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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G592670
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 149155415-149159726 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2520 bp · TkA01G592670|TK1151|cDNA

GGTAGTTGACAAAATGAAGCATGTGAAATCTGAAACTACATACTGAGATGGTTATCTTGACCTTATACGCGTCCCTTTTCCCCCAAATACCCATTATTAACTCTCTTTGTATTTCCTCAATTTCTCAACTCTCCTCCCATGGCGGAATCTTGAATCCTCCCCCTTTCCCTACAGTATCTCACTGCTTCTTGCAAATTACCCGTCTATTCGCTTCAGTCTCTTCATAATTTCATCGTCTTCATCATCAATTGTCAACAACG...

CDS

下载 CDS FASTA

1536 bp · TkA01G592670|TK1151|CDS

ATGGATGCAAATCTGGTAAAGTCGTATAAAGGTTATAGAAGAACAGAATCAAGAAATAAACATTCTTGGTGGTGGGATAGCCACATCAGTCCCAAAAACTCCAAATGGCTTGCTGAAAATGTCGAAGAAATGGACCAAAGTGTAAAACGCATGTTAAAGCTAATCGAAGAAGAAGGAGACTCATTCGCCAAAAAAGCCGAAATGTATTACCAAAAAAGACCCCAACTCGTATCTCACGTCGAAGAATTTTACCGAATGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

511 aa · TkA01G592670|TK1151|PROTEIN

MDANLVKSYKGYRRTESRNKHSWWWDSHISPKNSKWLAENVEEMDQSVKRMLKLIEEEGDSFAKKAEMYYQKRPQLVSHVEEFYRMYRSLAERYDNVTGELRKNIPSDLQSLQSQGSGVSDVSSEPPLGGSGSNPRRGSRSGTRAAGFDVFLKSGGSSSDLVTKEGDESSTLDSESESDDSSVNNYSIASGNSDHRVKKIADVESEVRKNEQIEEELRVANEKIRELTTELQKHESMSLPPQHSDNSDYSEDFKSFSNEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G592670
TK1151 IDTkA01G592670
OH-1004 IDLXL04_036653
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)37.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.998 / OH-1004 57.563
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G592670
位置Chr01:149155415-149159726 (+)
描述Similar to NET4B: Protein NETWORKED 4B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58320 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g30500 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g03080 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g02710 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g22790 植物特异性肌动蛋白结合蛋白。
A superfamily of actin-binding proteins at the actin-membrane nexus of higher plants.2012 · DOI: 10.1016/j.cub.2012.06.041

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036653 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0003779 actin binding 分子功能
GO:0051015 actin filament binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03080
ath:AT2G30500
ath:AT3G22790
ath:AT4G14760
ath:AT5G58320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.555
排名 1 · TkA01G592670 · TK1151
细胞核0.286
排名 2 · TkA01G592670 · TK1151
细胞膜0.123
排名 3 · TkA01G592670 · TK1151
高尔基体0.100
排名 4 · TkA01G592670 · TK1151
溶酶体／液泡0.069
排名 5 · TkA01G592670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07765KIP122-95 aa
PF28422CCDC8929-101 aa
PF28175T4SS_LegC2C736-96 aa
PF20270CATRA-C36-90 aa
PF05010TACC_C37-102 aa
PF27605ODF2_C38-66 aa
PF30842LEKR139-96 aa
PF05911FPP39-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G592670PF07765KIP122951.6e-37128.1
TkA01G592670PF28422CCDC89291010.0912.8
TkA01G592670PF28175T4SS_LegC2C736960.07412.7
TkA01G592670PF20270CATRA-C36901.410.4
TkA01G592670PF05010TACC_C371020.04514.2
TkA01G592670PF27605ODF2_C38660.004916.8
TkA01G592670PF30842LEKR139960.004218.1
TkA01G592670PF05911FPP39910.01214.6
TkA01G592670PF29997SPC25_N40810.003818.3
TkA01G592670PF13863DUF420041880.4511.6
TkA01G592670PF30679CCDC18_2nd41863.46.4
TkA01G592670PF24161CCDC39431030.1910.2
TkA01G592670PF30378CEP135_TSGA10_CC451005.45.9
TkA01G592670PF05911FPP1734820.01214.6
TkA01G592670PF13863DUF42001742350.4511.6
TkA01G592670PF06810Phage_scaffold1912933.68.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KEW8拟南芥sp|F4KEW8|NET4A_ARATH Protein NETWORKED 4A39.900%Swiss-Prot中等置信
Q84VY2拟南芥sp|Q84VY2|NET4B_ARATH Protein NETWORKED 4B31.100%Swiss-Prot中等置信
F4HZB5拟南芥sp|F4HZB5|NET1D_ARATH Protein NETWORKED 1D68.700%Swiss-Prot低置信
Q9ZQX8拟南芥sp|Q9ZQX8|NET1C_ARATH Protein NETWORKED 1C58.900%Swiss-Prot低置信
Q9LUI2拟南芥sp|Q9LUI2|NET1A_ARATH Protein NETWORKED 1A66.700%Swiss-Prot低置信

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