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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G516300
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 129426780-129429912 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2450 bp · TkA01G516300|TK1151|cDNA

TGGCAGTTAGCACTATAGTACATGTGAACTTGCTTTATTATACGCATTATTTTATAAATCCCAAGGTGCAGCACAAGCCACACGCCACACTCCACCTGGACTCACCGTCGTCAGCCGTAGACGGTGGTTATAATAACGTTGCTTCCCCGATTTCCGTTGCTATCACAACAGATGGAACAATCAGCCGAAACGACGAATACAAAATCTTCTATTCTAATAGTAGGAGCAACCGGTAGATTAGGTTTTGAACTCGCCAATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkA01G516300|TK1151|CDS

ATGGAACAATCAGCCGAAACGACGAATACAAAATCTTCTATTCTAATAGTAGGAGCAACCGGTAGATTAGGTTTTGAACTCGCCAATGCTAGCCTCGAAGCATTCCATCCTACGTTTTGCCTCGTCAGATCCTCCAGTTTCTTCGACCCCGACAAGTCCCGGAAACTTCAAATTCTGATCGATTCCGGCGCCATTATCCTCGAGGGTTCATTACATGATGAAGAAAGCCTTATCAAAGCGATTAAGCAAGTGAAAGTAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

311 aa · TkA01G516300|TK1151|PROTEIN

MEQSAETTNTKSSILIVGATGRLGFELANASLEAFHPTFCLVRSSSFFDPDKSRKLQILIDSGAIILEGSLHDEESLIKAIKQVKVVICAVNSKQVLDQKPLISAIKKAGCIERFIPSEFGLDPDKTHISDMDQGFYSRKSEIRRLVEAQGIPYTLISCNFFMSYLLPSLVQPGLKTPPRDKITIFGNGNVKGVFMKERDVAKFTITSIEDPRTLNKVLYLRPQGNMYSMNELAEIWEGKIGKKLEKIYVSEEDLLKKIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G516300
TK1151 IDTkA01G516300
OH-1004 IDLXL04_017488
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)47.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.498 / OH-1004 97.727
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G516300
位置Chr01:129426780-129429912 (-)
描述Similar to TP7: Phenylcoumaran benzylic ether reductase TP7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34540 可能的还原酶，可能参与将落叶松木脂素还原为去氧落叶松木脂素。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017488 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009699 phenylpropanoid biosynthetic process 生物过程
GO:0009807 lignan biosynthetic process 生物过程
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0032442 phenylcoumaran benzylic ether reductase activity 分子功能
GO:0050664 oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, oxygen as acceptor 分子功能
KEGG 基因交叉引用
nta:107822129
pop:7464022
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.817
排名 1 · TkA01G516300 · TK1151
细胞核0.226
排名 2 · TkA01G516300 · TK1151
内质网0.069
排名 3 · TkA01G516300 · TK1151
过氧化物酶体0.046
排名 4 · TkA01G516300 · TK1151
细胞膜0.043
排名 5 · TkA01G516300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05368NmrA10-307 aa
PF23441SDR11-84 aa
PF01370Epimerase14-90 aa
PF01118Semialdhyde_dh14-95 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd15-86 aa
PF13460NAD_binding_1018-212 aa
PF19400DUF597549-91 aa
PF01370Epimerase163-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G516300PF05368NmrA103077e-74249.8
TkA01G516300PF23441SDR11840.04213.9
TkA01G516300PF01370Epimerase14902.6e-0524.5
TkA01G516300PF01118Semialdhyde_dh14950.1513.2
TkA01G516300PF16363GDP_Man_Dehyd15860.03514.3
TkA01G516300PF13460NAD_binding_10182123.5e-1144.0
TkA01G516300PF19400DUF597549910.1812.6
TkA01G516300PF01370Epimerase1632142.6e-0524.5
TkA01G516300PF16363GDP_Man_Dehyd1832510.03514.3
TkA01G516300PF19400DUF59752212510.1812.6
TkA01G516300PF23441SDR2402770.04213.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65679拟南芥sp|O65679|PILR3_ARATH Probable pinoresinol-lariciresinol reductase 359.700%Swiss-Prot高置信

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