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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G561560
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 141220443-141223243 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1944 bp · TkA01G561560|TK1151|cDNA

TTGGCACTTACCCATGTTTCATATCTTATGAAAGCACGAGACCCTTGTGATATATATACATAAGTTGCATCCCCACAAATAAAATTCCATGAAAAACAAAGGAATTGGTAAGAAAAAGAACAACTAACCATGAGCACCACAATTGACATTTCCAATGAAAATGAAGCTTCTCACACCTTCAACATCAAGAAAACAAAAAGATTCTCTCTTGTTGTTAAAATTTCTTCTCTTATAGAACAACATTGTAAGCAACATACGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1260 bp · TkA01G561560|TK1151|CDS

ATGAGCACCACAATTGACATTTCCAATGAAAATGAAGCTTCTCACACCTTCAACATCAAGAAAACAAAAAGATTCTCTCTTGTTGTTAAAATTTCTTCTCTTATAGAACAACATTGTAAGCAACATACGCAAAAAATTATTCATTGCATCAAGGTAGGAATTGCCTTAGTTTTGGTTTCACTTCTCTACCTCCTTGATCCACTTTTTGAGCAAGTTGGGGAAAACGCAATGTGGGCCATCATGACTGTTGTGGTTGTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

419 aa · TkA01G561560|TK1151|PROTEIN

MSTTIDISNENEASHTFNIKKTKRFSLVVKISSLIEQHCKQHTQKIIHCIKVGIALVLVSLLYLLDPLFEQVGENAMWAIMTVVVVFEFFAGATLSKGFLRGVGTILGGGLGGCLTAVMADDFGKIGNAVVVGVSVFTFGAVATYCRLIPSIKRKYDYGVMIFILTFNLVAVSGLRADKVLELARERLSTIGMGFAVCILTSLLIFPMWASDELHRLTSSNFDKLGCCIEDCMKAYFSVVSEKESVTSMNVGGCKSVLHS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G561560
TK1151 IDTkA01G561560
OH-1004 IDLXL04_018829
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)69.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G561560
位置Chr01:141220443-141223243 (+)
描述Similar to ALMT13: Aluminum-activated malate transporter 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46610 苹果酸转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g46600 苹果酸转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g17970 苹果酸敏感阴离子转运蛋白，可渗透氯离子、硝酸根、硫酸根和苹果酸。
Closing plant stomata requires a homolog of an aluminum-activated malate transporter.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq016
AtALMT12 represents an R-type anion channel required for stomatal movement in Arabidopsis guard cells.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04302.x
At1g08440 苹果酸转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g11680 苹果酸转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018829 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程
GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0008509 monoatomic anion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08440
ath:AT4G17970
ath:AT5G46600
ath:AT5G46610
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.812
排名 1 · TkA01G561560 · TK1151
内质网0.142
排名 2 · TkA01G561560 · TK1151
细胞质0.060
排名 3 · TkA01G561560 · TK1151
溶酶体／液泡0.044
排名 4 · TkA01G561560 · TK1151
细胞核0.033
排名 5 · TkA01G561560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24124YphA17-121 aa
PF11744ALMT40-363 aa
PF04756OST3_OST649-93 aa
PF10337ArAE_2_N50-85 aa
PF29593DUF857054-76 aa
PF13515FUSC_268-200 aa
PF04632FUSC74-225 aa
PF01694Rhomboid99-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G561560PF24124YphA171210.01915.3
TkA01G561560PF11744ALMT403634.5e-118395.9
TkA01G561560PF04756OST3_OST649938.06.5
TkA01G561560PF10337ArAE_2_N50850.410.4
TkA01G561560PF29593DUF857054760.1712.5
TkA01G561560PF13515FUSC_2682003.9e-1143.9
TkA01G561560PF04632FUSC742252.5e-1040.3
TkA01G561560PF01694Rhomboid991713.38.6
TkA01G561560PF10337ArAE_2_N1302130.410.4
TkA01G561560PF04756OST3_OST61521918.06.5
TkA01G561560PF11744ALMT3714114.5e-118395.9
TkA01G561560PF24124YphA3834000.01915.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LS22拟南芥sp|Q9LS22|ALMTE_ARATH Aluminum-activated malate transporter 1442.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LS23拟南芥sp|Q9LS23|ALMTD_ARATH Aluminum-activated malate transporter 1341.800%Swiss-Prot中等置信
O49696拟南芥sp|O49696|ALMTC_ARATH Aluminum-activated malate transporter 1243.100%Swiss-Prot中等置信
Q9SJE8拟南芥sp|Q9SJE8|ALMT2_ARATH Aluminum-activated malate transporter 238.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SRM9拟南芥sp|Q9SRM9|ALMT8_ARATH Aluminum-activated malate transporter 840.000%Swiss-Prot中等置信

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