TkA01G528730 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G528730

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 132720632-132724167 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1504 bp · TkA01G528730|TK1151|cDNA

ATCTATTCCAATGCGAAAAATGGATATATCGGTTGAAGAATACATAAGCAATCATACTTCACAAGAAGTAGTTGTTGGTAAATCCAACAACCATATAATCTGACGCGACTTGTCCACTTCTCATTCACTCGTCGATTGCTATGGCGTCATCGGTTCTACGAGCGTTGATATTGGTGATCGCGTTATCGCTTTTCATCTCTTCCGCTGAGTGTTTAACTGGAGACTCGATCATCGAACATAGCCAGTCAGTAGATGGTGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1224 bp · TkA01G528730|TK1151|CDS

ATGGCGTCATCGGTTCTACGAGCGTTGATATTGGTGATCGCGTTATCGCTTTTCATCTCTTCCGCTGAGTGTTTAACTGGAGACTCGATCATCGAACATAGCCAGTCAGTAGATGGTGGCTTGTGTTTCAATCTCATCCGACCTTGTGGTTATAATTGCTTAGAACACACGGCTCAAACAAACGATGGGTTCCTGTTAGGGCTTCAACGCGTGTCATCAGGCATTCTTAATTTGGAAATTCAAACCTCACCTCCAGTTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

407 aa · TkA01G528730|TK1151|PROTEIN

MASSVLRALILVIALSLFISSAECLTGDSIIEHSQSVDGGLCFNLIRPCGYNCLEHTAQTNDGFLLGLQRVSSGILNLEIQTSPPVLLLHGLFMGGDAWFMNSPNQSLGFILADRGFDVWVGNVRGTKWSHGHQSLSEGDKEFWDWSWEEMALYDLETMLSYINSKTSSKVFVVGHSQGTIMSLAAFTEPNVVNMVEAAALLSPISYLDHITSKFVLNLVHMYLDEALGLLGMHQLNLKSDILINMIESACDNGNLDCSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G528730`
TK1151 ID	TkA01G528730
OH-1004 ID	LXL04_001519
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G528730

位置 Chr01:132720632-132724167 (+)

描述 Similar to LIP1: Triacylglycerol lipase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g15230`	三酰甘油脂肪酶对三油酸甘油酯、三辛酸甘油酯、三丁酸甘油酯和 1,3-二油酸甘油酯有活性，但对磷酸脂和半乳糖脂没有活性。	Identification and characterization of a triacylglycerol lipase in Arabidopsis homologous to mammalian acid lipases.2005 · DOI: 10.1016/j.febslet.2005.09.072
`At5g14180`	三酰甘油（TAG）脂肪酶。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001519 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002213 defense response to insect 生物过程

GO:0006108 malate metabolic process 生物过程

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0009739 response to gibberellin 生物过程

GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程

GO:2000033 regulation of seed dormancy process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005615 extracellular space 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G15230

ath:AT5G14180

cel:CELE_F54F3.3

maua:101824484

rno:50682

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.555

排名 1 · TkA01G528730 · TK1151

细胞外0.202

排名 2 · TkA01G528730 · TK1151

细胞质0.120

排名 3 · TkA01G528730 · TK1151

内质网0.109

排名 4 · TkA01G528730 · TK1151

细胞膜0.079

排名 5 · TkA01G528730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04083Abhydro_lipase45-102 aa

PF00561Abhydrolase_184-380 aa

PF02230Abhydrolase_284-100 aa

PF07819PGAP185-95 aa

PF12697Abhydrolase_686-204 aa

PF12146Hydrolase_4108-220 aa

PF00326Peptidase_S9111-192 aa

PF05990DUF900153-189 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G528730	`PF04083`	Abhydro_lipase	45	102	2.5e-14	53.3
TkA01G528730	`PF00561`	Abhydrolase_1	84	380	4.6e-14	53.4
TkA01G528730	`PF02230`	Abhydrolase_2	84	100	0.021	15.4
TkA01G528730	`PF07819`	PGAP1	85	95	0.01	16.3
TkA01G528730	`PF12697`	Abhydrolase_6	86	204	8.6e-06	27.2
TkA01G528730	`PF12146`	Hydrolase_4	108	220	1.3e-06	28.6
TkA01G528730	`PF00326`	Peptidase_S9	111	192	0.13	12.4
TkA01G528730	`PF05990`	DUF900	153	189	0.18	11.9
TkA01G528730	`PF06821`	Ser_hydrolase	159	207	0.22	12.1
TkA01G528730	`PF07819`	PGAP1	164	208	0.01	16.3
TkA01G528730	`PF02230`	Abhydrolase_2	166	226	0.021	15.4
TkA01G528730	`PF24322`	Tle3	166	187	0.11	12.7
TkA01G528730	`PF02230`	Abhydrolase_2	329	360	0.021	15.4
TkA01G528730	`PF12697`	Abhydrolase_6	333	379	8.6e-06	27.2
TkA01G528730	`PF12146`	Hydrolase_4	335	365	1.3e-06	28.6
TkA01G528730	`PF00326`	Peptidase_S9	358	399	0.13	12.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q71DJ5`	拟南芥	sp\|Q71DJ5\|LIP1_ARATH Triacylglycerol lipase 1	61.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q67ZU1`	拟南芥	sp\|Q67ZU1\|LIP2_ARATH Triacylglycerol lipase 2	38.700%	Swiss-Prot	中等置信

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