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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G550970
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 138490724-138491924 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

999 bp · TkA01G550970|TK1151|cDNA

ATGCGGCTCTACTACATCCACGGTGGCAACCGTCTCTGGTTGTCATCGTTCCTTGAGACAGCCGGGTGGCCGGTGATCGTTGTGGTCCTCATAATTCTCTACTTCCACCGCCGTGCCACCGGGAAAAACGAAAACAATAAAAGAACAAAGCTAATCTATATGCGCCCAAGATTGTTCTTGGCGGTGGCGTTTATTGGTGTCCTCACAGGTGTTGAAGACTACCTATACGCCTACGGCCTCAGCCGCCTCCTAGTCTCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

999 bp · TkA01G550970|TK1151|CDS

ATGCGGCTCTACTACATCCACGGTGGCAACCGTCTCTGGTTGTCATCGTTCCTTGAGACAGCCGGGTGGCCGGTGATCGTTGTGGTCCTCATAATTCTCTACTTCCACCGCCGTGCCACCGGGAAAAACGAAAACAATAAAAGAACAAAGCTAATCTATATGCGCCCAAGATTGTTCTTGGCGGTGGCGTTTATTGGTGTCCTCACAGGTGTTGAAGACTACCTATACGCCTACGGCCTCAGCCGCCTCCTAGTCTCTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

332 aa · TkA01G550970|TK1151|PROTEIN

MRLYYIHGGNRLWLSSFLETAGWPVIVVVLIILYFHRRATGKNENNKRTKLIYMRPRLFLAVAFIGVLTGVEDYLYAYGLSRLLVSTSALIIASQLGFTALFAFLLVKQKFTAYSINAVVLLTAGAAELALHTNSDRPEGESKRDYFMGFVLTVASAVLYGFVLPLMELTYNKAKQEITYTLVLEIQAVMCLFATIFCTVGLIINNDFKVIPREATEFELGKSEYYIILCVSTIIWQCFFLGAIGVIFCSSSLQSGIIVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G550970
TK1151 IDTkA01G550970
OH-1004 IDLXL04_031136
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.072 / OH-1004 82.620
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G550970
位置Chr01:138490724-138491924 (+)
描述Similar to PUP3: Purine permease 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28230 质子偶联嘌呤转运蛋白介导腺嘌呤和反式玉米素摄取。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
Recycling of pyridoxine (vitamin B6) by PUP1 in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12195
At1g28220 可能参与花粉萌发和花管伸长过程中嘌呤衍生物的运输。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At2g33750 介导腺嘌呤转运。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At1g44750 可能的嘌呤转运蛋白 11。 暂无已核实直接文献
At1g30840 可能的嘌呤转运蛋白4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031136 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006863 purine nucleobase transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005345 purine nucleobase transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015211 purine nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28220
ath:AT1G28230
ath:AT2G33750
ath:AT4G18210
ath:AT4G18220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.408
排名 1 · TkA01G550970 · TK1151
溶酶体／液泡0.266
排名 2 · TkA01G550970 · TK1151
内质网0.184
排名 3 · TkA01G550970 · TK1151
高尔基体0.100
排名 4 · TkA01G550970 · TK1151
细胞质0.086
排名 5 · TkA01G550970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16913PUNUT1-306 aa
PF00892EamA17-127 aa
PF02790COX2_TM25-34 aa
PF11992TgpA_N25-166 aa
PF04142Nuc_sug_transp26-227 aa
PF13687DUF415326-128 aa
PF12084DUF356151-106 aa
PF04087DUF38984-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G550970PF16913PUNUT13061.4e-104350.6
TkA01G550970PF00892EamA171275.3e-0833.9
TkA01G550970PF02790COX2_TM25341.010.3
TkA01G550970PF11992TgpA_N251668.95.9
TkA01G550970PF04142Nuc_sug_transp262270.0002920.8
TkA01G550970PF13687DUF4153261286.46.5
TkA01G550970PF12084DUF3561511060.02315.5
TkA01G550970PF04087DUF389841040.2612.1
TkA01G550970PF13687DUF41531192006.46.5
TkA01G550970PF04087DUF3891301970.2612.1
TkA01G550970PF02790COX2_TM1442001.010.3
TkA01G550970PF00892EamA1482945.3e-0833.9
TkA01G550970PF06966DUF12951502160.004217.3
TkA01G550970PF13687DUF41531542006.46.5
TkA01G550970PF12084DUF35611731980.02315.5
TkA01G550970PF04087DUF3892382660.2612.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FZ96拟南芥sp|Q9FZ96|PUP1_ARATH Purine permease 159.100%Swiss-Prot高置信
Q9FZ95拟南芥sp|Q9FZ95|PUP3_ARATH Purine permease 355.000%Swiss-Prot高置信
Q94GB1拟南芥sp|Q94GB1|PUP2_ARATH Purine permease 249.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LPF6拟南芥sp|Q9LPF6|PUP11_ARATH Probable purine permease 1133.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SY29拟南芥sp|Q9SY29|PUP4_ARATH Probable purine permease 432.000%Swiss-Prot中等置信

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