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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G593760
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 149505506-149508331 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2205 bp · TkA01G593760|TK1151|cDNA

AAGGGTTTTTCCCAGGAGATTTAGGTGGTGGTGGGAAATGAAGGCTGGAAAGAGAGGCGATTACGGATGACCCGTTCTAACGTTCTCGAGTACGCCATGCTAGCTACTAACTTTAAATAAATCGGCCGGTTCCAAAAAACTTGAAAAGTAAATGGATACCATTTATATAAATGAAGGATGAGTAAATGAAAGAATATAGAGAGTTCTCTAAAGTGAAAAGTCAGTATACCTTTATGTCTTACGGTTTAAGATTCATGTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1428 bp · TkA01G593760|TK1151|CDS

ATGTCTTCTTCCGGTATCACCTTTGAATCACCATCAAACTCACCACCACCACCTTCCACCACCGGTGTACCTCCGGCCGCTGGTATACCCAAATTCAAGTCGATACCTCCACCTTCACTTCCCATTTCCACACCGGCGTTCTCACCTTCCTCCTACTTCTCGTTCACCGGTGGTCTCACCTCCGCCGACCTCCTCGACTCCCCTCTTCTCCTTTCTTCTTCGCACATTCTACCATCTCCGACGACTGGCTCTTTCCCATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

475 aa · TkA01G593760|TK1151|PROTEIN

MSSSGITFESPSNSPPPPSTTGVPPAAGIPKFKSIPPPSLPISTPAFSPSSYFSFTGGLTSADLLDSPLLLSSSHILPSPTTGSFPLKKEQDNITDFLFKTQSNPHKEIYQQPRIEDERNLLKSEYSFQKQSLESSYPTDRNIYNHQSSQKKLDDGYNWRKYGQKQMKGSENPRSYYKCSDRNCSMRKKVETSSDGDITEIVYKGNHNHPKPQSTKRSSSSSISNDSLVVNQFNEFPDQSHGYRQWELVGTPDNSSVSVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G593760
TK1151 IDTkA01G593760
OH-1004 IDLXL04_000686
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G593760
位置Chr01:149505506-149508331 (+)
描述Similar to WRKY24: WRKY transcription factor WRKY24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38470 转录因子。
Functional characterization of Arabidopsis NaCl-inducible WRKY25 and WRKY33 transcription factors in abiotic stresses.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9408-3
Arabidopsis thaliana WRKY25, WRKY26, and WRKY33 coordinate induction of plant thermotolerance.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1375-2
Phosphorylation of a WRKY transcription factor by two pathogen-responsive MAPKs drives phytoalexin biosynthesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084996
Arabidopsis sigma factor binding proteins are activators of the WRKY33 transcription factor in plant defense.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.090571
Arabidopsis WRKY33 is a key transcriptional regulator of hormonal and metabolic responses toward Botrytis cinerea infection.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.192641
At2g30250 转录因子。
Functional characterization of Arabidopsis NaCl-inducible WRKY25 and WRKY33 transcription factors in abiotic stresses.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9408-3
Functional analysis of an Arabidopsis transcription factor WRKY25 in heat stress.2009 · DOI: 10.1007/s00299-008-0666-y
Arabidopsis thaliana WRKY25, WRKY26, and WRKY33 coordinate induction of plant thermotolerance.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1375-2
At5g07100 转录因子。
Arabidopsis thaliana WRKY25, WRKY26, and WRKY33 coordinate induction of plant thermotolerance.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1375-2

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0826400 可能参与脱落酸和赤霉素信号的转录调控。
Annotations and functional analyses of the rice WRKY gene superfamily reveal positive and negative regulators of abscisic acid signaling in aleurone cells.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.054312
A negative regulator encoded by a rice WRKY gene represses both abscisic acid and gibberellins signaling in aleurone cells.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9463-4
UniProt: Q6B6R4 转录抑制因子（根据相似性）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000686 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38470
ath:AT5G07100
dosa:Os01g0826400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.967
排名 1 · TkA01G593760 · TK1151
细胞质0.151
排名 2 · TkA01G593760 · TK1151
线粒体0.014
排名 3 · TkA01G593760 · TK1151
细胞膜0.013
排名 4 · TkA01G593760 · TK1151
内质网0.006
排名 5 · TkA01G593760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03921ICAM_N147-190 aa
PF03106WRKY154-210 aa
PF04500FLYWCH168-209 aa
PF06839Zn_ribbon_GRF168-183 aa
PF04606Ogr_Delta174-190 aa
PF23549Zn_ribbon_GRF_2174-185 aa
PF03921ICAM_N306-349 aa
PF03106WRKY318-375 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G593760PF03921ICAM_N1471900.0813.4
TkA01G593760PF03106WRKY1542103.3e-49165.6
TkA01G593760PF04500FLYWCH1682090.03714.9
TkA01G593760PF06839Zn_ribbon_GRF1681831.39.9
TkA01G593760PF04606Ogr_Delta1741900.01216.2
TkA01G593760PF23549Zn_ribbon_GRF_21741850.411.2
TkA01G593760PF03921ICAM_N3063490.0813.4
TkA01G593760PF03106WRKY3183753.3e-49165.6
TkA01G593760PF04500FLYWCH3203740.03714.9
TkA01G593760PF06839Zn_ribbon_GRF3283471.39.9
TkA01G593760PF23549Zn_ribbon_GRF_23353480.411.2
TkA01G593760PF04606Ogr_Delta3393500.01216.2
TkA01G593760PF03106WRKY3934043.3e-49165.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S8P5拟南芥sp|Q8S8P5|WRK33_ARATH Probable WRKY transcription factor 3349.000%Swiss-Prot中等置信
O22921拟南芥sp|O22921|WRK25_ARATH Probable WRKY transcription factor 2546.900%Swiss-Prot中等置信
Q9C5T3拟南芥sp|Q9C5T3|WRK26_ARATH Probable WRKY transcription factor 2648.600%Swiss-Prot中等置信
Q6IEQ7水稻sp|Q6IEQ7|WRK24_ORYSJ WRKY transcription factor WRKY2447.800%Swiss-Prot中等置信
Q6B6R4水稻sp|Q6B6R4|WRK24_ORYSI WRKY transcription factor WRKY2448.100%Swiss-Prot中等置信

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