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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G550320
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 138320769-138324512 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

602 bp · TkA01G550320|TK1151|cDNA

GTATTGCAGATGATTTATAGACCTGATAATGGAGAGATTCTTGGAGTTCATATATTTGGAATGCATGCTGCTGACCTTATTCATGAAGCATCAAATGCTATTGCTTTAGGAACACGTATCCAGGATATTAAATACGCGGTTCATGCCCATCCAACTTTATCCGAAGTGATCGATGAACTATTTAAATCAGCCAAGGTAAGGGGGAAAGTGTCATTAGTTCCTCCTCAACCCACATTCTCTCTCGTTTTACAATGGTTAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1824 bp · TkA01G550320|TK1151|CDS

ATGCAGTCTTCGATCTCTCTTTCACTTTCTTCGGCTTCTCCGATCACTGTCAGATCCGATGGTGGAGCAAACTCCGCCGCCTCCGGCCTCTTCTTCAGCAACACCGCTACGCCTAACCAGCTTCGGTTCTGTGGCCTCAGAAGAGAAGCTTTCTCTGGATGCAAGTCCTCCAACAATGCAGTTATATTCAAACAATTGCGTTCCAAGACTAAGATTTCTGCTGCCTTGTCCACCAACGGAAATTCGGCCAAGGGTTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

607 aa · TkA01G550320|TK1151|PROTEIN

MQSSISLSLSSASPITVRSDGGANSAASGLFFSNTATPNQLRFCGLRREAFSGCKSSNNAVIFKQLRSKTKISAALSTNGNSAKGFDYDLVIIGAGVGGHGAALHAVEKGLKTAIIEGDVVGGTCVNRGCVPSKALLAVSGRMRELQNEHHMKSFGLQVAAAGYDRQGVADHAENLATKIRNNLTNSMKSLGVDILTGVGSVVGPQKVKYGKVGGTETVITAKNIIIATGSVPFVPKGVEVDGKTVITSDHALKLETVPE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G550320
TK1151 IDTkA01G550320
OH-1004 IDLXL04_001264
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G550320
位置Chr01:138320769-138324512 (-)
描述Similar to LPD1: Dihydrolipoyl dehydrogenase 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16950 复合脂酰胺脱氢酶是质体丙酮酸脱氢酶复合物（PDC）的组成部分。 暂无已核实直接文献
At4g16155 复合脂酰胺脱氢酶是质体丙酮酸脱氢酶复合物（PDC）的组成部分。 暂无已核实直接文献
At1g48030 Lipoamide脱氢酶是甘氨酸脱羧酶（GDC）或甘氨酸裂解系统以及α-酮酸脱氢酶复合体的组成部分。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001264 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006086 pyruvate decarboxylation to acetyl-CoA 生物过程
GO:0006103 2-oxoglutarate metabolic process 生物过程
GO:0045333 cellular respiration 生物过程
GO:0046685 response to arsenic-containing substance 生物过程
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16950
ath:AT4G16155
cthr:CTHT_0048590
hma:rrnAC2953
syn:slr1096
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.914
排名 1 · TkA01G550320 · TK1151
线粒体0.124
排名 2 · TkA01G550320 · TK1151
细胞质0.023
排名 3 · TkA01G550320 · TK1151
细胞核0.013
排名 4 · TkA01G550320 · TK1151
细胞膜0.009
排名 5 · TkA01G550320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07138AcMNPV_AC1142-71 aa
PF01946Thi487-129 aa
PF07992Pyr_redox_288-423 aa
PF00890FAD_binding_289-124 aa
PF01134GIDA89-231 aa
PF12831FAD_oxidored89-230 aa
PF01266DAO89-124 aa
PF03486HI0933_like89-118 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G550320PF07138AcMNPV_AC1142710.3111.2
TkA01G550320PF01946Thi4871290.005616.7
TkA01G550320PF07992Pyr_redox_2884238.3e-63213.2
TkA01G550320PF00890FAD_binding_2891241.8e-0731.4
TkA01G550320PF01134GIDA892314.4e-0730.0
TkA01G550320PF12831FAD_oxidored892304.7e-0626.9
TkA01G550320PF01266DAO891240.2111.8
TkA01G550320PF03486HI0933_like891180.5710.3
TkA01G550320PF00070Pyr_redox901178.1e-1968.6
TkA01G550320PF13738Pyr_redox_3911230.001518.6
TkA01G550320PF027373HCDH_N911180.05914.0
TkA01G550320PF13450NAD_binding_8921250.2112.6
TkA01G550320PF01266DAO1582350.2111.8
TkA01G550320PF03486HI0933_like1762460.5710.3
TkA01G550320PF00070Pyr_redox1781988.1e-1968.6
TkA01G550320PF02852Pyr_redox_dim2082763e-33115.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A8MS68拟南芥sp|A8MS68|PLPD1_ARATH Dihydrolipoyl dehydrogenase 1, chloroplastic84.800%Swiss-Prot高置信
F4JLP5拟南芥sp|F4JLP5|PLPD2_ARATH Dihydrolipoyl dehydrogenase 2, chloroplastic82.700%Swiss-Prot高置信
Q9M5K3拟南芥sp|Q9M5K3|DLDH1_ARATH Dihydrolipoyl dehydrogenase 1, mitochondrial35.200%Swiss-Prot中等置信

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