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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G533980
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 134023077-134025516 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1966 bp · TkA01G533980|TK1151|cDNA

GATGAATCTCAGGTTCCTTTTGTAGCTTCGTTTTGAACTTCGGAAACTCGATTCTTGCTTTTCCAACACTTTGATTGCCGAGTTTCTTGTACGATTAAAGGAAACCTTGAGACTTATTACATACCATGACAGACTTAAAGAGAATGGATGTTCATGAAGCACTAGACAAAGCTAGAGCAGAAAATGAGAGTCTCAAGGAAGAAATTCGTACCAAAACAGATCTCTACAACAACTTAAGAAAATCTCAAATCGAATTGGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1719 bp · TkA01G533980|TK1151|CDS

ATGACAGACTTAAAGAGAATGGATGTTCATGAAGCACTAGACAAAGCTAGAGCAGAAAATGAGAGTCTCAAGGAAGAAATTCGTACCAAAACAGATCTCTACAACAACTTAAGAAAATCTCAAATCGAATTGGTAACTAAGTTTCAAGAATCAAAACTGCAATCTGAAAAACAAGCCCTAGAACTCAATTCAAAGTCCGAGGAGATGATAAACAAACTGGAAGAGAAGCTTAGAGACACTGAAGATCAACTCAAGTGGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

572 aa · TkA01G533980|TK1151|PROTEIN

MTDLKRMDVHEALDKARAENESLKEEIRTKTDLYNNLRKSQIELVTKFQESKLQSEKQALELNSKSEEMINKLEEKLRDTEDQLKWKNEQFQHLEEAHERLQVSFQSHKTEWEKEKSLLLEEISSIQSSLDSQIRMSESLQTQLKICNQALAHEESTRKLLEVEVSEYKSRFDNIFLECNEAKLTIEKLTHKRDEEVAELRDTLSTKDSLSKEMGYKITHLEQENQDLTASLKEFQESLIVKCGPTNSLKKLQKRYQDLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G533980
TK1151 IDTkA01G533980
OH-1004 IDLXL04_014008
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)33.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 27.273 / OH-1004 24.566
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G533980
位置Chr01:134023077-134025516 (+)
描述Similar to At4g38062: Uncharacterized protein At4g38062
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38062 未表征蛋白 At4g38062。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014008 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G38062
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.598
排名 1 · TkA01G533980 · TK1151
细胞核0.221
排名 2 · TkA01G533980 · TK1151
高尔基体0.173
排名 3 · TkA01G533980 · TK1151
内质网0.058
排名 4 · TkA01G533980 · TK1151
细胞膜0.056
排名 5 · TkA01G533980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19220Rod_CreS11-167 aa
PF24161CCDC3913-54 aa
PF30964At4g38062_N19-70 aa
PF30966At4g38062_C36-153 aa
PF24161CCDC3958-116 aa
PF30964At4g38062_N67-310 aa
PF24161CCDC39113-195 aa
PF30966At4g38062_C120-328 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G533980PF19220Rod_CreS111670.4110.5
TkA01G533980PF24161CCDC3913540.002416.5
TkA01G533980PF30964At4g38062_N19701.3e-104351.0
TkA01G533980PF30966At4g38062_C361532e-2280.5
TkA01G533980PF24161CCDC39581160.002416.5
TkA01G533980PF30964At4g38062_N673101.3e-104351.0
TkA01G533980PF24161CCDC391131950.002416.5
TkA01G533980PF30966At4g38062_C1203282e-2280.5
TkA01G533980PF19220Rod_CreS1492380.4110.5
TkA01G533980PF12053Par3_HAL_N_term1751930.0003621.4
TkA01G533980PF24161CCDC391993220.002416.5
TkA01G533980PF19220Rod_CreS2484510.4110.5
TkA01G533980PF30966At4g38062_C2655702e-2280.5
TkA01G533980PF24161CCDC393264420.002416.5
TkA01G533980PF30964At4g38062_N3324941.3e-104351.0
TkA01G533980PF12053Par3_HAL_N_term4194700.0003621.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0CB23拟南芥sp|P0CB23|Y4862_ARATH Uncharacterized protein At4g3806250.000%Swiss-Prot低置信

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