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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G588310
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 147995788-147996546 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

720 bp · TkA01G588310|TK1151|cDNA

ATGGCGTTTCTCAACCGAAATCCTTCGCTCTGTGTTCTCGTGCTAATCTTCGCATCTCTGGTGTTTCTAACCTCGCCGGTGCATTCTCTCAACTGCTCATCGCAGAAGTTCACCAACAGCAAGCTATACAGCAAGTGCATCGATCTACCAACACTCGGCGCATCGCTCCACTGGACTCACATCGCCGAAAACTCCTCCCTCTCAATCGCATTCATCGCGCCTCCCGCTAAGCCGGACGGATGGATCGCGTGGGCTATTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

720 bp · TkA01G588310|TK1151|CDS

ATGGCGTTTCTCAACCGAAATCCTTCGCTCTGTGTTCTCGTGCTAATCTTCGCATCTCTGGTGTTTCTAACCTCGCCGGTGCATTCTCTCAACTGCTCATCGCAGAAGTTCACCAACAGCAAGCTATACAGCAAGTGCATCGATCTACCAACACTCGGCGCATCGCTCCACTGGACTCACATCGCCGAAAACTCCTCCCTCTCAATCGCATTCATCGCGCCTCCCGCTAAGCCGGACGGATGGATCGCGTGGGCTATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

239 aa · TkA01G588310|TK1151|PROTEIN

MAFLNRNPSLCVLVLIFASLVFLTSPVHSLNCSSQKFTNSKLYSKCIDLPTLGASLHWTHIAENSSLSIAFIAPPAKPDGWIAWAINPTQTGMAGSQALVAFKDSNGSMAVKTYNISSYSSIVEGKISLDVSESIAEYSDKSMKIFATVKLPKTMTEVNHVWQVGGLVKGGMPGKHEFLPANLKSMGKLQLPMSENAQSNGTTTVGSPSIAPSTPTNSASRNTVMYALFLLVVSVLILN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G588310
TK1151 IDTkA01G588310
OH-1004 IDLXL04_000785
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)93.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.490 / OH-1004 51.464
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G588310
位置Chr01:147995788-147996546 (+)
描述Similar to ALP1: Protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g25290 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At4g12980 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At3g07390 含一个血红素的细胞色素。
Auxin-responsive genes AIR12 code for a new family of plasma membrane b-type cytochromes specific to flowering plants.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.139170
At5g47530 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At4g17280 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000785 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0030198 extracellular matrix organization 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0000118 histone deacetylase complex 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G07390
ath:AT3G25290
ath:AT3G55350
ath:AT3G63270
ath:AT4G12980
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.778
排名 1 · TkA01G588310 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA01G588310 · TK1151
内质网0.088
排名 3 · TkA01G588310 · TK1151
细胞外0.075
排名 4 · TkA01G588310 · TK1151
溶酶体／液泡0.053
排名 5 · TkA01G588310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19325RNF152_C9-39 aa
PF03351DOMON55-151 aa
PF04526DUF56893-191 aa
PF19325RNF152_C106-132 aa
PF04526DUF568201-223 aa
PF19325RNF152_C223-236 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G588310PF19325RNF152_C9390.1513.2
TkA01G588310PF03351DOMON551510.0004721.1
TkA01G588310PF04526DUF568931912.5e-32112.3
TkA01G588310PF19325RNF152_C1061320.1513.2
TkA01G588310PF04526DUF5682012232.5e-32112.3
TkA01G588310PF19325RNF152_C2232360.1513.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSE7拟南芥sp|Q9LSE7|B561C_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g2529051.900%Swiss-Prot高置信
Q9SV71拟南芥sp|Q9SV71|B561O_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At4g1298048.600%Swiss-Prot中等置信
Q94BT2拟南芥sp|Q94BT2|AIR12_ARATH Auxin-induced in root cultures protein 1248.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FGK4拟南芥sp|Q9FGK4|B561J_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g4753036.800%Swiss-Prot中等置信
Q8VYH6拟南芥sp|Q8VYH6|B651B_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At4g1728034.100%Swiss-Prot中等置信

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