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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G556040
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 139777290-139781310 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1668 bp · TkA01G556040|TK1151|cDNA

ATGGTCGAAGACGAAGACCCGAAGTTTCAGATCTTAATCTGGCTATTGTATTCTTGTGAAGTTGAAGTAATCGGAGGTGAACATGCGTTTAGGAAGAGGAAGAAGGTCAAAGGTCAACGATTGGAGTTTGACTCCATGGATATAACAGAGATCTCGGATTTTACATGGAAATTGAAGCTCTTGAGGATCGATGCTGAGAAGCTCTCCCGTTCTCATGTTTGGGCTCTACTCCTCGACTGCGGCGCCACCGCCGCTTCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1668 bp · TkA01G556040|TK1151|CDS

ATGGTCGAAGACGAAGACCCGAAGTTTCAGATCTTAATCTGGCTATTGTATTCTTGTGAAGTTGAAGTAATCGGAGGTGAACATGCGTTTAGGAAGAGGAAGAAGGTCAAAGGTCAACGATTGGAGTTTGACTCCATGGATATAACAGAGATCTCGGATTTTACATGGAAATTGAAGCTCTTGAGGATCGATGCTGAGAAGCTCTCCCGTTCTCATGTTTGGGCTCTACTCCTCGACTGCGGCGCCACCGCCGCTTCTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

555 aa · TkA01G556040|TK1151|PROTEIN

MVEDEDPKFQILIWLLYSCEVEVIGGEHAFRKRKKVKGQRLEFDSMDITEISDFTWKLKLLRIDAEKLSRSHVWALLLDCGATAASVIDDRQWVPDTQFISTGTSRNLTQTNLPLRLSTVRSFPLLDNNSRRRKFCYVVPVYRTGKYLVRTTYYYGGVNNQASPPVFDQIVDGTFWSVVNTTEDYANRDASYYEGVFRAGGKSMSVCLASNTYTESDPFISALEFVLLADSLYNSTDFGSFSLRLVARHSFGYNGSNIRY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G556040
TK1151 IDTkA01G556040
OH-1004 IDLXL04_001193
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G556040
位置Chr01:139777290-139781310 (+)
描述Similar to At1g67720: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67720
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g14510 含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g14510。 暂无已核实直接文献
At1g51890 可能的 LRR 受体样蛋白激酶 At1g51890。 暂无已核实直接文献
At1g67720 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g67720。 暂无已核实直接文献
At1g51880 可能的LRR样受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g51880。 暂无已核实直接文献
At1g07550 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g07550。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001193 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05700
ath:AT1G67720
ath:AT2G14510
ath:AT3G21340
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.424
排名 1 · TkA01G556040 · TK1151
细胞膜0.289
排名 2 · TkA01G556040 · TK1151
内质网0.114
排名 3 · TkA01G556040 · TK1151
细胞质0.083
排名 4 · TkA01G556040 · TK1151
溶酶体／液泡0.051
排名 5 · TkA01G556040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_448-61 aa
PF11721Malectin76-149 aa
PF12819Malectin_like78-398 aa
PF11721Malectin297-355 aa
PF08263LRRNT_2409-445 aa
PF12799LRR_4454-493 aa
PF00560LRR_1455-473 aa
PF23598LRR_14455-530 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G556040PF12799LRR_448615.4e-0524.0
TkA01G556040PF11721Malectin761490.001519.3
TkA01G556040PF12819Malectin_like783988.1e-65220.0
TkA01G556040PF11721Malectin2973550.001519.3
TkA01G556040PF08263LRRNT_24094450.0004621.1
TkA01G556040PF12799LRR_44544935.4e-0524.0
TkA01G556040PF00560LRR_14554732.5e-0627.2
TkA01G556040PF23598LRR_144555300.02813.9
TkA01G556040PF13855LRR_84615090.00716.8
TkA01G556040PF00560LRR_14764922.5e-0627.2
TkA01G556040PF13855LRR_84955330.00716.8
TkA01G556040PF00560LRR_14995192.5e-0627.2
TkA01G556040PF12799LRR_44995365.4e-0524.0
TkA01G556040PF00560LRR_15225412.5e-0627.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQR3拟南芥sp|Q9ZQR3|Y2451_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1451030.900%Swiss-Prot中等置信
C0LGG6拟南芥sp|C0LGG6|Y5189_ARATH Probable LRR receptor-like protein kinase At1g5189030.000%Swiss-Prot中等置信
C0LGI2拟南芥sp|C0LGI2|Y1677_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6772030.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FZB1拟南芥sp|Q9FZB1|Y5188_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5188029.500%Swiss-Prot低置信
C0LGD8拟南芥sp|C0LGD8|Y1755_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0755027.600%Swiss-Prot低置信

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