TkA01G593060 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G593060

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 149289519-149290805 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1245 bp · TkA01G593060|TK1151|cDNA

ATGGCCTCCTCGGCGGCCAATTCGTTATTCGGCAAGTATGACGTCGGAAAACTCCTCGGCTGCGGCGCTTTCGCTAAGGTGTACCATGCTAGGGATATCAAAAACGGTCACAGCGTTGCCATTAAGGTAATCAATAAGCATAAAATCTCTCATAACGCTCATCTCGTCTCGAACGTGAAGCGCGAGATCGAGATTATGCGCCGGCTCCGGCATCCGAACATTGTTAAATTGTATGAAGTTATGGCAACGAAGACCAAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1245 bp · TkA01G593060|TK1151|CDS

ATGGCCTCCTCGGCGGCCAATTCGTTATTCGGCAAGTATGACGTCGGAAAACTCCTCGGCTGCGGCGCTTTCGCTAAGGTGTACCATGCTAGGGATATCAAAAACGGTCACAGCGTTGCCATTAAGGTAATCAATAAGCATAAAATCTCTCATAACGCTCATCTCGTCTCGAACGTGAAGCGCGAGATCGAGATTATGCGCCGGCTCCGGCATCCGAACATTGTTAAATTGTATGAAGTTATGGCAACGAAGACCAAGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

414 aa · TkA01G593060|TK1151|PROTEIN

MASSAANSLFGKYDVGKLLGCGAFAKVYHARDIKNGHSVAIKVINKHKISHNAHLVSNVKREIEIMRRLRHPNIVKLYEVMATKTKIYFVMEFVKGGELFAKVAKGRLSESQSRKYFQQLISAIGYCHSRDENGDLKVTDFGLSAVTGQIRADGLLHTLCGTPSYVAPEILTKRGYDGAKADIWSCGIILFVLNAAFLPFNDANLMIMYKKIYKGEYKCPKWMSSDLRRFLARILDTKPETRITVDEIKIDPWFRKGYKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G593060`
TK1151 ID	TkA01G593060
OH-1004 ID	LXL04_000699
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G593060

位置 Chr01:149289519-149290805 (+)

描述 Similar to CIPK11: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 11

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30360`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	Arabidopsis protein kinase PKS5 inhibits the plasma membrane H+ -ATPase by preventing interaction with 14-3-3 protein.2007 · DOI: 10.1105/tpc.105.035626
`At5g01820`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At1g29230`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At4g18700`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At5g45810`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000699 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009268 response to pH 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G29230

ath:AT2G30360

ath:AT4G18700

ath:AT5G01820

dosa:Os05g0514200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.530

排名 1 · TkA01G593060 · TK1151

细胞核0.432

排名 2 · TkA01G593060 · TK1151

细胞膜0.165

排名 3 · TkA01G593060 · TK1151

内质网0.049

排名 4 · TkA01G593060 · TK1151

高尔基体0.047

排名 5 · TkA01G593060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase13-254 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr15-249 aa

PF03109ABC119-47 aa

PF01163RIO145-122 aa

PF01636APH48-131 aa

PF03109ABC157-100 aa

PF06289FlbD236-244 aa

PF03822NAF281-339 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G593060	`PF00069`	Pkinase	13	254	1.9e-57	195.4
TkA01G593060	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	15	249	1.1e-27	97.7
TkA01G593060	`PF03109`	ABC1	19	47	0.055	13.3
TkA01G593060	`PF01163`	RIO1	45	122	0.075	13.4
TkA01G593060	`PF01636`	APH	48	131	0.21	12.0
TkA01G593060	`PF03109`	ABC1	57	100	0.055	13.3
TkA01G593060	`PF06289`	FlbD	236	244	1.0	9.7
TkA01G593060	`PF03822`	NAF	281	339	6.7e-19	68.5
TkA01G593060	`PF06289`	FlbD	309	329	1.0	9.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22932`	拟南芥	sp\|O22932\|CIPKB_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 11	60.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LZW4`	拟南芥	sp\|Q9LZW4\|CIPKE_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 14	54.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LP51`	拟南芥	sp\|Q9LP51\|CIPKI_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 18	51.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SN43`	拟南芥	sp\|Q9SN43\|CIPKC_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12	49.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FJ55`	拟南芥	sp\|Q9FJ55\|CIPKJ_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 19	48.500%	Swiss-Prot	中等置信

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