TkA01G546070 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G546070

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137105840-137108459 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2230 bp · TkA01G546070|TK1151|cDNA

GTCCTTCTTCCTTCCTCCATCGATCTCCATAGCCAAGCATTTCAAGCTCCTTAACCTAATCAACCCAAACCTCACCTCTGCATTCTTCCACTACCAAAACCCCCAAATTTATTACTTACATGCTAACCTCCTGATTCTGCTTTTCGATCTAACGTTGCGGTGATGGCTCTCGCCTGATTTTAGGGGTTTTCATAGTTCTTCTTCCCTTCACTCCGCGGTAACTACTGTTTCTGTATTATTTTATTTCTAGTAGTTTGCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1647 bp · TkA01G546070|TK1151|CDS

ATGGAAGGGAAGCTGATCAATTCAGCAGGAATTTTGCTTTTTTCTGCTTGCTTCCTGCTTCAATTTGCAAGTCTGAACGCGGTTTCAAATGATTCCTTTCTCATCACATCTTCTCGTAATGAAAGCCACATAGAAGTATGCCCTCCTGGTTGGGTGAAGGGACCAAGCAAATCAAAATGTTATAAACACATTGAAAGCTCTTCATCATGGAACGAGTCAGAAAACATCTGCAGAAGTTACCATGGCCACCTGGCAGCATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

548 aa · TkA01G546070|TK1151|PROTEIN

MEGKLINSAGILLFSACFLLQFASLNAVSNDSFLITSSRNESHIEVCPPGWVKGPSKSKCYKHIESSSSWNESENICRSYHGHLAAFTSLPELTFSQNLCNDCWVGGRSIGNGNPWMWSDKTYTWNQTLLTVLTPDLKSTCTNSSCIYPANSASMCTTLTNRTTSLIANKCNISRSSLCMLVTDNRCQHMHCHKEYLIILAIVSGLILFTTFAVVIWLLVYKRSKRRRKSRKLSNPAELALVPPSWKVFTREELRSITKN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G546070`
TK1151 ID	TkA01G546070
OH-1004 ID	LXL04_001338
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 82.406 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G546070

位置 Chr01:137105840-137108459 (-)

描述 Similar to At1g52310: C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g52310`	C型凝集素受体样酪氨酸蛋白激酶At1g52310。	暂无已核实直接文献
`At2g30730`	类受体胞质激酶（RLCK），通过磷酸化并激活ABA受体以支持其单体化并增强其ABA结合亲和力，从而在脱水响应中触发脱落酸（ABA）信号；反过来，它们抑制作为ABA反应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶（按相似性）。	Catalytically inactive subgroup VIII receptor-like cytoplasmic kinases regulate the immune-triggered oxidative burst in Arabidopsis thaliana.2025 · DOI: 10.1093/jxb/erae486
`At5g02800`	参与正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导和植物生长的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At3g15890`	PTI1样酪氨酸蛋白激酶 At3g15890。	暂无已核实直接文献
`At3g02810`	参与花粉管引导进入珠孔。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001338 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G52310

ath:AT3G02810

ath:AT3G15890

ath:AT5G02800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.865

排名 1 · TkA01G546070 · TK1151

细胞质0.084

排名 2 · TkA01G546070 · TK1151

内质网0.076

排名 3 · TkA01G546070 · TK1151

细胞核0.052

排名 4 · TkA01G546070 · TK1151

溶酶体／液泡0.024

排名 5 · TkA01G546070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00059Lectin_C67-180 aa

PF00558Vpu199-235 aa

PF06667PspB202-235 aa

PF00069Pkinase265-541 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr266-543 aa

PF01636APH292-345 aa

PF01636APH364-399 aa

PF00504Chloroa_b-bind409-444 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G546070	`PF00059`	Lectin_C	67	180	1.7e-07	32.7
TkA01G546070	`PF00558`	Vpu	199	235	0.0052	17.3
TkA01G546070	`PF06667`	PspB	202	235	0.053	14.3
TkA01G546070	`PF00069`	Pkinase	265	541	2e-34	119.9
TkA01G546070	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	266	543	1.8e-38	133.1
TkA01G546070	`PF01636`	APH	292	345	0.051	14.0
TkA01G546070	`PF01636`	APH	364	399	0.051	14.0
TkA01G546070	`PF00504`	Chloroa_b-bind	409	444	0.22	12.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C823`	拟南芥	sp\|Q9C823\|Y1523_ARATH C-type lectin receptor-like tyrosine-protein kinase At1g52310	62.100%	Swiss-Prot	高置信
`O49338`	拟南芥	sp\|O49338\|CARK9_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 9	37.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q0WRY5`	拟南芥	sp\|Q0WRY5\|PBL7_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL7	39.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LSC2`	拟南芥	sp\|Q9LSC2\|Y3589_ARATH PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890	38.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9M8S2`	拟南芥	sp\|Q9M8S2\|LIPG2_ARATH Receptor-like kinase LIP2	40.700%	Swiss-Prot	中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情