1
TkA01G596240PF08263LRRNT_22022073.4e-0937.6
TkA01G596240PF04625DEC-1_N2332799.85.8
TkA01G596240PF21741DUF68673133510.2712.5
TkA01G596240PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3826212.2e-2590.1
TkA01G596240PF00069Pkinase3836183.1e-2073.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGQ4拟南芥sp|C0LGQ4|MDIS2_ARATH Protein MALE DISCOVERER 243.800%Swiss-Prot中等置信
C0LGU7拟南芥sp|C0LGU7|MDIS1_ARATH Protein MALE DISCOVERER 143.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LYN6拟南芥sp|Q9LYN6|Y3565_ARATH Probable inactive receptor-like protein kinase At3g5605052.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SIZ4拟南芥sp|Q9SIZ4|Y2027_ARATH Inactive receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g4027053.100%Swiss-Prot中等置信
C0LGH8拟南芥sp|C0LGH8|Y1634_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6343033.700%Swiss-Prot中等置信

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